89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_2113 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_1530  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase related protein  86.8 
 
 
463 aa  833    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2113  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase related protein  100 
 
 
474 aa  973    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1544  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase related protein  49.89 
 
 
448 aa  457  1e-127  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000180144  normal  0.131474 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1005  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase related protein  44.44 
 
 
434 aa  330  3e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4695  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase related protein  39.2 
 
 
406 aa  253  4.0000000000000004e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3159  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl peptidase  40.83 
 
 
420 aa  252  8.000000000000001e-66  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0736  hypothetical protein  34.74 
 
 
396 aa  242  7.999999999999999e-63  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1853  hypothetical protein  40.61 
 
 
417 aa  242  1e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0716  hypothetical protein  34.74 
 
 
396 aa  238  1e-61  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1811  hypothetical protein  37.47 
 
 
399 aa  213  7.999999999999999e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.369907  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2676  hypothetical protein  36.81 
 
 
401 aa  211  2e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2308  hypothetical protein  33.91 
 
 
399 aa  203  7e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.14665  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5182  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl peptidase  36.9 
 
 
423 aa  194  4e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1547  hypothetical protein  31.62 
 
 
384 aa  194  4e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.26317  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4716  hypothetical protein  34.48 
 
 
406 aa  192  8e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0967  alpha/beta fold family hydrolase  30.87 
 
 
388 aa  187  3e-46  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2193  hypothetical protein  29.47 
 
 
402 aa  179  9e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2165  hypothetical protein  29.47 
 
 
402 aa  177  4e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2957  hypothetical protein  32.45 
 
 
418 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.85194  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1228  hypothetical protein  32.43 
 
 
403 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.395886  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2118  protein of unknown function DUF1100 hydrolase family protein  29.19 
 
 
383 aa  140  6e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3412  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  30.35 
 
 
381 aa  130  4.0000000000000003e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0456561 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1933  hypothetical protein  29.67 
 
 
385 aa  124  4e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3150  hypothetical protein  29.75 
 
 
386 aa  122  9.999999999999999e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.202569  normal  0.775857 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3195  hypothetical protein  30.22 
 
 
420 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.304739  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2389  hypothetical protein  30.03 
 
 
390 aa  120  3.9999999999999996e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3425  hypothetical protein  29.45 
 
 
387 aa  120  4.9999999999999996e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.4734  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0886  alpha/beta fold family hydrolase  25.81 
 
 
373 aa  120  4.9999999999999996e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0714  hypothetical protein  28.02 
 
 
385 aa  119  9.999999999999999e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0890  protein of unknown function DUF1100, hydrolase family protein  27.74 
 
 
357 aa  118  3e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.712139  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0478  protein of unknown function DUF1100, hydrolase family protein  27.6 
 
 
388 aa  116  6.9999999999999995e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2344  alpha/beta fold family hydrolase  26.21 
 
 
374 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.946949  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0906  hypothetical protein  28.07 
 
 
385 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.60282  normal  0.197591 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0856  hypothetical protein  28.09 
 
 
386 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4831  hypothetical protein  28.4 
 
 
386 aa  110  5e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.857401  normal  0.718277 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5486  hypothetical protein  29.23 
 
 
390 aa  110  6e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.416451  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4700  hypothetical protein  31.64 
 
 
377 aa  103  5e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.14251  normal  0.0502097 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1275  alpha/beta fold family hydrolase  24.86 
 
 
378 aa  100  5e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5973  hypothetical protein  26.42 
 
 
400 aa  100  6e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0578676  hitchhiker  0.00100227 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5609  hypothetical protein  26.42 
 
 
400 aa  100  6e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.675144  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4305  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  29.8 
 
 
413 aa  99.8  9e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0350755  normal  0.767198 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0219  hypothetical protein  27.3 
 
 
400 aa  94.7  3e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.431687  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4476  protein of unknown function DUF1100, hydrolase family protein  30.26 
 
 
376 aa  94  5e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25070  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  26.9 
 
 
406 aa  91.7  3e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.351879  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0613  protein of unknown function DUF1100, hydrolase family protein  29.52 
 
 
383 aa  85.1  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6210  Acetyl xylan esterase  27.56 
 
 
402 aa  82.4  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5460  protein of unknown function DUF1100 hydrolase family protein  23.18 
 
