88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5342 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_5342  hypothetical protein  100 
 
 
423 aa  836    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.764052  normal  0.588325 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1906  hypothetical protein  56.49 
 
 
434 aa  449  1e-125  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.189773  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0501  hypothetical protein  32.62 
 
 
436 aa  254  1.0000000000000001e-66  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.672777  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2741  hypothetical protein  36.39 
 
 
498 aa  230  4e-59  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2905  putative hydrolase  27.99 
 
 
512 aa  207  2e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.212149  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3161  putative hydrolase  27.75 
 
 
512 aa  205  1e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2079  putative hydrolase  27.75 
 
 
512 aa  202  9e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0583  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  33.71 
 
 
412 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0597  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  33.71 
 
 
412 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.458805  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0096  hydrolase  27.92 
 
 
517 aa  200  3e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4315  hypothetical protein  30.81 
 
 
460 aa  195  1e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0994  hypothetical protein  30.56 
 
 
460 aa  194  3e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1982  hypothetical protein  30.56 
 
 
460 aa  192  7e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.900389  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5497  putative hydrolase  30.54 
 
 
460 aa  189  7e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal  0.134483 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1682  hydrolase  29.93 
 
 
460 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.35711  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1904  hypothetical protein  29.93 
 
 
460 aa  184  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1953  hypothetical protein  29.93 
 
 
460 aa  182  9.000000000000001e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1708  hydrolase  29.93 
 
 
460 aa  182  9.000000000000001e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1866  hypothetical protein  34.19 
 
 
362 aa  179  9e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1730  hypothetical protein  34.19 
 
 
362 aa  179  9e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3509  Dienelactone hydrolase  28.68 
 
 
438 aa  176  7e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0691  hypothetical protein  36.04 
 
 
319 aa  171  2e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1620  hypothetical protein  33.77 
 
 
309 aa  169  6e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3820  PGAP1 family protein  26.75 
 
 
485 aa  155  1e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.233276  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1130  hypothetical protein  25.45 
 
 
400 aa  145  2e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1592  peptidase S15  32.84 
 
 
580 aa  115  1.0000000000000001e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00000232254  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2249  peptidase S15  31.38 
 
 
474 aa  100  7e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000310265  normal  0.111012 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0963  alpha/beta hydrolase fold protein  27.14 
 
 
374 aa  97.1  6e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0623938  hitchhiker  0.00346396 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2478  hypothetical protein  24.78 
 
 
442 aa  88.2  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.991617 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1721  Alpha/beta hydrolase fold  30.99 
 
 
317 aa  86.3  9e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3592  hypothetical protein  31.82 
 
 
323 aa  86.3  9e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.712485  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1262  alpha/beta hydrolase fold  30.35 
 
 
319 aa  84.7  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42770  hypothetical protein  31.47 
 
 
327 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1315  alpha/beta hydrolase fold  34.78 
 
 
320 aa  79.7  0.00000000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0924774  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23740  hydrolase, alpha/beta fold family  29.5 
 
 
317 aa  77.8  0.0000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.582768  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1881  lysophospholipase-like protein  29.8 
 
 
330 aa  77  0.0000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.27985  normal  0.592044 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0541  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  25.91 
 
 
518 aa  75.9  0.000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.429802  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07480  hypothetical protein  25.09 
 
 
308 aa  74.7  0.000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0100804  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1852  hypothetical protein  28.91 
 
 
343 aa  74.7  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.613868  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1407  alpha/beta hydrolase fold  29.96 
 
 
320 aa  74.3  0.000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0821941  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3112  hypothetical protein  33.75 
 
 
337 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.200391  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3018  hypothetical protein  34.38 
 
 
338 aa  73.6  0.000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.277726  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3343  hypothetical protein  31.45 
 
 
337 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.975652  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6266  peptidase S15  24.87 
 
 
465 aa  72.4  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0476291  normal  0.558827 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6145  peptidase S15  24.59 
 
 
380 aa  72.8  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000966122  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3325  hypothetical protein  31.9 
 
 
317 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1829  alpha/beta fold family hydrolase  29.96 
 
