170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_7213 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_7213  putative dienelactone hydrolase  100 
 
 
284 aa  580  1e-164  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.125525  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0851  dienelactone hydrolase  39.42 
 
 
281 aa  209  3e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0723  dienelactone hydrolase  41.92 
 
 
281 aa  207  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0227  dienelactone hydrolase  43.27 
 
 
283 aa  122  6e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.771569 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4291  dienelactone hydrolase  41.26 
 
 
283 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.697151 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4585  dienelactone hydrolase  38.28 
 
 
275 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0150817  normal  0.0493147 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4106  dienelactone hydrolase  36.79 
 
 
275 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3572  dienelactone hydrolase  36.92 
 
 
349 aa  103  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.660184 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3249  dienelactone hydrolase  32.81 
 
 
349 aa  103  3e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3626  dienelactone hydrolase  37.02 
 
 
301 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2873  hypothetical protein  30.23 
 
 
299 aa  100  3e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1858  dienelactone hydrolase  36.32 
 
 
275 aa  98.2  1e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0385469 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2471  dienelactone hydrolase  32.5 
 
 
302 aa  97.8  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.164719  normal  0.138775 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3175  dienelactone hydrolase  35.38 
 
 
272 aa  96.3  5e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.391894  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4702  dienelactone hydrolase  35.29 
 
 
328 aa  92.8  6e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.579597  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1694  putative dienelactone hydrolase family protein  34.45 
 
 
275 aa  88.6  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.986757  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0047  dienelactone hydrolase  34.93 
 
 
356 aa  87.8  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2757  hypothetical protein  30.26 
 
 
351 aa  86.7  4e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.140498 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0072  dienelactone hydrolase  33.94 
 
 
365 aa  85.9  8e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.885053  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5282  hypothetical protein  32.67 
 
 
334 aa  82.4  0.000000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3694  dienelactone hydrolase  33.79 
 
 
321 aa  81.6  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3371  dienelactone hydrolase  34.69 
 
 
320 aa  81.3  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0643  dienelactone hydrolase  30.96 
 
 
292 aa  75.9  0.0000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.424944  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4797  hypothetical protein  30.93 
 
 
297 aa  75.1  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.252351  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4564  dienelactone hydrolase  34.08 
 
 
335 aa  73.9  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5026  hypothetical protein  29 
 
 
326 aa  72.8  0.000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4308  putative dienelactone hydrolase family protein, putative signal peptide  31.3 
 
 
308 aa  70.9  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0943242 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2269  putative dienelactone hydrolase  28.5 
 
 
266 aa  69.3  0.00000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.672728  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0055  putative signal peptide protein  34.72 
 
 
325 aa  68.6  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.250308  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2929  dienelactone hydrolase  29.06 
 
 
291 aa  67.8  0.0000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4136  carboxymethylenebutenolidase  31.44 
 
 
324 aa  64.7  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0738  dienelactone hydrolase  28.51 
 
 
270 aa  62.8  0.000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.303831  normal  0.797206 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2536  dienelactone hydrolase family protein  27.5 
 
 
270 aa  61.6  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2787  carboxymethylenebutenolidase  29.77 
 
 
254 aa  60.8  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1217  dienelactone hydrolase domain-containing protein  30.23 
 
 
310 aa  59.7  0.00000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.135691  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5814  hypothetical protein  39.64 
 
 
208 aa  58.5  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.482605  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4116  dienelactone hydrolase  29.79 
 
 
335 aa  58.5  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0198407  normal  0.0302336 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2621  dienelactone hydrolase  30.35 
 
 
265 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2665  dienelactone hydrolase  30.35 
 
 
265 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.858071  normal  0.690988 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2650  dienelactone hydrolase  30.35 
 
 
265 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0790  dienelactone hydrolase  26.67 
 
 
269 aa  57.8  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0914  dienelactone hydrolase  28 
 
 
255 aa  58.2  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.177135  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4783  hypothetical protein  26.96 
 
 
253 aa  57.4  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0661  dienelactone hydrolase  26.83 
 
 
263 aa  56.6  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5716  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  31.48 
 
 
642 aa  55.5  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3272  dienelactone hydrolase  27.32 
 
 
249 aa  55.5  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1150  dienelactone hydrolase  34.26 
 
 
254 aa  55.1  0.000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0601  dienelactone hydrolase  34.45 
 
 
259 aa  55.1  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3783  hypothetical protein  33.6 
 
 
354 aa  53.5  0.000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3085  peptidase S15  26.96 
 
