More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6021 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_6021  hypothetical protein  100 
 
 
196 aa  380  1e-105  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0818749  normal  0.455176 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0190  ATPase  72.55 
 
 
834 aa  208  4e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.362734 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0862  ATPase AAA-2 domain protein  74.83 
 
 
848 aa  207  8e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0856425  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4383  ATPase AAA-2  74.83 
 
 
834 aa  207  9e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.388012 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0573  ATPase AAA-2 domain protein  74.65 
 
 
855 aa  206  1e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4992  ATPase AAA-2 domain protein  74.65 
 
 
836 aa  206  1e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.384287  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0335  ATPase AAA-2 domain protein  64.84 
 
 
852 aa  207  1e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00535143  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5358  ATPase  74.13 
 
 
847 aa  206  1e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.406565 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8371  ATPase AAA-2 domain protein  74.13 
 
 
850 aa  206  1e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0363  ATPase AAA-2 domain protein  74.13 
 
 
852 aa  206  2e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2876  ATPase  74.65 
 
 
830 aa  206  2e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0449  ATPase AAA-2 domain protein  74.13 
 
 
842 aa  206  2e-52  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.673117 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4475  ATPase AAA-2 domain protein  74.65 
 
 
837 aa  206  2e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4756  ATPase AAA-2  74.13 
 
 
847 aa  206  2e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.491369  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4842  ATPase  74.13 
 
 
847 aa  206  2e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.569226  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5142  ATPase  74.13 
 
 
847 aa  206  2e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.624262  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1430  ATPase  74.13 
 
 
847 aa  206  2e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.576172  normal  0.410328 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13629  ATP-dependent protease ATP-binding subunit clpC1  74.13 
 
 
848 aa  205  3e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.1256e-30  normal  0.051762 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05080  ATPase with chaperone activity, ATP-binding subunit  74.13 
 
 
858 aa  205  3e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4335  ATPase AAA-2 domain protein  73.43 
 
 
840 aa  205  3e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6311  ATPase AAA-2 domain-containing protein  62.64 
 
 
854 aa  205  3e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0857  ATPase AAA-2 domain protein  73.43 
 
 
846 aa  205  3e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0466  ATPase  74.13 
 
 
861 aa  205  3e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4275  ATPase  74.13 
 
 
844 aa  205  4e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.219573 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0641  ATPase AAA-2 domain protein  74.13 
 
 
841 aa  205  4e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4709  ATPase  74.13 
 
 
844 aa  205  4e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0549246  normal  0.0242772 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0220  ATPase  74.13 
 
 
839 aa  205  4e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.230139  normal  0.171327 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2192  ATPase  74.13 
 
 
836 aa  204  5e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.158504  normal  0.0967388 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9148  class III stress response-related ATPase  74.65 
 
 
835 aa  204  5e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35440  ATPase with chaperone activity, ATP-binding subunit  73.43 
 
 
851 aa  204  6e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3416  ATPase AAA-2 domain-containing protein  74.65 
 
 
834 aa  204  6e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0595  ATPase AAA-2 domain protein  69.28 
 
 
851 aa  203  1e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.190948  normal  0.0636488 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3055  ATPase AAA-2 domain protein  72.73 
 
 
858 aa  201  4e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0115492 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0168  ATPase  72.03 
 
 
830 aa  201  7e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0332  ATPase AAA-2 domain protein  72.03 
 
 
830 aa  200  9e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3404  ATPase AAA-2 domain protein  72.54 
 
 
843 aa  197  6e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01540  ATPase with chaperone activity, ATP-binding subunit  59.78 
 
 
851 aa  194  5.000000000000001e-49  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24610  ATPase with chaperone activity, ATP-binding subunit  68.31 
 
 
866 aa  191  4e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0724  negative regulator of genetic competence ClpC/MecB  63.46 
 
 
862 aa  191  4e-48  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0978513 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13030  ATPase with chaperone activity, ATP-binding subunit  68.35 
 
 
879 aa  187  7e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0171216  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0010  ATP-binding subunit of Clp protease  65.49 
 
 
869 aa  185  4e-46  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0660  Clp protease ATP-binding subunit  56.63 
 
 
855 aa  175  3e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.562676  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0910  UvrB/UvrC protein  62.24 
 
 
823 aa  175  3e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4738  ATPase AAA-2 domain-containing protein  60 
 
 
824 aa  175  3e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10981  ClpC  62.24 
 
 
859 aa  175  3e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.518332  normal  0.298944 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1627  ATPase  62.24 
 
 
846 aa  175  4e-43  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0475854  normal  0.546866 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0260  ATPase  62.24 
 
 
824 aa  175  4e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2437  ATPase AAA-2  62.24 
 
 
825 aa  175  4e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.643825 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4704  ATPase AAA-2 domain protein  62.24 
 
 
825 aa  175  4e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.655503 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14921  ClpC  56.63 
 
 
855 aa  175  4e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1389  ATPase  62.24 
 
 
843 aa  174  5e-43  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0145089  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1876  ATPase AAA-2 domain protein  62.24 
 