 
319 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.174462  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3346  hypothetical protein  33.74 
 
 
320 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1437  alpha/beta hydrolase fold  29.96 
 
 
320 aa  72.4  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.872938  normal  0.0432694 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3881  alpha/beta hydrolase fold  29.96 
 
 
320 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00418628  normal  0.248118 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3348  hypothetical protein  33.75 
 
 
339 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.077916  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3372  hypothetical protein  33.75 
 
 
341 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3126  hypothetical protein  33.13 
 
 
342 aa  70.9  0.00000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0877  hypothetical protein  25.52 
 
 
316 aa  70.1  0.00000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000690525  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2042  hypothetical protein  29.62 
 
 
343 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.429785  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1717  alpha/beta hydrolase fold  27.07 
 
 
315 aa  67  0.0000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2263  alpha/beta hydrolase  32.37 
 
 
315 aa  66.6  0.0000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.469721 
 
 
-
 
NC_002950  PG1948  putative lipoprotein  28.66 
 
 
473 aa  65.9  0.000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3539  alpha/beta hydrolase fold protein  27.27 
 
 
309 aa  65.1  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.173848 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0162  alpha/beta hydrolase fold  25.72 
 
 
321 aa  63.2  0.000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00601319 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1419  hypothetical protein  28.27 
 
 
328 aa  63.5  0.000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.692935  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6540  alpha/beta hydrolase fold  30.32 
 
 
302 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.300513  normal  0.534481 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2030  hypothetical protein  27.85 
 
 
328 aa  61.6  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.258009 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3329  hypothetical protein  29.81 
 
 
362 aa  60.8  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5534  hypothetical protein  34.38 
 
 
390 aa  60.8  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.82646  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04770  alpha/beta hydrolase fold protein  26.52 
 
 
424 aa  58.5  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000317728  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1232  alpha/beta fold family hydrolase  23.29 
 
 
305 aa  57  0.0000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2030  Esterase/lipase-like protein  27.65 
 
 
593 aa  53.9  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0135331  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0293  Dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase  31.1 
 
 
321 aa  53.9  0.000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.744416  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2202  dienelactone hydrolase  29.63 
 
 
528 aa  52  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.413126  decreased coverage  0.0031404 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0807  hypothetical protein  34.33 
 
 
277 aa  52  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.552448  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1501  Alpha/beta hydrolase  29.49 
 
 
302 aa  51.6  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.568195  normal  0.537602 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0601  dienelactone hydrolase  32.39 
 
 
259 aa  51.6  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3187  putative hydrolase  45.61 
 
 
79 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2298  alpha/beta hydrolase fold protein  27.94 
 
 
322 aa  51.2  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.321032  decreased coverage  0.000193345 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4544  hypothetical protein  36.8 
 
 
490 aa  51.6  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0186679  normal  0.180104 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4246  dipeptidyl aminopeptidases/acylaminoacyl-peptidases-like  28.87 
 
 
316 aa  50.8  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.760723  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2926  hypothetical protein  38.67 
 
 
94 aa  50.4  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6453  hypothetical protein  25.5 
 
 
496 aa  49.7  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.73648  normal  0.0509113 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0299  hypothetical protein  35.65 
 
 
307 aa  44.7  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.261674 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4476  protein of unknown function DUF1100, hydrolase family protein  33.9 
 
 
376 aa  45.1  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1999  Dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase -like protein  33.33 
 
 
424 aa  44.3  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0236781  hitchhiker  0.00479184 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2781  BAAT/Acyl-CoA thioester hydrolase  22.02 
 
 
264 aa  44.7  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1702  hypothetical protein  30.51 
 
 
334 aa  43.9  0.005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.412108  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1187  dienelactone hydrolase  24.53 
 
 
333 aa  43.9  0.005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3641  hypothetical protein  24.66 
 
 
329 aa  43.1  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0898  lysophospholipase-like protein  29.38 
 
 
308 aa  43.1  0.008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.308964 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0890  protein of unknown function DUF1100, hydrolase family protein  27.23 
 
 
357 aa  43.1  0.009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.712139  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>