236 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4091 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_4091  Clp domain-containing protein  100 
 
 		 257 aa  511  1e-144  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0455898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1294  Clp domain-containing protein  64.56 
 
 		 243 aa  305  5.0000000000000004e-82  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0332728 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2497  Clp N terminal domain-containing protein  65.81 
 
 		 239 aa  296  2e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.692778  normal  0.369973 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3907  Clp N terminal domain-containing protein  63.48 
 
 		 240 aa  296  2e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.885711 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2225  Clp, N terminal  66.24 
 
 		 240 aa  291  6e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.176488  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2271  Clp N terminal domain-containing protein  66.24 
 
 		 240 aa  291  6e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2214  Clp N terminal domain-containing protein  66.24 
 
 		 240 aa  291  6e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.574995  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22280  Clp amino terminal domain-containing protein  64.38 
 
 		 233 aa  291  8e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0209584  normal  0.311061 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1344  Clp N terminal domain-containing protein  65.2 
 
 		 243 aa  290  2e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5168  Clp domain protein  64 
 
 		 237 aa  283  3.0000000000000004e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12682  ATP-dependent protease ATP-binding subunit clpC2  64.02 
 
 		 252 aa  266  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0325769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0610  Clp domain protein  50 
 
 		 242 aa  200  1.9999999999999998e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5711  Clp domain protein  47.23 
 
 		 240 aa  177  1e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2160  Clp domain-containing protein  46.19 
 
 		 246 aa  151  8e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.520104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0200  Clp domain protein  38.55 
 
 		 282 aa  149  3e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009340  Mflv_5590  Clp N terminal domain-containing protein  35.68 
 
 		 246 aa  130  3e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1903  ATPase AAA-2 domain protein  43.12 
 
 		 829 aa  105  6e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.847755  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0595  ATPase AAA-2 domain protein  38.96 
 
 		 851 aa  104  1e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.190948  normal  0.0636488 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01540  ATPase with chaperone activity, ATP-binding subunit  40.85 
 
 		 851 aa  103  2e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13030  ATPase with chaperone activity, ATP-binding subunit  41.72 
 
 		 879 aa  104  2e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0171216  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05080  ATPase with chaperone activity, ATP-binding subunit  42.25 
 
 		 858 aa  102  7e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0449  ATPase AAA-2 domain protein  42.25 
 
 		 842 aa  102  7e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.673117 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0332  ATPase AAA-2 domain protein  38.12 
 
 		 830 aa  102  8e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4475  ATPase AAA-2 domain protein  39.26 
 
 		 837 aa  100  3e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0363  ATPase AAA-2 domain protein  39.02 
 
 		 852 aa  100  3e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0168  ATPase  39.07 
 
 		 830 aa  99.8  4e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6311  ATPase AAA-2 domain-containing protein  37.5 
 
 		 854 aa  99  6e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8371  ATPase AAA-2 domain protein  40.85 
 
 		 850 aa  99  7e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24610  ATPase with chaperone activity, ATP-binding subunit  37.58 
 
 		 866 aa  98.6  9e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0335  ATPase AAA-2 domain protein  37.42 
 
 		 852 aa  98.2  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00535143  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4335  ATPase AAA-2 domain protein  40.85 
 
 		 840 aa  97.8  1e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2876  ATPase  40.43 
 
 		 830 aa  97.4  2e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0641  ATPase AAA-2 domain protein  40.14 
 
 		 841 aa  97.4  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0220  ATPase  40.14 
 
 		 839 aa  97.4  2e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.230139  normal  0.171327 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4275  ATPase  40.14 
 
 		 844 aa  97.4  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.219573 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4992  ATPase AAA-2 domain protein  40.43 
 
 		 836 aa  97.8  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.384287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2192  ATPase  40.14 
 
 		 836 aa  97.4  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.158504  normal  0.0967388 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4709  ATPase  40.14 
 
 		 844 aa  97.4  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0549246  normal  0.0242772 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3404  ATPase AAA-2 domain protein  38.41 
 
 		 843 aa  96.7  4e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35440  ATPase with chaperone activity, ATP-binding subunit  39.44 
 
 		 851 aa  96.3  5e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0010  ATP-binding subunit of Clp protease  41.73 
 
 		 869 aa  95.9  5e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3416  ATPase AAA-2 domain-containing protein  39.72 
 
 		 834 aa  95.9  6e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9148  class III stress response-related ATPase  39.72 
 
 		 835 aa  95.9  6e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2179  ATPase AAA-2  39.87 
 
 		 834 aa  95.5  8e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.400132  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0862  ATPase AAA-2 domain protein  39.44 
 
 		 848 aa  95.1  9e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0856425  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3055  ATPase AAA-2 domain protein  39.44 
 
 		 858 aa  95.1  9e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0115492 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4383  ATPase AAA-2  39.44 
 
 		 834 aa  95.1  1e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.388012 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0573  ATPase AAA-2 domain protein  39.44 
 
 		 855 aa  94.7  1e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0466  ATPase  39.44 
 
 		 861 aa  95.1  1e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0190  ATPase  39.44 
 
