58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6453 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_6453  hypothetical protein  100 
 
 
496 aa  971    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.73648  normal  0.0509113 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2168  hypothetical protein  63.65 
 
 
498 aa  623  1e-177  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.79256  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1753  dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase  34.34 
 
 
453 aa  199  1.0000000000000001e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.45323  normal  0.582336 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2202  dienelactone hydrolase  32.43 
 
 
528 aa  191  2.9999999999999997e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.413126  decreased coverage  0.0031404 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2184  hypothetical protein  35.92 
 
 
519 aa  177  3e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.471753  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4544  hypothetical protein  38.93 
 
 
490 aa  166  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0186679  normal  0.180104 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1773  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase  31.58 
 
 
533 aa  151  2e-35  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0117  esterase/lipase  27.73 
 
 
570 aa  98.6  2e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2478  hypothetical protein  27.62 
 
 
442 aa  95.9  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.991617 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1592  peptidase S15  28.43 
 
 
580 aa  84  0.000000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00000232254  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0963  alpha/beta hydrolase fold protein  24.28 
 
 
374 aa  73.6  0.000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0623938  hitchhiker  0.00346396 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2249  peptidase S15  27.6 
 
 
474 aa  64.7  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000310265  normal  0.111012 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3018  hypothetical protein  22.64 
 
 
338 aa  58.2  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.277726  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07480  hypothetical protein  22.74 
 
 
308 aa  57.8  0.0000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0100804  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3372  hypothetical protein  22.97 
 
 
341 aa  57.8  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3126  hypothetical protein  22.97 
 
 
342 aa  57.4  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4484  BAAT/Acyl-CoA thioester hydrolase  23.78 
 
 
477 aa  57.4  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.061544  normal  0.0537303 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0601  dienelactone hydrolase  27.39 
 
 
259 aa  57  0.0000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3112  hypothetical protein  22.66 
 
 
337 aa  56.2  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.200391  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6266  peptidase S15  22.9 
 
 
465 aa  56.2  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0476291  normal  0.558827 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3348  hypothetical protein  22.64 
 
 
339 aa  56.6  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.077916  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1475  hydrolase family protein  25.46 
 
 
335 aa  55.8  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3325  hypothetical protein  23.33 
 
 
317 aa  53.1  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3343  hypothetical protein  22.3 
 
 
337 aa  52  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.975652  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3346  hypothetical protein  21.85 
 
 
320 aa  52  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6145  peptidase S15  29.53 
 
 
380 aa  52  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000966122  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1433  exported protein precursor  26.22 
 
 
326 aa  51.2  0.00004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2905  putative hydrolase  27.44 
 
 
512 aa  50.1  0.00009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.212149  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3783  hypothetical protein  25.45 
 
 
354 aa  49.7  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3161  putative hydrolase  27.78 
 
 
512 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2079  putative hydrolase  26.14 
 
 
512 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0890  protein of unknown function DUF1100, hydrolase family protein  26.07 
 
 
357 aa  50.1  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.712139  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5497  putative hydrolase  23.85 
 
 
460 aa  50.1  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal  0.134483 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0583  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  30.77 
 
 
412 aa  49.3  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0089  carboxymethylenebutenolidase  26.1 
 
 
244 aa  48.9  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0597  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  30.77 
 
 
412 aa  49.3  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.458805  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1419  hypothetical protein  24.4 
 
 
328 aa  48.1  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.692935  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2741  hypothetical protein  25.61 
 
 
498 aa  48.5  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04770  alpha/beta hydrolase fold protein  22.11 
 
 
424 aa  48.5  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000317728  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2030  hypothetical protein  24.48 
 
 
328 aa  48.1  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.258009 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1620  hypothetical protein  26.96 
 
 
309 aa  48.1  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0096  hydrolase  28.4 
 
 
517 aa  48.5  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1262  alpha/beta hydrolase fold  24.17 
 
 
319 aa  48.1  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0501  hypothetical protein  29.19 
 
 
436 aa  47.8  0.0005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.672777  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1417  peptidase S15  29.84 
 
 
321 aa  47  0.0007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0545  esterase/lipase  27.14 
 
 
311 aa  47  0.0008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4476  protein of unknown function DUF1100, hydrolase family protein  27.02 
 
 
376 aa  47  0.0009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7673  hypothetical protein  30.17 
 
 
339 aa  46.2  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.310419 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1306  hypothetical protein  25.38 
 
 
280 aa  46.2  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3085  peptidase S15  27.24 
 
 
287 aa  46.2  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.918573  normal  0.256492 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2710  hypothetical protein  30.71 
 
 
367 aa  45.4  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000170279  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1004  prolyl oligopeptidase family protein  24.82 
 
 
759 aa  45.1  0.003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6185  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  24.28 
 
 
733 aa  44.7  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3865  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  26.3 
 
 
741 aa  44.3  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1886  hypothetical protein  27.27 
 
 
326 aa  44.3  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0063  phospholipase/carboxylesterase  31.62 
 
 
227 aa  43.9  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.982882  normal  0.670301 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3820  PGAP1 family protein  27.59 
 
 
485 aa  43.9  0.008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.233276  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4783  hypothetical protein  31.47 
 
 
449 aa  43.5  0.01  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.274581 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>