More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_22280 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_22280  Clp amino terminal domain-containing protein  100 
 
 		 233 aa  462  1e-129  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0209584  normal  0.311061 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4091  Clp domain-containing protein  63.68 
 
 		 257 aa  293  1e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0455898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5168  Clp domain protein  60.54 
 
 		 237 aa  269  2e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1294  Clp domain-containing protein  59.31 
 
 		 243 aa  265  5e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0332728 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1344  Clp N terminal domain-containing protein  60.36 
 
 		 243 aa  261  4.999999999999999e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3907  Clp N terminal domain-containing protein  58.9 
 
 		 240 aa  255  3e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.885711 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2497  Clp N terminal domain-containing protein  59.21 
 
 		 239 aa  253  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.692778  normal  0.369973 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2225  Clp, N terminal  58.6 
 
 		 240 aa  243  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.176488  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2271  Clp N terminal domain-containing protein  58.6 
 
 		 240 aa  243  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2214  Clp N terminal domain-containing protein  58.6 
 
 		 240 aa  243  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.574995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12682  ATP-dependent protease ATP-binding subunit clpC2  61.29 
 
 		 252 aa  234  8e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0325769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0610  Clp domain protein  47.21 
 
 		 242 aa  199  1.9999999999999998e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5711  Clp domain protein  43.97 
 
 		 240 aa  164  1.0000000000000001e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2160  Clp domain-containing protein  43.78 
 
 		 246 aa  162  5.0000000000000005e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.520104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0200  Clp domain protein  40.42 
 
 		 282 aa  148  6e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01540  ATPase with chaperone activity, ATP-binding subunit  47.58 
 
 		 851 aa  117  9.999999999999999e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009340  Mflv_5590  Clp N terminal domain-containing protein  35.44 
 
 		 246 aa  115  6e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0595  ATPase AAA-2 domain protein  44.93 
 
 		 851 aa  115  6.9999999999999995e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.190948  normal  0.0636488 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0332  ATPase AAA-2 domain protein  47.58 
 
 		 830 aa  113  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13030  ATPase with chaperone activity, ATP-binding subunit  50 
 
 		 879 aa  113  3e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0171216  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0168  ATPase  47.58 
 
 		 830 aa  113  3e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4335  ATPase AAA-2 domain protein  47.58 
 
 		 840 aa  112  5e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3404  ATPase AAA-2 domain protein  47.24 
 
 		 843 aa  112  5e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2179  ATPase AAA-2  47.83 
 
 		 834 aa  112  6e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.400132  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0449  ATPase AAA-2 domain protein  47.24 
 
 		 842 aa  112  7.000000000000001e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.673117 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05080  ATPase with chaperone activity, ATP-binding subunit  47.24 
 
 		 858 aa  112  7.000000000000001e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0363  ATPase AAA-2 domain protein  43.48 
 
 		 852 aa  110  2.0000000000000002e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4992  ATPase AAA-2 domain protein  45.97 
 
 		 836 aa  109  4.0000000000000004e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.384287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2876  ATPase  45.97 
 
 		 830 aa  108  5e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4475  ATPase AAA-2 domain protein  45.97 
 
 		 837 aa  108  6e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8371  ATPase AAA-2 domain protein  45.97 
 
 		 850 aa  108  6e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6311  ATPase AAA-2 domain-containing protein  45.97 
 
 		 854 aa  108  6e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0641  ATPase AAA-2 domain protein  45.97 
 
 		 841 aa  108  7.000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2192  ATPase  45.97 
 
 		 836 aa  108  7.000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.158504  normal  0.0967388 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0220  ATPase  45.97 
 
 		 839 aa  108  7.000000000000001e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.230139  normal  0.171327 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4709  ATPase  45.97 
 
 		 844 aa  108  7.000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0549246  normal  0.0242772 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0862  ATPase AAA-2 domain protein  45.97 
 
 		 848 aa  108  7.000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0856425  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4275  ATPase  45.97 
 
 		 844 aa  108  7.000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.219573 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3055  ATPase AAA-2 domain protein  46.46 
 
 		 858 aa  108  8.000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0115492 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4383  ATPase AAA-2  45.97 
 
 		 834 aa  107  1e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.388012 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0573  ATPase AAA-2 domain protein  45.97 
 
 		 855 aa  107  1e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35440  ATPase with chaperone activity, ATP-binding subunit  45.97 
 
 		 851 aa  107  1e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0335  ATPase AAA-2 domain protein  45.97 
 
 		 852 aa  108  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00535143  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3416  ATPase AAA-2 domain-containing protein  45.97 
 
 		 834 aa  107  1e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0190  ATPase  45.97 
 
 		 834 aa  107  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.362734 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9148  class III stress response-related ATPase  45.97 
 
 		 835 aa  107  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0857  ATPase AAA-2 domain protein  45.97 
 
 		 846 aa  107  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4756  ATPase AAA-2  45.16 
 
 		 847 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.491369  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0466  ATPase  45.67 
 
 		 861 aa  106  2e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4842  ATPase  45.16 
 
