120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6266 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_6266  peptidase S15  100 
 
 
465 aa  958    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0476291  normal  0.558827 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2478  hypothetical protein  34.83 
 
 
442 aa  251  2e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.991617 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1592  peptidase S15  34.23 
 
 
580 aa  230  5e-59  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00000232254  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0963  alpha/beta hydrolase fold protein  33.83 
 
 
374 aa  213  5.999999999999999e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0623938  hitchhiker  0.00346396 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2249  peptidase S15  32.72 
 
 
474 aa  191  2.9999999999999997e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000310265  normal  0.111012 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6145  peptidase S15  32.77 
 
 
380 aa  177  3e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000966122  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1948  putative lipoprotein  26.92 
 
 
473 aa  150  5e-35  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4484  BAAT/Acyl-CoA thioester hydrolase  27.65 
 
 
477 aa  91.7  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.061544  normal  0.0537303 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3325  hypothetical protein  27.78 
 
 
317 aa  90.9  4e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3018  hypothetical protein  27.27 
 
 
338 aa  89  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.277726  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0162  alpha/beta hydrolase fold  25.96 
 
 
321 aa  88.6  2e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00601319 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3348  hypothetical protein  24.32 
 
 
339 aa  87.8  4e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.077916  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3346  hypothetical protein  27.67 
 
 
320 aa  87.8  4e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3126  hypothetical protein  27.27 
 
 
342 aa  87  7e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3372  hypothetical protein  27.27 
 
 
341 aa  87  7e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3112  hypothetical protein  26.88 
 
 
337 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.200391  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3343  hypothetical protein  26.59 
 
 
337 aa  84.3  0.000000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.975652  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0501  hypothetical protein  25.63 
 
 
436 aa  83.2  0.000000000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.672777  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04770  alpha/beta hydrolase fold protein  22.15 
 
 
424 aa  80.5  0.00000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000317728  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1906  hypothetical protein  26.18 
 
 
434 aa  79.7  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.189773  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1187  dienelactone hydrolase  25.53 
 
 
333 aa  75.5  0.000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3539  alpha/beta hydrolase fold protein  26.88 
 
 
309 aa  69.7  0.00000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.173848 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4544  hypothetical protein  26.49 
 
 
490 aa  69.7  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0186679  normal  0.180104 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1717  alpha/beta hydrolase fold  25.6 
 
 
315 aa  68.6  0.0000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0691  hypothetical protein  24.85 
 
 
319 aa  68.2  0.0000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1721  Alpha/beta hydrolase fold  22.26 
 
 
317 aa  66.6  0.0000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1501  Alpha/beta hydrolase  24.61 
 
 
302 aa  66.6  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.568195  normal  0.537602 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0798  hydrolase, putative  36.04 
 
 
246 aa  65.9  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.905028 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1620  hypothetical protein  26.3 
 
 
309 aa  65.5  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1040  dienelactone hydrolase  26.33 
 
 
333 aa  63.9  0.000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2168  hypothetical protein  23.94 
 
 
498 aa  63.2  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.79256  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1315  alpha/beta hydrolase fold  23.63 
 
 
320 aa  62.4  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0924774  normal 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0031  alpha/beta fold family hydrolase  23.69 
 
 
286 aa  62  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0081  hydrolase, alpha/beta fold family  23.69 
 
 
286 aa  62  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.221816  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07480  hypothetical protein  23.97 
 
 
308 aa  62  0.00000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0100804  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3161  putative hydrolase  24.38 
 
 
512 aa  60.5  0.00000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5342  hypothetical protein  24.87 
 
 
423 aa  60.5  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.764052  normal  0.588325 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2905  putative hydrolase  23.64 
 
 
512 aa  60.5  0.00000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.212149  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1578  dienelactone hydrolase  30.97 
 
 
255 aa  60.1  0.00000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2079  putative hydrolase  24.07 
 
 
512 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1279  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  30.43 
 
 
261 aa  58.2  0.0000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000359236  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1881  lysophospholipase-like protein  24.54 
 
 
330 aa  57.4  0.0000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.27985  normal  0.592044 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0457  Lysophospholipase-like protein  32.99 
 
 
274 aa  57.4  0.0000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3820  PGAP1 family protein  22.47 
 
 
485 aa  57  0.0000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.233276  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2237  hypothetical protein  31.39 
 
 
269 aa  57  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.166589  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6453  hypothetical protein  23.02 
 
 
496 aa  56.2  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.73648  normal  0.0509113 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1262  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 
319 aa  56.2  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2298  alpha/beta hydrolase fold protein  23.08 
 
 
322 aa  55.5  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.321032  decreased coverage  0.000193345 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2582  peptidase S15  28.89 
 
