36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2876 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_2876  hydrolase family protein  100 
 
 		 335 aa  646    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.720611  normal  0.385258 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4281  hydrolase family protein  63.67 
 
 		 332 aa  363  3e-99  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.549804  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1475  hydrolase family protein  38.89 
 
 		 335 aa  208  1e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3783  hypothetical protein  41.8 
 
 		 354 aa  207  3e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1702  hypothetical protein  37.4 
 
 		 334 aa  122  9e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.412108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7673  hypothetical protein  32.64 
 
 		 339 aa  102  7e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.310419 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5774  hypothetical protein  33.48 
 
 		 339 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.471625  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6139  hypothetical protein  33.48 
 
 		 339 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.728188  normal  0.412726 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3012  alpha/beta hydrolase fold protein  29.75 
 
 		 301 aa  63.2  0.000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.015622  hitchhiker  0.00745042 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4484  BAAT/Acyl-CoA thioester hydrolase  29.64 
 
 		 477 aa  53.1  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.061544  normal  0.0537303 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5537  Lysophospholipase-like protein  28.46 
 
 		 266 aa  52.4  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.738502  normal  0.85419 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2168  hypothetical protein  32.97 
 
 		 498 aa  52  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.79256  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3343  hypothetical protein  21.15 
 
 		 337 aa  49.7  0.00007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.975652  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3126  hypothetical protein  21.25 
 
 		 342 aa  48.9  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3348  hypothetical protein  21.67 
 
 		 339 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.077916  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3372  hypothetical protein  21.25 
 
 		 341 aa  48.9  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3346  hypothetical protein  21.83 
 
 		 320 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3018  hypothetical protein  21.67 
 
 		 338 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.277726  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3112  hypothetical protein  20.6 
 
 		 337 aa  47.8  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.200391  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3871  alpha/beta hydrolase fold protein  31.15 
 
 		 313 aa  47.4  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1544  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase related protein  28.36 
 
 		 448 aa  47.4  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000180144  normal  0.131474 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2249  peptidase S15  27.95 
 
 		 474 aa  47.4  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000310265  normal  0.111012 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1811  hypothetical protein  31.21 
 
 		 399 aa  47  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.369907  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3539  alpha/beta hydrolase fold protein  30.67 
 
 		 309 aa  46.6  0.0006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.173848 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2193  hypothetical protein  35.34 
 
 		 674 aa  45.8  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.189847 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3422  hydrolase-like protein  24.59 
 
 		 264 aa  44.7  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3325  hypothetical protein  20.6 
 
 		 317 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5143  alpha/beta hydrolase fold protein  27.33 
 
 		 275 aa  45.1  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0601  dienelactone hydrolase  24.64 
 
 		 259 aa  45.1  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1315  alpha/beta hydrolase fold  32.06 
 
 		 320 aa  44.3  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0924774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6540  alpha/beta hydrolase fold  29.68 
 
 		 302 aa  43.9  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.300513  normal  0.534481 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4372  alpha/beta hydrolase fold  30.5 
 
 		 296 aa  43.9  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2322  ABC transporter-like protein  31.03 
 
 		 876 aa  43.5  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.255775 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25940  hypothetical protein  32.99 
 
 		 214 aa  42.7  0.008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.375139 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2113  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase related protein  27.44 
 
 		 474 aa  42.7  0.009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0963  alpha/beta hydrolase fold protein  28.57 
 
 		 374 aa  42.7  0.01  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0623938  hitchhiker  0.00346396 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>