285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_2497 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_2497  Clp N terminal domain-containing protein  100 
 
 
239 aa  480  1e-135  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.692778  normal  0.369973 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3907  Clp N terminal domain-containing protein  79.08 
 
 
240 aa  381  1e-105  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.885711 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4091  Clp domain-containing protein  65.81 
 
 
257 aa  296  2e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0455898  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2225  Clp, N terminal  65.53 
 
 
240 aa  289  3e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.176488  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2271  Clp N terminal domain-containing protein  65.53 
 
 
240 aa  289  3e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2214  Clp N terminal domain-containing protein  65.53 
 
 
240 aa  289  3e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.574995  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1294  Clp domain-containing protein  60.68 
 
 
243 aa  274  7e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0332728 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1344  Clp N terminal domain-containing protein  63.23 
 
 
243 aa  268  5e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5168  Clp domain protein  57.85 
 
 
237 aa  259  3e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22280  Clp amino terminal domain-containing protein  60.09 
 
 
233 aa  249  3e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0209584  normal  0.311061 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12682  ATP-dependent protease ATP-binding subunit clpC2  59.83 
 
 
252 aa  236  3e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0325769  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0610  Clp domain protein  48.95 
 
 
242 aa  191  1e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5711  Clp domain protein  46.43 
 
 
240 aa  157  1e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2160  Clp domain-containing protein  45.38 
 
 
246 aa  156  3e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.520104  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0200  Clp domain protein  38.8 
 
 
282 aa  147  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009340  Mflv_5590  Clp N terminal domain-containing protein  36.6 
 
 
246 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05080  ATPase with chaperone activity, ATP-binding subunit  40.14 
 
 
858 aa  98.2  9e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0595  ATPase AAA-2 domain protein  37.74 
 
 
851 aa  98.2  9e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.190948  normal  0.0636488 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0449  ATPase AAA-2 domain protein  40.14 
 
 
842 aa  98.2  1e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.673117 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2876  ATPase  39.46 
 
 
830 aa  96.3  4e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4992  ATPase AAA-2 domain protein  39.46 
 
 
836 aa  96.3  4e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.384287  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3055  ATPase AAA-2 domain protein  38.78 
 
 
858 aa  95.9  5e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0115492 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9148  class III stress response-related ATPase  38.78 
 
 
835 aa  95.5  6e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0335  ATPase AAA-2 domain protein  39.73 
 
 
852 aa  95.5  6e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00535143  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3416  ATPase AAA-2 domain-containing protein  38.78 
 
 
834 aa  95.5  6e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4383  ATPase AAA-2  38.78 
 
 
834 aa  95.5  7e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.388012 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6311  ATPase AAA-2 domain-containing protein  38.78 
 
 
854 aa  95.5  7e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8371  ATPase AAA-2 domain protein  40 
 
 
850 aa  95.1  7e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0862  ATPase AAA-2 domain protein  38.78 
 
 
848 aa  95.1  8e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0856425  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0573  ATPase AAA-2 domain protein  38.78 
 
 
855 aa  95.1  8e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2192  ATPase  38.78 
 
 
836 aa  95.1  9e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.158504  normal  0.0967388 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0190  ATPase  38.78 
 
 
834 aa  95.1  9e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.362734 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0641  ATPase AAA-2 domain protein  38.78 
 
 
841 aa  94.7  1e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0363  ATPase AAA-2 domain protein  38.1 
 
 
852 aa  94.4  1e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35440  ATPase with chaperone activity, ATP-binding subunit  38.78 
 
 
851 aa  94.4  1e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0220  ATPase  38.78 
 
 
839 aa  94.7  1e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.230139  normal  0.171327 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4275  ATPase  38.78 
 
 
844 aa  94.7  1e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.219573 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4709  ATPase  38.78 
 
 
844 aa  94.7  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0549246  normal  0.0242772 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4475  ATPase AAA-2 domain protein  39.31 
 
 
837 aa  94  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1682  ATPase AAA-2 domain protein  39.86 
 
 
868 aa  93.6  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.167078 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1903  ATPase AAA-2 domain protein  38.67 
 
 
829 aa  93.2  3e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.847755  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4335  ATPase AAA-2 domain protein  39.46 
 
 
840 aa  93.6  3e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0857  ATPase AAA-2 domain protein  38.78 
 
 
846 aa  93.2  3e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0332  ATPase AAA-2 domain protein  38.1 
 
 
830 aa  93.2  3e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0168  ATPase  38.1 
 
 
830 aa  93.2  3e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0466  ATPase  38.78 
 
 
861 aa  92.8  4e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3404  ATPase AAA-2 domain protein  38.78 
 
 
843 aa  93.2  4e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2179  ATPase AAA-2  40.88 
 
 
834 aa  92.4  5e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.400132  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01540  ATPase with chaperone activity, ATP-binding subunit  41.67 
 
 
851 aa  92.8  5e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5358  ATPase  38.1 
 