 
258 aa  55.5  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6540  alpha/beta hydrolase fold  23.97 
 
 
302 aa  55.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.300513  normal  0.534481 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0877  hypothetical protein  20.94 
 
 
316 aa  54.7  0.000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000690525  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3021  peptidase S15  27.78 
 
 
292 aa  53.5  0.000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1437  alpha/beta hydrolase fold  21.79 
 
 
320 aa  53.1  0.000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.872938  normal  0.0432694 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1829  alpha/beta fold family hydrolase  20.83 
 
 
319 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.174462  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0096  hydrolase  23.53 
 
 
517 aa  53.1  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3881  alpha/beta hydrolase fold  20.83 
 
 
320 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00418628  normal  0.248118 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0601  dienelactone hydrolase  28.46 
 
 
259 aa  53.1  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1232  alpha/beta fold family hydrolase  19.56 
 
 
305 aa  52.8  0.00001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42770  hypothetical protein  20.37 
 
 
327 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1475  hydrolase family protein  24.89 
 
 
335 aa  52  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0234  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 
256 aa  51.6  0.00003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.104073 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1150  dienelactone hydrolase  25.9 
 
 
254 aa  51.6  0.00003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2741  hypothetical protein  23.36 
 
 
498 aa  50.8  0.00005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12698  hypothetical protein  32.14 
 
 
405 aa  50.4  0.00006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0583  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  21.96 
 
 
412 aa  50.4  0.00007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0597  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  21.96 
 
 
412 aa  50.4  0.00007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.458805  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0299  hypothetical protein  34.55 
 
 
307 aa  50.1  0.00009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.261674 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23740  hydrolase, alpha/beta fold family  23.49 
 
 
317 aa  49.3  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.582768  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2349  peptidase S15  28.93 
 
 
690 aa  48.9  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1500  peptidase S15  28.07 
 
 
678 aa  48.1  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3307  alpha/beta fold family hydrolase  25.12 
 
 
300 aa  47.4  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1407  alpha/beta hydrolase fold  20.38 
 
 
320 aa  47.4  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0821941  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1313  peptidase S15  32.43 
 
 
294 aa  47.8  0.0005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3592  hypothetical protein  28.89 
 
 
323 aa  47.4  0.0006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.712485  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3190  alpha/beta hydrolase family protein  37.8 
 
 
201 aa  47  0.0007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0486  Pectinesterase  27.74 
 
 
644 aa  47  0.0007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.536234  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2376  putative redox protein  32.14 
 
 
259 aa  47  0.0008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5497  putative hydrolase  22.3 
 
 
460 aa  46.6  0.0009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal  0.134483 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1723  peptidase S15  27.27 
 
 
677 aa  46.6  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.463427  normal  0.841285 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0541  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  26.85 
 
 
518 aa  46.2  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.429802  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2450  hypothetical protein  30.95 
 
 
258 aa  45.1  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3783  hypothetical protein  21.07 
 
 
354 aa  45.4  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3098  alpha/beta fold family hydrolase  25.12 
 
 
300 aa  45.4  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.833481  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3084  3-oxoadipate enol-lactonase  25.12 
 
 
300 aa  45.8  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0473381  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0226  hypothetical protein  30.59 
 
 
257 aa  45.4  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1852  hypothetical protein  24.31 
 
 
343 aa  45.8  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.613868  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3343  alpha/beta fold family hydrolase  25.12 
 
 
300 aa  45.4  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0128  esterase/lipase/thioesterase family protein  29.33 
 
 
304 aa  45.4  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4246  dipeptidyl aminopeptidases/acylaminoacyl-peptidases-like  32.04 
 
 
316 aa  45.4  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.760723  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2263  alpha/beta hydrolase  30.33 
 
 
315 aa  45.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.469721 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1942  peptidase S15  22.7 
 
 
670 aa  45.1  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1929  3-Oxoadipate enol-lactonase  24.64 
 
 
300 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.878211  normal  0.500669 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3394  hypothetical protein  28.41 
 
 
251 aa  45.1  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.689408  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2995  3-oxoadipate enol-lactonase  25.12 
 
 
300 aa  45.1  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000386793  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1715  dienelactone hydrolase  27.74 
 
 
307 aa  44.7  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.352882  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1693  putative signal peptide protein  31.36 
 
 
305 aa  44.7  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1053  alpha/beta hydrolase fold protein  32.82 
 
 
285 aa  45.1  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1999  Dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase -like protein  33.82 
 
 
424 aa  45.1  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0236781  hitchhiker  0.00479184 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3313  3-Oxoadipate enol-lactonase  25.12 
 
 
300 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3320  hydrolase, alpha/beta fold family  25.12 
 
 
300 aa  45.1  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>