52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0426 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002620  TC0426  hypothetical protein  100 
 
 
316 aa  656    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.814085  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0601  dienelactone hydrolase  28.57 
 
 
259 aa  90.9  3e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1279  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  23.9 
 
 
261 aa  74.7  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000359236  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0478  hypothetical protein  23.26 
 
 
272 aa  73.2  0.000000000006  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.218864  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2582  peptidase S15  30.25 
 
 
258 aa  67.4  0.0000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0798  hydrolase, putative  28.57 
 
 
246 aa  65.5  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.905028 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0293  Dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase  25.98 
 
 
321 aa  63.5  0.000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.744416  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1578  dienelactone hydrolase  22.22 
 
 
255 aa  63.2  0.000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3004  peptidase S15  29.38 
 
 
282 aa  63.2  0.000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0110068  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0457  Lysophospholipase-like protein  29.94 
 
 
274 aa  62.8  0.000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17390  hypothetical protein  29.14 
 
 
268 aa  62  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1417  peptidase S15  32.48 
 
 
321 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1150  dienelactone hydrolase  27.27 
 
 
254 aa  59.3  0.00000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3021  peptidase S15  30.33 
 
 
292 aa  57.8  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1900  peptidase S15  28.57 
 
 
705 aa  57.4  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.138312  hitchhiker  0.00100576 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3465  peptidase S15  35 
 
 
317 aa  57.8  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.499781 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3936  peptidase S15  27.59 
 
 
309 aa  57.4  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.752665  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0322  dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase-like protein  30.94 
 
 
274 aa  55.8  0.0000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000337661  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2367  hypothetical protein  33.12 
 
 
290 aa  55.8  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0582  E3 binding domain protein  27.84 
 
 
467 aa  55.1  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0212  dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase-like protein  28.91 
 
 
257 aa  54.3  0.000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1906  hypothetical protein  29.69 
 
 
434 aa  53.1  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.189773  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2029  hypothetical protein  28.11 
 
 
276 aa  51.2  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0819  hypothetical protein  29.89 
 
 
253 aa  50.4  0.00004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1762  alpha/beta fold family hydrolase  25.78 
 
 
260 aa  49.7  0.00007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000326151  normal  0.089199 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0838  dienelactone hydrolase  30.08 
 
 
302 aa  47  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2872  hypothetical protein  29.88 
 
 
638 aa  46.2  0.0007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0234  alpha/beta hydrolase fold protein  25.89 
 
 
256 aa  45.8  0.0009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.104073 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3539  alpha/beta hydrolase fold protein  30.23 
 
 
309 aa  45.1  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.173848 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3126  hypothetical protein  28.44 
 
 
342 aa  45.1  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3348  hypothetical protein  28.44 
 
 
339 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.077916  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1684  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  25.87 
 
 
248 aa  45.1  0.002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_33945  predicted protein  31.18 
 
 
409 aa  45.1  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.913132  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4476  protein of unknown function DUF1100, hydrolase family protein  27.69 
 
 
376 aa  44.7  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1592  peptidase S15  29.49 
 
 
580 aa  45.1  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00000232254  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08460  putative hydrolase, CocE/NonD family  30.95 
 
 
673 aa  45.1  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.8708  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0085  hypothetical protein  27.21 
 
 
284 aa  44.7  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.720281  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3814  peptidase S15  27.52 
 
 
650 aa  45.1  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0281034 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3372  hypothetical protein  28.44 
 
 
341 aa  44.7  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3871  alpha/beta hydrolase fold protein  31.82 
 
 
313 aa  44.3  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0890  protein of unknown function DUF1100, hydrolase family protein  28.8 
 
 
357 aa  44.3  0.003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.712139  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2913  hydrolase CocE/NonD family protein  31.71 
 
 
677 aa  43.5  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.355315  normal  0.116315 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3112  hypothetical protein  27.52 
 
 
337 aa  43.9  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.200391  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2964  hypothetical protein  29.27 
 
 
638 aa  43.9  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3018  hypothetical protein  28.21 
 
 
338 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.277726  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3325  hypothetical protein  27.52 
 
 
317 aa  43.5  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1479  alpha/beta hydrolase fold protein  24.39 
 
 
257 aa  43.5  0.005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1433  alpha/beta hydrolase fold  24.39 
 
 
257 aa  43.1  0.005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3343  hypothetical protein  28.44 
 
 
337 aa  42.7  0.007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.975652  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3150  hypothetical protein  25.84 
 
 
386 aa  42.7  0.008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.202569  normal  0.775857 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2671  alpha/beta hydrolase fold protein  24.63 
 
 
270 aa  42.7  0.009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.661252 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2922  putative lipoprotein  33.33 
 
 
285 aa  42.4  0.01  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000434521 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>