 
847 aa  92.4  5e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.406565 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4756  ATPase AAA-2  38.1 
 
 
847 aa  92  6e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.491369  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4842  ATPase  38.1 
 
 
847 aa  92  6e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.569226  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5142  ATPase  38.1 
 
 
847 aa  92  7e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.624262  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1430  ATPase  38.1 
 
 
847 aa  92  7e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.576172  normal  0.410328 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13629  ATP-dependent protease ATP-binding subunit clpC1  38.1 
 
 
848 aa  92  7e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.1256e-30  normal  0.051762 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0181  ATPase  41.35 
 
 
812 aa  91.7  1e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.551384  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13030  ATPase with chaperone activity, ATP-binding subunit  38.78 
 
 
879 aa  90.1  3e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0171216  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1789  ATPase AAA-2  36.43 
 
 
818 aa  89  5e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.607583  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1419  ATPase AAA-2 domain protein  38 
 
 
822 aa  89  6e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1448  ATPase AAA-2 domain protein  38 
 
 
822 aa  89  6e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2367  ATPases with chaperone activity, ATP-binding subunit  37.86 
 
 
828 aa  88.6  8e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000278199  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0660  Clp protease ATP-binding subunit  38 
 
 
855 aa  87.8  1e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.562676  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0910  UvrB/UvrC protein  39.39 
 
 
823 aa  87.8  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0260  ATPase  38 
 
 
824 aa  88.2  1e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0010  ATP-binding subunit of Clp protease  40.31 
 
 
869 aa  87.8  1e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2437  ATPase AAA-2  39.39 
 
 
825 aa  87.8  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.643825 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4738  ATPase AAA-2 domain-containing protein  39.39 
 
 
824 aa  87.8  1e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14921  ClpC  38 
 
 
855 aa  87.8  1e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4704  ATPase AAA-2 domain protein  39.39 
 
 
825 aa  87.8  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.655503 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1389  ATPase  40 
 
 
843 aa  87  2e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0145089  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1627  ATPase  40.77 
 
 
846 aa  87.8  2e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0475854  normal  0.546866 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1876  ATPase AAA-2 domain protein  39.39 
 
 
821 aa  87.4  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000589067 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11791  ClpC  40.15 
 
 
843 aa  87.4  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10981  ClpC  39.39 
 
 
859 aa  86.7  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.518332  normal  0.298944 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24610  ATPase with chaperone activity, ATP-binding subunit  36.99 
 
 
866 aa  85.9  5e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1099  Clp protease ATP-binding subunit  38.67 
 
 
842 aa  85.9  5e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.372897  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11941  ClpC  38.67 
 
 
842 aa  85.9  5e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.316562  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0146  ATPase AAA-2 domain protein  36.23 
 
 
814 aa  85.1  8e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0724  negative regulator of genetic competence ClpC/MecB  42.11 
 
 
862 aa  85.1  8e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0978513 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11951  ClpC  39.39 
 
 
841 aa  85.1  9e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09911  ClpC  40 
 
 
859 aa  85.1  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3380  ATPase AAA-2  37.4 
 
 
825 aa  84  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.802803  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2763  TPR repeat-containing protein  36.88 
 
 
1711 aa  82.4  0.000000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0255  ATPase AAA-2 domain protein  38.93 
 
 
810 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.280276  normal  0.406716 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0180  ATPase  35.77 
 
 
812 aa  80.5  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0079  ATPase AAA-2 domain protein  34.46 
 
 
810 aa  80.5  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1948  ATPase AAA-2 domain protein  36.17 
 
 
812 aa  80.1  0.00000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0130841  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0083  ATPase AAA-2 domain protein  34.46 
 
 
811 aa  80.1  0.00000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.181403  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0077  negative regulator of genetic competence clpC/mecB (ATP-dependent Clp protease)  34.46 
 
 
811 aa  79.3  0.00000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0076  ATPase  33.78 
 
 
811 aa  78.6  0.00000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0081  negative regulator of genetic competence ClpC/MecB  33.78 
 
 
811 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0081  negative regulator of genetic competence ClpC/MecB  33.78 
 
 
811 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0078  negative regulator of genetic competence clpC/mecB (ATP-dependent Clp protease)  33.78 
 
 
811 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2237  ATPase AAA-2 domain protein  34.23 
 
 
854 aa  77  0.0000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0474573  normal  0.336579 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0080  negative regulator of genetic competence ClpC/MecB  33.78 
 
 
811 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.723248  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0102  negative regulator of genetic competence ClpC/MecB  33.78 
 
 
811 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0845535  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0076  ATPase  33.78 
 
 
811 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5224  negative regulator of genetic competence ClpC/MecB  33.78 
 
 
811 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000555448  unclonable  1.16962e-24 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0111  negative regulator of genetic competence ClpC/MecB  33.78 
 
 
811 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.2403  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0091  negative regulator of genetic competence ClpC/MecB  33.78 
 
 
811 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.7884e-59 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>