49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_5774 on replicon NC_008062
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008544  Bcen2424_6139  hypothetical protein  100 
 
 
339 aa  676    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.728188  normal  0.412726 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5774  hypothetical protein  100 
 
 
339 aa  676    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.471625  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7673  hypothetical protein  86.14 
 
 
339 aa  546  1e-154  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.310419 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1702  hypothetical protein  40.76 
 
 
334 aa  193  3e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.412108  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1475  hydrolase family protein  32.37 
 
 
335 aa  125  8.000000000000001e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4281  hydrolase family protein  35.82 
 
 
332 aa  112  7.000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.549804  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3783  hypothetical protein  34.36 
 
 
354 aa  105  1e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2876  hydrolase family protein  34.67 
 
 
335 aa  101  2e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.720611  normal  0.385258 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4783  hypothetical protein  35 
 
 
449 aa  64.3  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.274581 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3012  alpha/beta hydrolase fold protein  41.44 
 
 
301 aa  63.5  0.000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.015622  hitchhiker  0.00745042 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0963  alpha/beta hydrolase fold protein  22.73 
 
 
374 aa  62.8  0.000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0623938  hitchhiker  0.00346396 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1592  peptidase S15  37.21 
 
 
580 aa  60.1  0.00000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00000232254  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4544  hypothetical protein  29.96 
 
 
490 aa  58.9  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0186679  normal  0.180104 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4484  BAAT/Acyl-CoA thioester hydrolase  36.51 
 
 
477 aa  59.3  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.061544  normal  0.0537303 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5497  putative hydrolase  22.34 
 
 
460 aa  58.9  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal  0.134483 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2249  peptidase S15  29.82 
 
 
474 aa  58.2  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000310265  normal  0.111012 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0162  alpha/beta hydrolase fold  27.91 
 
 
321 aa  57.4  0.0000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00601319 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3539  alpha/beta hydrolase fold protein  43.75 
 
 
309 aa  56.6  0.0000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.173848 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0798  hydrolase, putative  34.35 
 
 
246 aa  51.2  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.905028 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2478  hypothetical protein  30.43 
 
 
442 aa  51.2  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.991617 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0807  hypothetical protein  32.11 
 
 
277 aa  51.6  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.552448  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0601  dienelactone hydrolase  23.66 
 
 
259 aa  50.4  0.00004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0470  hypothetical protein  33.87 
 
 
294 aa  50.4  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.739112 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6453  hypothetical protein  27.92 
 
 
496 aa  49.7  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.73648  normal  0.0509113 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4242  hypothetical protein  42.65 
 
 
306 aa  48.1  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00328451 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1708  hydrolase  21.28 
 
 
460 aa  46.6  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1717  alpha/beta hydrolase fold  23.05 
 
 
315 aa  46.6  0.0006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2237  hypothetical protein  31.2 
 
 
269 aa  45.8  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.166589  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1682  hydrolase  21.28 
 
 
460 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.35711  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1262  alpha/beta hydrolase fold  26 
 
 
319 aa  45.1  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1187  dienelactone hydrolase  23.38 
 
 
333 aa  45.1  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6266  peptidase S15  25 
 
 
465 aa  44.3  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0476291  normal  0.558827 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3215  alpha/beta hydrolase fold protein  27.84 
 
 
289 aa  44.3  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0691  hypothetical protein  25 
 
 
319 aa  43.9  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3592  hypothetical protein  27.27 
 
 
323 aa  43.9  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.712485  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1730  hypothetical protein  20.92 
 
 
362 aa  43.9  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1232  alpha/beta fold family hydrolase  20.74 
 
 
305 aa  43.5  0.005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42770  hypothetical protein  27.47 
 
 
327 aa  43.5  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1866  hypothetical protein  20.92 
 
 
362 aa  43.9  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1904  hypothetical protein  20.92 
 
 
460 aa  43.5  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0994  hypothetical protein  21.67 
 
 
460 aa  43.1  0.006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4052  alpha amylase catalytic region  28.66 
 
 
1196 aa  43.1  0.007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2537  alpha/beta hydrolase fold  36.28 
 
 
273 aa  43.1  0.007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3541  alpha/beta hydrolase fold  27.84 
 
 
289 aa  43.1  0.007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.421179 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3939  alpha amylase catalytic region  28.66 
 
 
1196 aa  43.1  0.007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0498  hypothetical protein  25.61 
 
 
426 aa  42.7  0.008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2214  hypothetical protein  32.56 
 
 
313 aa  42.7  0.009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04770  alpha/beta hydrolase fold protein  23.11 
 
 
424 aa  42.7  0.009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000317728  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1953  hypothetical protein  21.55 
 
 
460 aa  42.7  0.009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>