23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4305 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_4305  hypothetical protein  100 
 
 		 192 aa  383  1e-106  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.155618 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5440  hypothetical protein  55.65 
 
 		 153 aa  135  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.3804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3318  hypothetical protein  41.61 
 
 		 216 aa  125  3e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.329513  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2271  Clp N terminal domain-containing protein  35.82 
 
 		 240 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1906  hypothetical protein  33.33 
 
 		 434 aa  49.7  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.189773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2225  Clp, N terminal  35.82 
 
 		 240 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.176488  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2214  Clp N terminal domain-containing protein  35.82 
 
 		 240 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.574995  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0766  hypothetical protein  39.66 
 
 		 81 aa  47.8  0.0001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21130  hypothetical protein  39.66 
 
 		 81 aa  47.8  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4091  Clp domain-containing protein  37.68 
 
 		 257 aa  47  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0455898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3907  Clp N terminal domain-containing protein  37.74 
 
 		 240 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.885711 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5168  Clp domain protein  33.85 
 
 		 237 aa  45.4  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22280  Clp amino terminal domain-containing protein  34.33 
 
 		 233 aa  45.8  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0209584  normal  0.311061 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2160  Clp domain-containing protein  37.25 
 
 		 246 aa  45.4  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.520104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12682  ATP-dependent protease ATP-binding subunit clpC2  35.85 
 
 		 252 aa  44.3  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0325769  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2497  Clp N terminal domain-containing protein  35.85 
 
 		 239 aa  44.3  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.692778  normal  0.369973 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0200  Clp domain protein  34.41 
 
 		 282 aa  44.3  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21000  hypothetical protein  45.83 
 
 		 214 aa  43.1  0.003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.741436  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3380  hypothetical protein  40 
 
 		 76 aa  42.7  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0872841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20330  hypothetical protein  44.19 
 
 		 82 aa  42.4  0.004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.322211  normal  0.210467 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06200  hypothetical protein  41.86 
 
 		 82 aa  41.6  0.006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0610  Clp domain protein  37.74 
 
 		 242 aa  41.6  0.007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1294  Clp domain-containing protein  32.76 
 
 		 243 aa  41.2  0.009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0332728 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>