260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1082 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_1082  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
334 aa  669    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.449136  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1033  hypothetical protein  48.58 
 
 
336 aa  271  1e-71  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0782021  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1305  hypothetical protein  48.29 
 
 
341 aa  258  1e-67  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.236465  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1375  lysophospholipase  43.22 
 
 
326 aa  254  2.0000000000000002e-66  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0068  Alpha/beta hydrolase fold  48.58 
 
 
375 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3329  hypothetical protein  47.13 
 
 
343 aa  219  7e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.834886  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1050  alpha/beta hydrolase fold protein  42.01 
 
 
345 aa  213  4.9999999999999996e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.10497  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1493  alpha/beta hydrolase fold  42.51 
 
 
334 aa  204  1e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.21137  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1666  alpha/beta hydrolase fold protein  40.87 
 
 
338 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.993525 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1664  alpha/beta hydrolase fold  41.13 
 
 
341 aa  198  9e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2844  alpha/beta hydrolase fold  38.26 
 
 
369 aa  170  3e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0017  Lysophospholipase-like protein  38.41 
 
 
315 aa  157  3e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.953662  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2079  alpha/beta hydrolase fold  39.69 
 
 
339 aa  148  1.0000000000000001e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0269256  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0518  acylglycerol lipase  28.25 
 
 
277 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.645485  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0150  alpha/beta hydrolase fold  26.79 
 
 
279 aa  95.9  8e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0681813  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2790  alpha/beta hydrolase fold protein  29.96 
 
 
276 aa  92.8  6e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.067584  normal  0.84932 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0140  acylglycerol lipase  28.41 
 
 
279 aa  91.7  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0149  acylglycerol lipase  28.41 
 
 
279 aa  91.7  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.78006  normal  0.636715 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0130  acylglycerol lipase  28.41 
 
 
279 aa  92  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.414511 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2871  alpha/beta fold family hydrolase  29.96 
 
 
303 aa  87.4  3e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.856592  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3674  Acylglycerol lipase  26.74 
 
 
280 aa  84.3  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0415  alpha/beta fold family hydrolase  29.59 
 
 
303 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2981  alpha/beta fold family hydrolase  29.59 
 
 
303 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0935  alpha/beta fold family hydrolase  29.59 
 
 
303 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2559  alpha/beta fold family hydrolase  29.59 
 
 
280 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0214  alpha/beta fold family hydrolase  29.59 
 
 
280 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4455  Alpha/beta hydrolase fold  31.09 
 
 
281 aa  84  0.000000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2932  alpha/beta fold family hydrolase  29.59 
 
 
303 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4171  Alpha/beta hydrolase  28.46 
 
 
306 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.753522 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10184  lysophospholipase  28.35 
 
 
279 aa  82.8  0.000000000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1649  alpha/beta fold family hydrolase  30.51 
 
 
318 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.605923  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1017  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 
302 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0579  alpha/beta hydrolase fold  28.2 
 
 
302 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.483442  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1058  alpha/beta hydrolase fold  28.2 
 
 
302 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2246  alpha/beta hydrolase fold  28.62 
 
 
302 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0367  lysophospholipase-like protein  25 
 
 
313 aa  80.1  0.00000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1433  alpha/beta hydrolase fold  26.27 
 
 
257 aa  79.3  0.00000000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_157  hydrolase, alpha/beta fold family  23.85 
 
 
277 aa  79.3  0.00000000000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.379638  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0934  alpha/beta hydrolase fold  28.09 
 
 
320 aa  79.3  0.00000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1479  alpha/beta hydrolase fold protein  27.41 
 
 
257 aa  79.3  0.00000000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2956  alpha/beta hydrolase fold  27.08 
 
 
277 aa  78.6  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1814  lysophospholipase  23.84 
 
 
310 aa  78.6  0.0000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2799  alpha/beta hydrolase fold  26.56 
 
 
284 aa  78.6  0.0000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.61266  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3672  Acylglycerol lipase  26.24 
 
 
279 aa  78.2  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0402  alpha/beta hydrolase  29.96 
 
 
279 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1494  alpha/beta hydrolase fold  24.34 
 
 
326 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0365671  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3067  alpha/beta hydrolase fold protein  26.21 
 
 
306 aa  77.4  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1387  alpha/beta hydrolase fold  28.24 
 
 
275 aa  77  0.0000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.062595  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0149  alpha/beta fold family hydrolase  23.46 
 
 
277 aa  76.6  0.0000000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0525  alpha/beta hydrolase fold  29.39 
 
 
289 aa  76.6  0.0000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.720757 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0222  acylglycerol lipase  23.85 
 