 
821 aa  175  5e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000589067 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11791  ClpC  62.24 
 
 
843 aa  174  9e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1419  ATPase AAA-2 domain protein  62.24 
 
 
822 aa  173  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1448  ATPase AAA-2 domain protein  62.24 
 
 
822 aa  173  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09911  ClpC  61.54 
 
 
859 aa  173  9.999999999999999e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1099  Clp protease ATP-binding subunit  61.54 
 
 
842 aa  172  1.9999999999999998e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.372897  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1682  ATPase AAA-2 domain protein  62.94 
 
 
868 aa  173  1.9999999999999998e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.167078 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11941  ClpC  61.54 
 
 
842 aa  172  2.9999999999999996e-42  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.316562  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11951  ClpC  61.54 
 
 
841 aa  172  2.9999999999999996e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2179  ATPase AAA-2  62.24 
 
 
834 aa  171  6.999999999999999e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.400132  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0083  ATPase AAA-2 domain protein  61.54 
 
 
811 aa  170  1e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.181403  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0079  ATPase AAA-2 domain protein  60.84 
 
 
810 aa  169  2e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0081  negative regulator of genetic competence ClpC/MecB  59.44 
 
 
811 aa  165  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0081  negative regulator of genetic competence ClpC/MecB  59.44 
 
 
811 aa  165  2.9999999999999998e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0078  negative regulator of genetic competence clpC/mecB (ATP-dependent Clp protease)  59.44 
 
 
811 aa  165  2.9999999999999998e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0076  ATPase  59.44 
 
 
811 aa  165  2.9999999999999998e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0077  negative regulator of genetic competence clpC/mecB (ATP-dependent Clp protease)  59.44 
 
 
811 aa  165  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0080  negative regulator of genetic competence ClpC/MecB  59.44 
 
 
811 aa  165  2.9999999999999998e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.723248  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0111  negative regulator of genetic competence ClpC/MecB  59.44 
 
 
811 aa  165  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.2403  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0091  negative regulator of genetic competence ClpC/MecB  59.44 
 
 
811 aa  165  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.7884e-59 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0102  negative regulator of genetic competence ClpC/MecB  59.44 
 
 
811 aa  165  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0845535  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5224  negative regulator of genetic competence ClpC/MecB  59.44 
 
 
811 aa  165  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000555448  unclonable  1.16962e-24 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0076  ATPase  58.74 
 
 
811 aa  165  5e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1948  ATPase AAA-2 domain protein  57.82 
 
 
812 aa  164  6.9999999999999995e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0130841  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0180  ATPase  56.34 
 
 
812 aa  164  6.9999999999999995e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3380  ATPase AAA-2  55.24 
 
 
825 aa  164  9e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.802803  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1349  ATPase AAA-2 domain protein  57.34 
 
 
820 aa  161  6e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1903  ATPase AAA-2 domain protein  50.79 
 
 
829 aa  159  2e-38  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.847755  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2740  ATPase AAA-2 domain protein  54.55 
 
 
812 aa  158  4e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1000  ATPase AAA-2 domain-containing protein  55.94 
 
 
815 aa  157  1e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0499037  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4348  UvrB/UvrC protein  55.24 
 
 
814 aa  154  6e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0603  ATPase AAA-2 domain protein  54.17 
 
 
852 aa  154  6e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0740742  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0181  ATPase  58.39 
 
 
812 aa  154  8e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.551384  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0146  ATPase AAA-2 domain protein  50.35 
 
 
814 aa  153  2e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2763  TPR repeat-containing protein  55.97 
 
 
1711 aa  152  4e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00870  ATPase AAA-2 domain protein  53.33 
 
 
806 aa  150  1e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000509164  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0835  ATPase  52.45 
 
 
816 aa  149  2e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0981203  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0255  ATPase AAA-2 domain protein  52.11 
 
 
810 aa  145  3e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.280276  normal  0.406716 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0561  ATPase  51.02 
 
 
818 aa  144  9e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0547  ATPase  51.02 
 
 
818 aa  144  9e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0165  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpC  51.75 
 
 
817 aa  142  4e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29402  chaperone, Hsp100 family, ClpC-type  59.44 
 
 
840 aa  141  5e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0120883  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2367  ATPases with chaperone activity, ATP-binding subunit  52.74 
 
 
828 aa  142  5e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000278199  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1789  ATPase AAA-2  46.62 
 
 
818 aa  140  8e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.607583  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1186  ATPase AAA-2 domain protein  49.01 
 
 
876 aa  139  3e-32  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.0316758 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2237  ATPase AAA-2 domain protein  47.22 
 
 
854 aa  136  2e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0474573  normal  0.336579 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2678  ATPase  51.8 
 
 
840 aa  136  2e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1526  ATPase  50 
 
 
839 aa  135  3.0000000000000003e-31  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00101266  unclonable  2.1897600000000004e-18 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1825  ATPase AAA-2 domain protein  48.28 
 
 
829 aa  134  7.000000000000001e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>