91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1906 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_1906  hypothetical protein  100 
 
 
434 aa  857    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.189773  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5342  hypothetical protein  56.49 
 
 
423 aa  437  1e-121  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.764052  normal  0.588325 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0501  hypothetical protein  32.3 
 
 
436 aa  233  6e-60  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.672777  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2741  hypothetical protein  36.1 
 
 
498 aa  231  2e-59  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2905  putative hydrolase  33.01 
 
 
512 aa  224  2e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.212149  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0583  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  32.43 
 
 
412 aa  222  9e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0597  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  32.43 
 
 
412 aa  222  9e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.458805  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3161  putative hydrolase  32.52 
 
 
512 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2079  putative hydrolase  32.52 
 
 
512 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0096  hydrolase  32.78 
 
 
517 aa  219  8.999999999999998e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4315  hypothetical protein  30.51 
 
 
460 aa  187  3e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0994  hypothetical protein  30.46 
 
 
460 aa  186  8e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1982  hypothetical protein  30.77 
 
 
460 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.900389  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5497  putative hydrolase  30.7 
 
 
460 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal  0.134483 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1953  hypothetical protein  30.62 
 
 
460 aa  178  2e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1682  hydrolase  29.9 
 
 
460 aa  177  4e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.35711  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3509  Dienelactone hydrolase  29.33 
 
 
438 aa  176  8e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1904  hypothetical protein  29.9 
 
 
460 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1708  hydrolase  29.69 
 
 
460 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1866  hypothetical protein  33.54 
 
 
362 aa  172  1e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1730  hypothetical protein  33.54 
 
 
362 aa  172  1e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1130  hypothetical protein  26.88 
 
 
400 aa  147  5e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3820  PGAP1 family protein  29.69 
 
 
485 aa  142  9.999999999999999e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.233276  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0691  hypothetical protein  30.82 
 
 
319 aa  139  7e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1620  hypothetical protein  30.94 
 
 
309 aa  133  6e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1592  peptidase S15  33.84 
 
 
580 aa  113  7.000000000000001e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00000232254  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2249  peptidase S15  31.05 
 
 
474 aa  112  2.0000000000000002e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000310265  normal  0.111012 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1262  alpha/beta hydrolase fold  34.17 
 
 
319 aa  98.2  3e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2478  hypothetical protein  28.65 
 
 
442 aa  97.4  5e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.991617 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0963  alpha/beta hydrolase fold protein  26.02 
 
 
374 aa  94.4  4e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0623938  hitchhiker  0.00346396 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1881  lysophospholipase-like protein  29.49 
 
 
330 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.27985  normal  0.592044 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3343  hypothetical protein  26.25 
 
 
337 aa  83.2  0.000000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.975652  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3018  hypothetical protein  25.6 
 
 
338 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.277726  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3346  hypothetical protein  26.01 
 
 
320 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3126  hypothetical protein  25.7 
 
 
342 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3372  hypothetical protein  25.7 
 
 
341 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1721  Alpha/beta hydrolase fold  30.92 
 
 
317 aa  81.3  0.00000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3325  hypothetical protein  26.09 
 
 
317 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3112  hypothetical protein  27.78 
 
 
337 aa  80.5  0.00000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.200391  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3348  hypothetical protein  25.3 
 
 
339 aa  80.1  0.00000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.077916  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6266  peptidase S15  26.18 
 
 
465 aa  79.7  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0476291  normal  0.558827 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1852  hypothetical protein  27.84 
 
 
343 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.613868  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42770  hypothetical protein  28.23 
 
 
327 aa  78.2  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0541  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  27.24 
 
 
518 aa  77.4  0.0000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.429802  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1437  alpha/beta hydrolase fold  30.37 
 
 
320 aa  77  0.0000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.872938  normal  0.0432694 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1717  alpha/beta hydrolase fold  26.55 
 
 
315 aa  76.6  0.0000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0877  hypothetical protein  25.73 
 
 
316 aa  77  0.0000000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000690525  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1315  alpha/beta hydrolase fold  31.01 
 
 
320 aa  76.3  0.000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0924774  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3592  hypothetical protein  27.85 
 