 
424 aa  74.7  0.000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.528765  normal  0.198358 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0541  hypothetical protein  25.9 
 
 
372 aa  71.2  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09171  conidial pigment biosynthesis protein Ayg1 (AFU_orthologue; AFUA_2G17550)  29.59 
 
 
300 aa  70.5  0.00000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2964  alpha/beta hydrolase fold  30.25 
 
 
295 aa  60.1  0.00000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3008  alpha/beta hydrolase fold  30.25 
 
 
295 aa  60.1  0.00000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.792567  normal  0.417001 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0081  hydrolase, alpha/beta fold family  26.32 
 
 
286 aa  57.8  0.0000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.221816  normal 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0031  alpha/beta fold family hydrolase  26.32 
 
 
286 aa  57.8  0.0000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4575  hypothetical protein  35.29 
 
 
326 aa  57  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.116237 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2955  fermentation/respiration switch protein  24.53 
 
 
419 aa  55.8  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.283852  normal  0.148271 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6451  peptidase S15  26.69 
 
 
295 aa  54.7  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0515284  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3940  hypothetical protein  28.89 
 
 
418 aa  54.7  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.0000344769  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0267  hypothetical protein  28.69 
 
 
318 aa  54.3  0.000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.586637  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2322  ABC transporter-like protein  31.03 
 
 
876 aa  52.8  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.255775 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3351  putative membrane protein of unknown function  29.37 
 
 
491 aa  51.2  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.881704 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0501  hypothetical protein  23.04 
 
 
436 aa  51.2  0.00004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.672777  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1247  hypothetical protein  31.58 
 
 
546 aa  50.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000443968 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3841  hypothetical protein  26.19 
 
 
298 aa  50.4  0.00008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2726  hypothetical protein  31.36 
 
 
510 aa  50.4  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.313145 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3465  peptidase S15  33.33 
 
 
317 aa  50.1  0.00009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.499781 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4372  alpha/beta hydrolase fold  30.77 
 
 
296 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2852  alpha/beta hydrolase fold  27.04 
 
 
297 aa  49.3  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.142259  normal  0.522222 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2670  Alpha/beta hydrolase  24.73 
 
 
304 aa  49.3  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0323  alpha/beta hydrolase  24.68 
 
 
316 aa  49.3  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.323866  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6158  peptidase S15  25.5 
 
 
295 aa  48.5  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0325  hypothetical protein  30.46 
 
 
263 aa  48.5  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3774  hypothetical protein  33.63 
 
 
533 aa  48.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0113955  normal  0.0693003 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3483  hypothetical protein  31.25 
 
 
373 aa  48.1  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0462629  normal  0.03688 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4281  hydrolase family protein  29.46 
 
 
332 aa  47.4  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.549804  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1866  fermentation/respiration switch protein  23.5 
 
 
415 aa  46.2  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000738572  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1999  Dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase -like protein  29.69 
 
 
424 aa  46.6  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0236781  hitchhiker  0.00479184 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4482  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like  32.06 
 
 
358 aa  45.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2419  alpha/beta hydrolase fold  25.82 
 
 
295 aa  45.4  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.104164  normal  0.0845077 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1886  hypothetical protein  31.54 
 
 
326 aa  45.1  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2440  peptidase S15  22.26 
 
 
298 aa  44.7  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6460  peptidase S15  29.37 
 
 
308 aa  44.7  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.412944  normal  0.0890268 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6851  ABC-type multidrug transport system ATPase component-like protein  28.87 
 
 
866 aa  44.3  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2578  serine/threonine protein kinase  36.07 
 
 
985 aa  44.3  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.790371  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2074  peptidase S15  27.86 
 
 
524 aa  43.9  0.006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.419616  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2066  dienelactone hydrolase  29.86 
 
 
506 aa  43.9  0.007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.399368 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2876  hydrolase family protein  27.44 
 
 
335 aa  43.5  0.008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.720611  normal  0.385258 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1735  alpha/beta hydrolase fold  27.27 
 
 
313 aa  43.5  0.008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.319321  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2005  hypothetical protein  32.63 
 
 
259 aa  43.5  0.008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.878418  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1667  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  29.6 
 
 
283 aa  43.1  0.01  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.195418  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>