 
287 aa  52.4  0.000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.918573  normal  0.256492 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3865  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  27.13 
 
 
741 aa  51.6  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2303  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  25.55 
 
 
615 aa  52  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2316  dienelactone hydrolase and related enzymes-like  29.17 
 
 
423 aa  51.2  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1592  peptidase S15  34.35 
 
 
580 aa  51.2  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00000232254  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2930  dienelactone hydrolase and related enzymes-like protein  29.17 
 
 
423 aa  51.2  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.399688  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0582  E3 binding domain protein  30.43 
 
 
467 aa  50.8  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2945  dienelactone hydrolase and related enzyme-like protein  29.24 
 
 
423 aa  51.2  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1616  dienelactone hydrolase  28.05 
 
 
263 aa  50.8  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.555158 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0896  Carboxymethylenebutenolidase  26.7 
 
 
250 aa  50.8  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0078373  unclonable  0.000000019377 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0268  putative signal peptide protein  31.38 
 
 
308 aa  50.4  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.412129  normal 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7027  hypothetical protein  26.29 
 
 
321 aa  50.4  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00368212  normal  0.0842851 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02809  dipeptidyl peptidase IV  26.91 
 
 
729 aa  50.4  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0666  dienelactone hydrolase  21.4 
 
 
284 aa  50.1  0.00004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0838  dienelactone hydrolase  32.97 
 
 
302 aa  50.1  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0341  hypothetical protein  28.89 
 
 
423 aa  50.1  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1211  hypothetical protein  32.11 
 
 
305 aa  49.7  0.00006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4176  alpha/beta superfamily hydrolase  32.11 
 
 
305 aa  49.7  0.00006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3021  peptidase S15  33.64 
 
 
292 aa  49.3  0.00007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1399  dienelactone hydrolase  25.27 
 
 
250 aa  49.3  0.00008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1165  alpha/beta superfamily hydrolase  33.03 
 
 
305 aa  49.3  0.00008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5090  dienelactone hydrolase  31.82 
 
 
215 aa  48.9  0.00009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.797701 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6131  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25.33 
 
 
667 aa  48.1  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1095  hypothetical protein  30 
 
 
253 aa  48.5  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.103267 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33270  Dienelactone hydrolase protein  26.74 
 
 
261 aa  48.1  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.669671  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0940  dienelactone hydrolase  26.87 
 
 
279 aa  48.1  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0375  dienelactone hydrolase and related enzymes-like protein  30.4 
 
 
423 aa  48.5  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.822376 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0174  hypothetical protein  27.42 
 
 
429 aa  48.5  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1241  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  35.29 
 
 
721 aa  48.5  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.349009  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0127  putative signal peptide protein  37.61 
 
 
311 aa  48.5  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.498965  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1264  dienelactone hydrolase domain protein  32.11 
 
 
305 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3656  dienelactone hydrolase  27.27 
 
 
263 aa  47.8  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2478  hypothetical protein  31.58 
 
 
442 aa  47.4  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.991617 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0914  dienelactone hydrolase  26.21 
 
 
263 aa  47.4  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2905  putative hydrolase  28.03 
 
 
512 aa  47.4  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.212149  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2817  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.57 
 
 
822 aa  47  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4133  dienelactone hydrolase  26.5 
 
 
237 aa  47  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.850524  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1951  dienelactone hydrolase  24.58 
 
 
291 aa  47  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3161  putative hydrolase  28.79 
 
 
512 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1803  dienelactone hydrolase family protein  31.68 
 
 
239 aa  46.6  0.0004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.100178  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0119  conserved hypothetical signal peptide protein  28.77 
 
 
312 aa  46.6  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7591  alpha/beta fold family hydrolase  34.78 
 
 
301 aa  46.6  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2079  putative hydrolase  28.79 
 
 
512 aa  46.6  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0787  dienelactone hydrolase family protein  24.52 
 
 
356 aa  46.2  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.307266  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0039  conserved hypothetical signal peptide protein  35 
 
 
355 aa  46.6  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2249  peptidase S15  32.14 
 
 
474 aa  46.6  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000310265  normal  0.111012 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2886  hypothetical protein  31.53 
 
 
301 aa  46.2  0.0005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3018  hypothetical protein  29.69 
 
 
338 aa  46.2  0.0006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.277726  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0236  fermentation/respiration switch protein  25.88 
 
 
414 aa  46.2  0.0006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0612  dienelactone hydrolase family protein  24.52 
 
 
243 aa  46.2  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0597  dienelactone hydrolase family protein  24.52 
 
 
243 aa  45.8  0.0007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>