24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_02988 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_02988  hypothetical protein  100 
 
 		 112 aa  238  2e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1232  alpha/beta fold family hydrolase  33.33 
 
 		 305 aa  80.9  0.000000000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1437  alpha/beta hydrolase fold  33.64 
 
 		 320 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.872938  normal  0.0432694 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1829  alpha/beta fold family hydrolase  31.48 
 
 		 319 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.174462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1407  alpha/beta hydrolase fold  31.48 
 
 		 320 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0821941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3881  alpha/beta hydrolase fold  31.48 
 
 		 320 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00418628  normal  0.248118 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04770  alpha/beta hydrolase fold protein  32.69 
 
 		 424 aa  68.9  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000317728  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0162  alpha/beta hydrolase fold  30.48 
 
 		 321 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00601319 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0877  hypothetical protein  29.25 
 
 		 316 aa  67.8  0.00000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000690525  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07480  hypothetical protein  34.62 
 
 		 308 aa  67.4  0.00000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0100804  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1721  Alpha/beta hydrolase fold  32.95 
 
 		 317 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42770  hypothetical protein  28.97 
 
 		 327 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23740  hydrolase, alpha/beta fold family  27.1 
 
 		 317 aa  61.2  0.000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.582768  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1852  hypothetical protein  28.7 
 
 		 343 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.613868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1717  alpha/beta hydrolase fold  28.85 
 
 		 315 aa  60.8  0.000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3592  hypothetical protein  28.04 
 
 		 323 aa  58.2  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.712485  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2042  hypothetical protein  29.63 
 
 		 343 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.429785  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1881  lysophospholipase-like protein  27.93 
 
 		 330 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.27985  normal  0.592044 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1262  alpha/beta hydrolase fold  28.83 
 
 		 319 aa  54.7  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1315  alpha/beta hydrolase fold  26.85 
 
 		 320 aa  53.9  0.0000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0924774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2298  alpha/beta hydrolase fold protein  28.85 
 
 		 322 aa  52.8  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.321032  decreased coverage  0.000193345 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2263  alpha/beta hydrolase  30.19 
 
 		 315 aa  52  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.469721 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1501  Alpha/beta hydrolase  26.85 
 
 		 302 aa  45.4  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.568195  normal  0.537602 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6540  alpha/beta hydrolase fold  24.75 
 
 		 302 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.300513  normal  0.534481 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>