275 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12682 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_12682  ATP-dependent protease ATP-binding subunit clpC2  100 
 
 		 252 aa  501  1e-141  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0325769  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2225  Clp, N terminal  71.37 
 
 		 240 aa  320  9.999999999999999e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.176488  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2271  Clp N terminal domain-containing protein  71.37 
 
 		 240 aa  320  9.999999999999999e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2214  Clp N terminal domain-containing protein  71.37 
 
 		 240 aa  320  9.999999999999999e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.574995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4091  Clp domain-containing protein  62.7 
 
 		 257 aa  317  1e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0455898  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2497  Clp N terminal domain-containing protein  60 
 
 		 239 aa  276  3e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.692778  normal  0.369973 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3907  Clp N terminal domain-containing protein  59.83 
 
 		 240 aa  273  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.885711 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1294  Clp domain-containing protein  60.25 
 
 		 243 aa  273  2.0000000000000002e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0332728 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5168  Clp domain protein  61.4 
 
 		 237 aa  270  1e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22280  Clp amino terminal domain-containing protein  61.4 
 
 		 233 aa  263  3e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0209584  normal  0.311061 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1344  Clp N terminal domain-containing protein  60.53 
 
 		 243 aa  260  1e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0610  Clp domain protein  47.95 
 
 		 242 aa  191  9e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5711  Clp domain protein  43.48 
 
 		 240 aa  161  8.000000000000001e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0200  Clp domain protein  44.7 
 
 		 282 aa  155  5.0000000000000005e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2160  Clp domain-containing protein  46.31 
 
 		 246 aa  147  1.0000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.520104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009340  Mflv_5590  Clp N terminal domain-containing protein  33.82 
 
 		 246 aa  115  7.999999999999999e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01540  ATPase with chaperone activity, ATP-binding subunit  40.25 
 
 		 851 aa  99.4  5e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6311  ATPase AAA-2 domain-containing protein  38.99 
 
 		 854 aa  99  7e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0332  ATPase AAA-2 domain protein  38.04 
 
 		 830 aa  97.4  2e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0449  ATPase AAA-2 domain protein  38.96 
 
 		 842 aa  97.4  2e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.673117 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0168  ATPase  38.96 
 
 		 830 aa  96.3  4e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05080  ATPase with chaperone activity, ATP-binding subunit  39.74 
 
 		 858 aa  95.5  6e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0573  ATPase AAA-2 domain protein  38.36 
 
 		 855 aa  95.5  6e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3416  ATPase AAA-2 domain-containing protein  40.13 
 
 		 834 aa  95.5  7e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0595  ATPase AAA-2 domain protein  37.42 
 
 		 851 aa  95.1  9e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.190948  normal  0.0636488 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0466  ATPase  38.51 
 
 		 861 aa  94.7  1e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13629  ATP-dependent protease ATP-binding subunit clpC1  38.96 
 
 		 848 aa  94.7  1e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.1256e-30  normal  0.051762 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4709  ATPase  38.96 
 
 		 844 aa  94  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0549246  normal  0.0242772 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9148  class III stress response-related ATPase  38.96 
 
 		 835 aa  94  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2192  ATPase  38.85 
 
 		 836 aa  94  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.158504  normal  0.0967388 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4756  ATPase AAA-2  38.31 
 
 		 847 aa  94  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.491369  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4842  ATPase  38.31 
 
 		 847 aa  94  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.569226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5142  ATPase  38.31 
 
 		 847 aa  94  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.624262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4275  ATPase  38.96 
 
 		 844 aa  94  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.219573 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0363  ATPase AAA-2 domain protein  38.31 
 
 		 852 aa  94.4  2e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0862  ATPase AAA-2 domain protein  37.5 
 
 		 848 aa  94  2e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0856425  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0641  ATPase AAA-2 domain protein  38.96 
 
 		 841 aa  94  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4383  ATPase AAA-2  37.58 
 
 		 834 aa  93.6  3e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.388012 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4335  ATPase AAA-2 domain protein  38.32 
 
 		 840 aa  93.6  3e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3055  ATPase AAA-2 domain protein  38.51 
 
 		 858 aa  92.8  4e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0115492 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0190  ATPase  39.19 
 
 		 834 aa  93.2  4e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.362734 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0857  ATPase AAA-2 domain protein  38.31 
 
 		 846 aa  93.2  4e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0220  ATPase  38.96 
 
 		 839 aa  92.8  5e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.230139  normal  0.171327 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4992  ATPase AAA-2 domain protein  38.85 
 
 		 836 aa  92.4  6e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.384287  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0335  ATPase AAA-2 domain protein  38 
 
 		 852 aa  92  8e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00535143  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1430  ATPase  38.51 
 
 		 847 aa  92  8e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.576172  normal  0.410328 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2876  ATPase  39.35 
 
 		 830 aa  91.7  9e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35440  ATPase with chaperone activity, ATP-binding subunit  38.31 
 
 		 851 aa  92  9e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5358  ATPase  38.51 
 
 		 847 aa  92  9e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.406565 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4475  ATPase AAA-2 domain protein  38.06 
 
 		 837 aa  91.7  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1682  ATPase AAA-2 domain protein  44.44 
 
