52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_2202 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_2202  dienelactone hydrolase  100 
 
 
528 aa  1008    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.413126  decreased coverage  0.0031404 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2184  hypothetical protein  51.35 
 
 
519 aa  400  9.999999999999999e-111  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.471753  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1753  dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase  50.22 
 
 
453 aa  356  5.999999999999999e-97  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.45323  normal  0.582336 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2168  hypothetical protein  34.88 
 
 
498 aa  228  3e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.79256  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1773  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase  34.02 
 
 
533 aa  226  6e-58  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6453  hypothetical protein  32.67 
 
 
496 aa  188  2e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.73648  normal  0.0509113 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0117  esterase/lipase  29.61 
 
 
570 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4544  hypothetical protein  34.6 
 
 
490 aa  114  4.0000000000000004e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0186679  normal  0.180104 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2741  hypothetical protein  25.25 
 
 
498 aa  65.1  0.000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0691  hypothetical protein  23.86 
 
 
319 aa  60.1  0.00000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4246  dipeptidyl aminopeptidases/acylaminoacyl-peptidases-like  30.6 
 
 
316 aa  57.8  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.760723  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0501  hypothetical protein  26.62 
 
 
436 aa  57.4  0.0000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.672777  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3820  PGAP1 family protein  22.74 
 
 
485 aa  55.1  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.233276  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0601  dienelactone hydrolase  24.29 
 
 
259 aa  53.1  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1195  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.86 
 
 
645 aa  52.8  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.430413  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1620  hypothetical protein  28.91 
 
 
309 aa  52.4  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1592  peptidase S15  26.07 
 
 
580 aa  52.4  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00000232254  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0358  cinnamoyl ester hydrolase  25.11 
 
 
281 aa  52  0.00003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6451  peptidase S15  29.63 
 
 
295 aa  50.4  0.00007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0515284  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2658  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27 
 
 
642 aa  50.1  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.55127  normal  0.367777 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2440  peptidase S15  29.46 
 
 
298 aa  49.7  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5342  hypothetical protein  34.71 
 
 
423 aa  49.7  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.764052  normal  0.588325 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1119  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  23.95 
 
 
688 aa  48.9  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.734549  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6158  peptidase S15  28.89 
 
 
295 aa  48.5  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3786  esterase  26.01 
 
 
249 aa  48.1  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0541  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  20.42 
 
 
518 aa  48.5  0.0003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.429802  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1709  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25.7 
 
 
594 aa  48.5  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1906  hypothetical protein  32.03 
 
 
434 aa  48.1  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.189773  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2249  peptidase S15  32.86 
 
 
474 aa  47.4  0.0006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000310265  normal  0.111012 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0684  esterase  25.89 
 
 
249 aa  47.4  0.0007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3640  esterase  25.89 
 
 
249 aa  47.4  0.0007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1616  dienelactone hydrolase  30.39 
 
 
263 aa  47.4  0.0007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.555158 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6776  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  23.97 
 
 
661 aa  47  0.0009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2589  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  24.02 
 
 
300 aa  47  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.719605  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5478  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  31.54 
 
 
317 aa  46.6  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.157645 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2710  hypothetical protein  36.17 
 
 
367 aa  45.8  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000170279  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3141  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.02 
 
 
596 aa  45.4  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.91649  normal  0.671974 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0384  hypothetical protein  22.22 
 
 
312 aa  45.8  0.002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00245996  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3841  hypothetical protein  30.36 
 
 
298 aa  45.4  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0871  alpha/beta hydrolase fold protein  36.21 
 
 
290 aa  45.4  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0890  protein of unknown function DUF1100, hydrolase family protein  25 
 
 
357 aa  45.1  0.003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.712139  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2905  hypothetical protein  33.05 
 
 
295 aa  45.1  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000728427  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3567  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  24.08 
 
 
695 aa  45.1  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.304997  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3783  hypothetical protein  26.87 
 
 
354 aa  45.4  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7068  hypothetical protein  24.12 
 
 
267 aa  44.7  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03205  Alpha/beta superfamily hydrolase  22.08 
 
 
281 aa  44.3  0.006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0561  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25.26 
 
 
668 aa  44.3  0.006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3045  dienelactone hydrolase  31.43 
 
 
249 aa  44.3  0.006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2478  hypothetical protein  24.68 
 
 
442 aa  44.3  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.991617 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3662  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  22.52 
 
 
621 aa  43.9  0.007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0540328  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0333  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  22.86 
 
 
717 aa  43.5  0.01  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3085  peptidase S15  31.45 
 
 
287 aa  43.5  0.01  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.918573  normal  0.256492 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>