 		 834 aa  95.1  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.362734 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0857  ATPase AAA-2 domain protein  37.34 
 
 		 846 aa  94  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1682  ATPase AAA-2 domain protein  37.06 
 
 		 868 aa  93.6  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.167078 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4756  ATPase AAA-2  38.03 
 
 		 847 aa  93.2  4e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.491369  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4842  ATPase  38.03 
 
 		 847 aa  93.2  4e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.569226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5358  ATPase  38.03 
 
 		 847 aa  93.2  4e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.406565 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5142  ATPase  38.03 
 
 		 847 aa  93.2  4e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.624262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1430  ATPase  38.03 
 
 		 847 aa  93.2  4e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.576172  normal  0.410328 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13629  ATP-dependent protease ATP-binding subunit clpC1  38.03 
 
 		 848 aa  92.8  5e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.1256e-30  normal  0.051762 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0724  negative regulator of genetic competence ClpC/MecB  35.9 
 
 		 862 aa  92.4  7e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0978513 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3380  ATPase AAA-2  33.56 
 
 		 825 aa  83.2  0.000000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.802803  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1948  ATPase AAA-2 domain protein  35.53 
 
 		 812 aa  83.2  0.000000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0130841  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0146  ATPase AAA-2 domain protein  32.03 
 
 		 814 aa  82.4  0.000000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0181  ATPase  36.62 
 
 		 812 aa  82.4  0.000000000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.551384  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0077  negative regulator of genetic competence clpC/mecB (ATP-dependent Clp protease)  33.12 
 
 		 811 aa  82  0.000000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0260  ATPase  32.5 
 
 		 824 aa  81.6  0.00000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1419  ATPase AAA-2 domain protein  34.38 
 
 		 822 aa  81.6  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1448  ATPase AAA-2 domain protein  34.38 
 
 		 822 aa  81.6  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0081  negative regulator of genetic competence ClpC/MecB  33.12 
 
 		 811 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0081  negative regulator of genetic competence ClpC/MecB  33.12 
 
 		 811 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0078  negative regulator of genetic competence clpC/mecB (ATP-dependent Clp protease)  33.12 
 
 		 811 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0910  UvrB/UvrC protein  32.5 
 
 		 823 aa  80.5  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0080  negative regulator of genetic competence ClpC/MecB  33.12 
 
 		 811 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.723248  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0091  negative regulator of genetic competence ClpC/MecB  33.12 
 
 		 811 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.7884e-59 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0102  negative regulator of genetic competence ClpC/MecB  33.12 
 
 		 811 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0845535  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0111  negative regulator of genetic competence ClpC/MecB  33.12 
 
 		 811 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.2403  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0079  ATPase AAA-2 domain protein  33.54 
 
 		 810 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0076  ATPase  33.12 
 
 		 811 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2367  ATPases with chaperone activity, ATP-binding subunit  36.64 
 
 		 828 aa  80.1  0.00000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000278199  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1876  ATPase AAA-2 domain protein  33.75 
 
 		 821 aa  80.1  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000589067 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09911  ClpC  34.75 
 
 		 859 aa  80.5  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2237  ATPase AAA-2 domain protein  34.44 
 
 		 854 aa  80.5  0.00000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0474573  normal  0.336579 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4738  ATPase AAA-2 domain-containing protein  33.75 
 
 		 824 aa  80.5  0.00000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1627  ATPase  34.75 
 
 		 846 aa  79.7  0.00000000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0475854  normal  0.546866 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2763  TPR repeat-containing protein  34.75 
 
 		 1711 aa  79.7  0.00000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1389  ATPase  34.75 
 
 		 843 aa  79.3  0.00000000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0145089  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5224  negative regulator of genetic competence ClpC/MecB  32.5 
 
 		 811 aa  79.3  0.00000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000555448  unclonable  1.16962e-24 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00870  ATPase AAA-2 domain protein  30.26 
 
 		 806 aa  79.3  0.00000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000509164  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2437  ATPase AAA-2  32.5 
 
 		 825 aa  79.3  0.00000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.643825 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11791  ClpC  34.19 
 
 		 843 aa  79  0.00000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4704  ATPase AAA-2 domain protein  33.12 
 
 		 825 aa  79  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.655503 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14921  ClpC  34.18 
 
 		 855 aa  78.6  0.00000000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0660  Clp protease ATP-binding subunit  34.18 
 
 		 855 aa  78.6  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.562676  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0255  ATPase AAA-2 domain protein  36.36 
 
 		 810 aa  77.8  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.280276  normal  0.406716 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0076  ATPase  31.87 
 
 		 811 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10981  ClpC  34.04 
 
 		 859 aa  77  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.518332  normal  0.298944 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0083  ATPase AAA-2 domain protein  31.65 
 
 		 811 aa  76.6  0.0000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.181403  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0180  ATPase  32.62 
 
 		 812 aa  75.9  0.0000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11951  ClpC  33.55 
 
 		 841 aa  75.5  0.0000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1789  ATPase AAA-2  33.63 
 
 		 818 aa  75.1  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.607583  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1099  Clp protease ATP-binding subunit  32.62 
 
 		 842 aa  74.3  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.372897  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>