 		 868 aa  91.7  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.167078 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1903  ATPase AAA-2 domain protein  39.61 
 
 		 829 aa  91.3  2e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.847755  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8371  ATPase AAA-2 domain protein  38.78 
 
 		 850 aa  90.9  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3404  ATPase AAA-2 domain protein  37.5 
 
 		 843 aa  89.4  6e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0724  negative regulator of genetic competence ClpC/MecB  35.9 
 
 		 862 aa  88.2  1e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0978513 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13030  ATPase with chaperone activity, ATP-binding subunit  37.66 
 
 		 879 aa  88.6  1e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0171216  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0010  ATP-binding subunit of Clp protease  34.76 
 
 		 869 aa  87.4  2e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24610  ATPase with chaperone activity, ATP-binding subunit  35.93 
 
 		 866 aa  85.9  5e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2179  ATPase AAA-2  41.88 
 
 		 834 aa  83.6  0.000000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.400132  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2367  ATPases with chaperone activity, ATP-binding subunit  39.16 
 
 		 828 aa  83.6  0.000000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000278199  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3380  ATPase AAA-2  30.13 
 
 		 825 aa  81.6  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.802803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1419  ATPase AAA-2 domain protein  33.75 
 
 		 822 aa  79.3  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1448  ATPase AAA-2 domain protein  33.75 
 
 		 822 aa  79.3  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0146  ATPase AAA-2 domain protein  31.94 
 
 		 814 aa  79  0.00000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0255  ATPase AAA-2 domain protein  40.68 
 
 		 810 aa  79  0.00000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.280276  normal  0.406716 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0910  UvrB/UvrC protein  32.26 
 
 		 823 aa  78.6  0.00000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1876  ATPase AAA-2 domain protein  32.9 
 
 		 821 aa  78.2  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000589067 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0260  ATPase  31.82 
 
 		 824 aa  77  0.0000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2437  ATPase AAA-2  31.82 
 
 		 825 aa  77.4  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.643825 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4738  ATPase AAA-2 domain-containing protein  32.5 
 
 		 824 aa  76.6  0.0000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1789  ATPase AAA-2  37.5 
 
 		 818 aa  76.6  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.607583  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4704  ATPase AAA-2 domain protein  32.9 
 
 		 825 aa  77  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.655503 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0181  ATPase  37.4 
 
 		 812 aa  76.6  0.0000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.551384  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1349  ATPase AAA-2 domain protein  34.73 
 
 		 820 aa  75.5  0.0000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11951  ClpC  29.75 
 
 		 841 aa  75.5  0.0000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14921  ClpC  29.56 
 
 		 855 aa  75.1  0.0000000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0660  Clp protease ATP-binding subunit  29.56 
 
 		 855 aa  75.1  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.562676  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1389  ATPase  32.41 
 
 		 843 aa  74.7  0.000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0145089  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1627  ATPase  32.41 
 
 		 846 aa  75.1  0.000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0475854  normal  0.546866 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11791  ClpC  30.32 
 
 		 843 aa  74.7  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09911  ClpC  32.41 
 
 		 859 aa  75.1  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10981  ClpC  32.41 
 
 		 859 aa  74.7  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.518332  normal  0.298944 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00870  ATPase AAA-2 domain protein  36.13 
 
 		 806 aa  73.9  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000509164  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0327  ATPase AAA-2 domain protein  30.25 
 
 		 810 aa  74.3  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00200367  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0180  ATPase  36.13 
 
 		 812 aa  74.3  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0835  ATPase  32.39 
 
 		 816 aa  73.6  0.000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0981203  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1099  Clp protease ATP-binding subunit  30.49 
 
 		 842 aa  72.8  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.372897  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1948  ATPase AAA-2 domain protein  35.06 
 
 		 812 aa  73.2  0.000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0130841  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2678  ATPase  33.06 
 
 		 840 aa  71.2  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11941  ClpC  31.25 
 
 		 842 aa  71.2  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.316562  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0603  ATPase AAA-2 domain protein  33.33 
 
 		 852 aa  71.6  0.00000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0740742  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2763  TPR repeat-containing protein  33.09 
 
 		 1711 aa  71.2  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0076  ATPase  31.45 
 
 		 811 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6021  hypothetical protein  40.97 
 
 		 196 aa  69.7  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0818749  normal  0.455176 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5224  negative regulator of genetic competence ClpC/MecB  30.82 
 
 		 811 aa  68.9  0.00000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000555448  unclonable  1.16962e-24 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0102  negative regulator of genetic competence ClpC/MecB  30.82 
 
 		 811 aa  69.3  0.00000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0845535  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0078  negative regulator of genetic competence clpC/mecB (ATP-dependent Clp protease)  30.82 
 
 		 811 aa  68.9  0.00000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0076  ATPase  30.82 
 
 		 811 aa  68.9  0.00000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0091  negative regulator of genetic competence ClpC/MecB  30.82 
 
 		 811 aa  68.9  0.00000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.7884e-59 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0080  negative regulator of genetic competence ClpC/MecB  30.82 
 
 		 811 aa  68.9  0.00000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.723248  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>