52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0498 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_0498  hypothetical protein  100 
 
 
426 aa  850    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4783  hypothetical protein  39.14 
 
 
449 aa  236  6e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.274581 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2249  peptidase S15  27.55 
 
 
474 aa  74.7  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000310265  normal  0.111012 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2478  hypothetical protein  24.85 
 
 
442 aa  62.8  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.991617 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4544  hypothetical protein  29.9 
 
 
490 aa  62.4  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0186679  normal  0.180104 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1475  hydrolase family protein  26.91 
 
 
335 aa  60.1  0.00000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4484  BAAT/Acyl-CoA thioester hydrolase  27.74 
 
 
477 aa  52.4  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.061544  normal  0.0537303 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3465  peptidase S15  35.78 
 
 
317 aa  51.6  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.499781 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2440  peptidase S15  25.68 
 
 
298 aa  51.6  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0267  hypothetical protein  25.53 
 
 
318 aa  51.2  0.00004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.586637  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0293  Dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase  31.13 
 
 
321 aa  51.2  0.00004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.744416  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0798  hydrolase, putative  34.65 
 
 
246 aa  51.2  0.00004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.905028 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1483  hypothetical protein  33.79 
 
 
237 aa  51.2  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1753  dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase  30.37 
 
 
453 aa  50.8  0.00005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.45323  normal  0.582336 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2886  hypothetical protein  36.61 
 
 
301 aa  48.5  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1702  hypothetical protein  35.04 
 
 
334 aa  48.9  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.412108  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2148  alpha/beta fold family hydrolase  26.04 
 
 
343 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.014973  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2422  alpha/beta fold family hydrolase  26.46 
 
 
343 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.157324  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1417  peptidase S15  37.61 
 
 
321 aa  47.4  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1592  peptidase S15  32.39 
 
 
580 aa  47.4  0.0005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00000232254  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1832  peptidase S15  33.33 
 
 
299 aa  47  0.0006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2198  alpha/beta hydrolase fold  23.44 
 
 
343 aa  47  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00385806  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1387  alpha/beta hydrolase fold  33.67 
 
 
275 aa  47  0.0007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.062595  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7673  hypothetical protein  36.15 
 
 
339 aa  46.6  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.310419 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2168  hypothetical protein  25.83 
 
 
498 aa  46.6  0.0009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.79256  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2392  alpha/beta fold family hydrolase  25.52 
 
 
343 aa  46.2  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0864957  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2226  alpha/beta fold family hydrolase  25.52 
 
 
343 aa  46.2  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.519915  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0963  alpha/beta hydrolase fold protein  22.22 
 
 
374 aa  45.8  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0623938  hitchhiker  0.00346396 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1315  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 
320 aa  46.6  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0924774  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0437  peptidase S15  28.38 
 
 
540 aa  46.2  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.196704 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4372  alpha/beta hydrolase fold  28.29 
 
 
296 aa  45.8  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0594  hypothetical protein  34.51 
 
 
558 aa  45.4  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000382895  normal  0.552928 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3781  alpha/beta hydrolase fold  26.84 
 
 
279 aa  45.1  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.812813 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6453  hypothetical protein  28.52 
 
 
496 aa  45.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.73648  normal  0.0509113 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1187  dienelactone hydrolase  21.98 
 
 
333 aa  45.1  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5774  hypothetical protein  26.46 
 
 
339 aa  45.1  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.471625  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2922  putative lipoprotein  30.83 
 
 
285 aa  45.1  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000434521 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6139  hypothetical protein  26.46 
 
 
339 aa  45.1  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.728188  normal  0.412726 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0601  dienelactone hydrolase  33.6 
 
 
259 aa  44.3  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2409  hydrolase, alpha/beta fold family  25 
 
 
343 aa  44.3  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2164  alpha/beta hydrolase  25 
 
 
343 aa  44.3  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.808057  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06320  hypothetical protein  29.55 
 
 
352 aa  44.3  0.005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1773  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase  28.22 
 
 
533 aa  43.9  0.006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0470  hypothetical protein  41.46 
 
 
294 aa  43.9  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.739112 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0358  cinnamoyl ester hydrolase  31.2 
 
 
281 aa  43.5  0.007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1634  putative alpha/beta hydrolase  27.61 
 
 
217 aa  43.5  0.007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000174471 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1133  alpha/beta hydrolase fold  28.47 
 
 
271 aa  43.5  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.03617  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2451  putative lipoprotein  32.86 
 
 
383 aa  43.1  0.008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.181885  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0395  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  20.95 
 
 
617 aa  43.1  0.008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2726  dienelactone hydrolase  39.29 
 
 
247 aa  43.5  0.008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.401579  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1251  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.56 
 
 
638 aa  43.1  0.009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1948  putative lipoprotein  28.57 
 
 
473 aa  43.1  0.01  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>