 
323 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.712485  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1407  alpha/beta hydrolase fold  28.63 
 
 
320 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0821941  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3539  alpha/beta hydrolase fold protein  28.99 
 
 
309 aa  75.5  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.173848 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3329  hypothetical protein  31.56 
 
 
362 aa  75.1  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23740  hydrolase, alpha/beta fold family  29.48 
 
 
317 aa  74.7  0.000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.582768  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1829  alpha/beta fold family hydrolase  28.14 
 
 
319 aa  73.6  0.000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.174462  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3881  alpha/beta hydrolase fold  28.14 
 
 
320 aa  73.6  0.000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00418628  normal  0.248118 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07480  hypothetical protein  25 
 
 
308 aa  72  0.00000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0100804  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2263  alpha/beta hydrolase  33.49 
 
 
315 aa  70.9  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.469721 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2042  hypothetical protein  27.84 
 
 
343 aa  70.5  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.429785  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6145  peptidase S15  23.37 
 
 
380 aa  70.1  0.00000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000966122  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0162  alpha/beta hydrolase fold  29.2 
 
 
321 aa  67.8  0.0000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00601319 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1232  alpha/beta fold family hydrolase  26.67 
 
 
305 aa  67  0.0000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0299  hypothetical protein  32.17 
 
 
307 aa  66.6  0.0000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.261674 
 
 
-
 
NC_002950  PG1948  putative lipoprotein  26 
 
 
473 aa  64.3  0.000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0517  putative secreted protein  40 
 
 
332 aa  57.4  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5534  hypothetical protein  31.25 
 
 
390 aa  57.4  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.82646  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04770  alpha/beta hydrolase fold protein  24.3 
 
 
424 aa  55.8  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000317728  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0150  putative secreted protein  31.09 
 
 
337 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0141  putative secreted protein  31.09 
 
 
337 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.402185  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6540  alpha/beta hydrolase fold  27.73 
 
 
302 aa  55.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.300513  normal  0.534481 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0131  putative secreted protein  30.67 
 
 
337 aa  54.7  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.343092  normal  0.416053 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0151  putative secreted protein  31.62 
 
 
331 aa  54.7  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0155783  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3187  putative hydrolase  42.37 
 
 
79 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0426  hypothetical protein  29.69 
 
 
316 aa  53.1  0.00001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.814085  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2298  alpha/beta hydrolase fold protein  25.6 
 
 
322 aa  52.8  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.321032  decreased coverage  0.000193345 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2582  peptidase S15  36.13 
 
 
258 aa  52.8  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2926  hypothetical protein  36 
 
 
94 aa  52.4  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4246  dipeptidyl aminopeptidases/acylaminoacyl-peptidases-like  30 
 
 
316 aa  52  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.760723  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1419  hypothetical protein  26.36 
 
 
328 aa  51.6  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.692935  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2030  hypothetical protein  25.97 
 
 
328 aa  50.1  0.00008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.258009 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4305  hypothetical protein  33.33 
 
 
192 aa  49.7  0.00009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.155618 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2202  dienelactone hydrolase  32.03 
 
 
528 aa  48.5  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.413126  decreased coverage  0.0031404 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0890  protein of unknown function DUF1100, hydrolase family protein  27.92 
 
 
357 aa  48.1  0.0003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.712139  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0714  hypothetical protein  26.95 
 
 
385 aa  47.8  0.0004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1753  dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase  29.93 
 
 
453 aa  47.4  0.0005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.45323  normal  0.582336 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0293  Dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase  32.28 
 
 
321 aa  47  0.0007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.744416  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0601  dienelactone hydrolase  28.47 
 
 
259 aa  45.8  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1501  Alpha/beta hydrolase  26.16 
 
 
302 aa  45.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.568195  normal  0.537602 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0798  hydrolase, putative  36.44 
 
 
246 aa  45.1  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.905028 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1187  dienelactone hydrolase  24.28 
 
 
333 aa  45.8  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4476  protein of unknown function DUF1100, hydrolase family protein  27.98 
 
 
376 aa  44.3  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2168  hypothetical protein  24.16 
 
 
498 aa  43.5  0.007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.79256  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>