29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4783 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4783  hypothetical protein  100 
 
 		 449 aa  888    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.274581 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0498  hypothetical protein  39.14 
 
 		 426 aa  218  2e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4484  BAAT/Acyl-CoA thioester hydrolase  28.61 
 
 		 477 aa  80.5  0.00000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.061544  normal  0.0537303 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7673  hypothetical protein  42.34 
 
 		 339 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.310419 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2249  peptidase S15  27.52 
 
 		 474 aa  65.1  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000310265  normal  0.111012 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5774  hypothetical protein  35 
 
 		 339 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.471625  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6139  hypothetical protein  35 
 
 		 339 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.728188  normal  0.412726 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4544  hypothetical protein  33.09 
 
 		 490 aa  61.6  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0186679  normal  0.180104 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4242  hypothetical protein  44.71 
 
 		 306 aa  59.3  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00328451 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2168  hypothetical protein  28.79 
 
 		 498 aa  58.9  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.79256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0470  hypothetical protein  45.07 
 
 		 294 aa  58.9  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.739112 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2478  hypothetical protein  24.72 
 
 		 442 aa  54.3  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.991617 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6453  hypothetical protein  31.91 
 
 		 496 aa  54.3  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.73648  normal  0.0509113 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1475  hydrolase family protein  32.86 
 
 		 335 aa  50.8  0.00005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0807  hypothetical protein  38.96 
 
 		 277 aa  50.4  0.00007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.552448  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3671  alpha/beta hydrolase fold  32.28 
 
 		 314 aa  50.1  0.00008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.416177 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0963  alpha/beta hydrolase fold protein  28.37 
 
 		 374 aa  49.7  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0623938  hitchhiker  0.00346396 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4186  putative alpha/beta superfamily hydrolase  35.88 
 
 		 289 aa  47.8  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0367374  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1753  dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase  30.97 
 
 		 453 aa  47.4  0.0006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.45323  normal  0.582336 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1592  peptidase S15  31.94 
 
 		 580 aa  47  0.0007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00000232254  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0358  cinnamoyl ester hydrolase  30.94 
 
 		 281 aa  46.2  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1417  peptidase S15  26.69 
 
 		 321 aa  46.6  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4281  hydrolase family protein  29.38 
 
 		 332 aa  44.7  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.549804  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1373  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  31.15 
 
 		 620 aa  45.1  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0272535 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6145  peptidase S15  22.33 
 
 		 380 aa  44.7  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000966122  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23740  hydrolase, alpha/beta fold family  31.58 
 
 		 317 aa  43.5  0.007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.582768  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8503  putative lipoprotein  32.77 
 
 		 276 aa  43.5  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1773  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase  26.26 
 
 		 533 aa  43.1  0.009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2440  peptidase S15  31.45 
 
 		 298 aa  43.1  0.009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>