 		 847 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.569226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5358  ATPase  45.16 
 
 		 847 aa  107  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.406565 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5142  ATPase  45.16 
 
 		 847 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.624262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1430  ATPase  45.16 
 
 		 847 aa  107  2e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.576172  normal  0.410328 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13629  ATP-dependent protease ATP-binding subunit clpC1  45.16 
 
 		 848 aa  107  2e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.1256e-30  normal  0.051762 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24610  ATPase with chaperone activity, ATP-binding subunit  44.35 
 
 		 866 aa  106  4e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1682  ATPase AAA-2 domain protein  46.15 
 
 		 868 aa  105  5e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.167078 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0010  ATP-binding subunit of Clp protease  45.83 
 
 		 869 aa  105  8e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0724  negative regulator of genetic competence ClpC/MecB  43.41 
 
 		 862 aa  104  1e-21  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0978513 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0146  ATPase AAA-2 domain protein  39.72 
 
 		 814 aa  96.3  4e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1903  ATPase AAA-2 domain protein  42.97 
 
 		 829 aa  95.5  7e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.847755  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1948  ATPase AAA-2 domain protein  43.55 
 
 		 812 aa  93.6  2e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0130841  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2367  ATPases with chaperone activity, ATP-binding subunit  42.03 
 
 		 828 aa  92.4  6e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000278199  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0835  ATPase  40.29 
 
 		 816 aa  90.1  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0981203  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0180  ATPase  41.13 
 
 		 812 aa  90.9  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1349  ATPase AAA-2 domain protein  38.41 
 
 		 820 aa  89.7  4e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0079  ATPase AAA-2 domain protein  42.97 
 
 		 810 aa  88.6  8e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1627  ATPase  39.84 
 
 		 846 aa  88.6  8e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0475854  normal  0.546866 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09911  ClpC  39.84 
 
 		 859 aa  88.6  8e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0910  UvrB/UvrC protein  39.84 
 
 		 823 aa  88.2  9e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4738  ATPase AAA-2 domain-containing protein  39.84 
 
 		 824 aa  88.2  1e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0660  Clp protease ATP-binding subunit  39.84 
 
 		 855 aa  87.8  1e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.562676  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4704  ATPase AAA-2 domain protein  39.84 
 
 		 825 aa  88.2  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.655503 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1389  ATPase  39.84 
 
 		 843 aa  88.2  1e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0145089  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1876  ATPase AAA-2 domain protein  39.84 
 
 		 821 aa  87.8  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000589067 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0260  ATPase  39.84 
 
 		 824 aa  88.2  1e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1448  ATPase AAA-2 domain protein  39.84 
 
 		 822 aa  87.8  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2437  ATPase AAA-2  39.84 
 
 		 825 aa  88.2  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.643825 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11791  ClpC  39.84 
 
 		 843 aa  87.8  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14921  ClpC  39.84 
 
 		 855 aa  87.8  1e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1419  ATPase AAA-2 domain protein  39.84 
 
 		 822 aa  87.8  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0547  ATPase  41.88 
 
 		 818 aa  87.4  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0077  negative regulator of genetic competence clpC/mecB (ATP-dependent Clp protease)  42.97 
 
 		 811 aa  87  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10981  ClpC  39.84 
 
 		 859 aa  87.4  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.518332  normal  0.298944 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0561  ATPase  41.88 
 
 		 818 aa  87.4  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11951  ClpC  40.83 
 
 		 841 aa  87  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0165  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpC  41.88 
 
 		 817 aa  86.7  3e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1099  Clp protease ATP-binding subunit  40.83 
 
 		 842 aa  86.7  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.372897  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0083  ATPase AAA-2 domain protein  42.19 
 
 		 811 aa  86.7  3e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.181403  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0076  ATPase  42.19 
 
 		 811 aa  86.3  3e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00870  ATPase AAA-2 domain protein  42.34 
 
 		 806 aa  86.7  3e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000509164  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2740  ATPase AAA-2 domain protein  41.67 
 
 		 812 aa  86.7  3e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11941  ClpC  40.83 
 
 		 842 aa  86.7  3e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.316562  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0603  ATPase AAA-2 domain protein  40 
 
 		 852 aa  86.3  3e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0740742  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1000  ATPase AAA-2 domain-containing protein  35.97 
 
 		 815 aa  86.3  4e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0499037  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3380  ATPase AAA-2  32.19 
 
 		 825 aa  86.3  4e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.802803  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4348  UvrB/UvrC protein  36.23 
 
 		 814 aa  85.5  7e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0081  negative regulator of genetic competence ClpC/MecB  42.19 
 
 		 811 aa  85.1  8e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0078  negative regulator of genetic competence clpC/mecB (ATP-dependent Clp protease)  42.19 
 
 		 811 aa  85.1  8e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0076  ATPase  42.19 
 
 		 811 aa  85.1  8e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0080  negative regulator of genetic competence ClpC/MecB  42.19 
 
 		 811 aa  85.1  8e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.723248  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>