 
277 aa  76.6  0.0000000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2671  alpha/beta hydrolase fold protein  27.17 
 
 
270 aa  76.3  0.0000000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.661252 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1347  putative lipase  25.79 
 
 
278 aa  76.3  0.0000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2367  alpha/beta hydrolase fold protein  27.82 
 
 
286 aa  75.1  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.368093  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0758  alpha/beta hydrolase fold protein  27.94 
 
 
315 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.539161  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0938  alpha/beta hydrolase fold  28.3 
 
 
320 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0374  Acylglycerol lipase  26.15 
 
 
279 aa  74.3  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6038  alpha/beta hydrolase fold  29.93 
 
 
294 aa  72.8  0.000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21320  hypothetical protein  24.13 
 
 
316 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.964841  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1713  alpha/beta hydrolase fold protein  26.28 
 
 
267 aa  71.2  0.00000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2931  hypothetical protein  29.28 
 
 
316 aa  70.5  0.00000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1823  hypothetical protein  23.08 
 
 
316 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.334434  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4355  Alpha/beta hydrolase fold  25.87 
 
 
314 aa  70.5  0.00000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4367  Acylglycerol lipase  25.09 
 
 
265 aa  70.1  0.00000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.247283 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2528  alpha/beta hydrolase fold protein  27.4 
 
 
327 aa  68.9  0.0000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.757367  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5281  alpha/beta hydrolase fold protein  32.59 
 
 
288 aa  68.6  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1660  lysophospholipase  23.3 
 
 
281 aa  68.9  0.0000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.631285  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3544  alpha/beta hydrolase fold  27.21 
 
 
317 aa  68.9  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.941882  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1409  alpha/beta hydrolase fold protein  24.82 
 
 
278 aa  68.2  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.539385 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4867  alpha/beta hydrolase fold  29.33 
 
 
328 aa  68.2  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.606344 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3691  alpha/beta hydrolase fold protein  24.51 
 
 
278 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3522  alpha/beta hydrolase fold  27.97 
 
 
302 aa  67.8  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.775525 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3478  alpha/beta hydrolase fold protein  31.2 
 
 
291 aa  67.4  0.0000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.786791  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4120  alpha/beta hydrolase fold  31.2 
 
 
291 aa  67  0.0000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.848417  normal  0.810632 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31710  lysophospholipase  25.19 
 
 
274 aa  67  0.0000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1698  alpha/beta hydrolase fold protein  29.47 
 
 
559 aa  64.7  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90406  hitchhiker  0.0000305694 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4869  hypothetical protein  24.72 
 
 
267 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0994  putative hydrolase  27.76 
 
 
301 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3430  alpha/beta hydrolase fold  22.99 
 
 
267 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4058  alpha/beta hydrolase fold  23.43 
 
 
314 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4586  lysophospholipase L2  23.51 
 
 
267 aa  64.3  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4654  hypothetical protein  23.25 
 
 
272 aa  63.9  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4895  hypothetical protein  23.25 
 
 
267 aa  64.3  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4492  lysophospholipase L2  23.25 
 
 
267 aa  64.3  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5009  hypothetical protein  23.25 
 
 
267 aa  64.3  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4878  hypothetical protein  23.25 
 
 
267 aa  64.3  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0371  hypothetical protein  25 
 
 
267 aa  63.9  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0600  alpha/beta hydrolase fold protein  23.57 
 
 
253 aa  63.9  0.000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000132287  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4904  hypothetical protein  22.88 
 
 
267 aa  62.8  0.000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1234  alpha/beta hydrolase fold protein  22.22 
 
 
335 aa  62.8  0.000000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.34416  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2989  alpha/beta hydrolase fold  28.99 
 
 
303 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.960197  hitchhiker  0.00255975 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4510  lysophospholipase L2  23.25 
 
 
277 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.811294  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0738  lysophospholipase  23.97 
 
 
310 aa  61.6  0.00000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000217511  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2041  alpha/beta hydrolase fold protein  27.18 
 
 
306 aa  62  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1390  alpha/beta hydrolase fold  22.68 
 
 
310 aa  60.8  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3346  putative lysophospholipase protein  29.49 
 
 
286 aa  60.5  0.00000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.413653  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0197  acylglycerol lipase  25.18 
 
 
288 aa  60.5  0.00000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.868848 
 
 
-
 
NC_004310  BR1458  hypothetical protein  26.1 
 
 
314 aa  60.1  0.00000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.969107  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1413  hypothetical protein  26.1 
 
 
323 aa  60.1  0.00000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0144  hydrolase, alpha/beta fold family protein  25.82 
 
 
297 aa  60.1  0.00000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.261778  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>