31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_1702 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_1702  hypothetical protein  100 
 
 		 334 aa  664    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.412108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7673  hypothetical protein  41.08 
 
 		 339 aa  192  5e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.310419 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5774  hypothetical protein  40.56 
 
 		 339 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.471625  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6139  hypothetical protein  40.56 
 
 		 339 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.728188  normal  0.412726 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4281  hydrolase family protein  35.03 
 
 		 332 aa  127  3e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.549804  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3783  hypothetical protein  35.39 
 
 		 354 aa  126  6e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2876  hydrolase family protein  37.45 
 
 		 335 aa  121  1.9999999999999998e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.720611  normal  0.385258 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1475  hydrolase family protein  32.78 
 
 		 335 aa  116  3.9999999999999997e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0963  alpha/beta hydrolase fold protein  25.54 
 
 		 374 aa  81.6  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0623938  hitchhiker  0.00346396 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2478  hypothetical protein  24.33 
 
 		 442 aa  62.4  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.991617 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2249  peptidase S15  30.32 
 
 		 474 aa  62  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000310265  normal  0.111012 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3012  alpha/beta hydrolase fold protein  39 
 
 		 301 aa  59.3  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.015622  hitchhiker  0.00745042 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4484  BAAT/Acyl-CoA thioester hydrolase  26.57 
 
 		 477 aa  55.8  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.061544  normal  0.0537303 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1592  peptidase S15  27.08 
 
 		 580 aa  53.9  0.000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00000232254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4355  Alpha/beta hydrolase fold  25.35 
 
 		 314 aa  52.8  0.000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6540  alpha/beta hydrolase fold  26.92 
 
 		 302 aa  52.8  0.000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.300513  normal  0.534481 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0891  alpha/beta hydrolase fold  30.22 
 
 		 274 aa  50.8  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2790  alpha/beta hydrolase fold protein  24.36 
 
 		 276 aa  49.3  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.067584  normal  0.84932 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2537  alpha/beta hydrolase fold  29.71 
 
 		 273 aa  48.9  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0691  hypothetical protein  26.09 
 
 		 319 aa  48.5  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2799  alpha/beta hydrolase fold  35.29 
 
 		 284 aa  47.4  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.61266  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4544  hypothetical protein  31.34 
 
 		 490 aa  46.2  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0186679  normal  0.180104 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1620  hypothetical protein  25.71 
 
 		 309 aa  46.2  0.0008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1948  putative lipoprotein  32.82 
 
 		 473 aa  45.4  0.001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0600  alpha/beta hydrolase fold protein  21.18 
 
 		 253 aa  45.8  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000132287  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0541  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  23.75 
 
 		 518 aa  45.8  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.429802  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3871  alpha/beta hydrolase fold protein  38.95 
 
 		 313 aa  43.9  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1082  alpha/beta hydrolase fold  25.68 
 
 		 334 aa  43.5  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.449136  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3672  Acylglycerol lipase  22.34 
 
 		 279 aa  42.7  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3522  alpha/beta hydrolase fold  29.65 
 
 		 302 aa  42.7  0.009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.775525 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09450  hypothetical protein  24.84 
 
 		 348 aa  42.7  0.01  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.513646  normal  0.860642 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>