25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0738 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0738  dienelactone hydrolase  100 
 
 		 270 aa  551  1e-156  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.303831  normal  0.797206 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4783  hypothetical protein  29.61 
 
 		 253 aa  67  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2929  dienelactone hydrolase  31.2 
 
 		 291 aa  62.8  0.000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7213  putative dienelactone hydrolase  28.51 
 
 		 284 aa  62.8  0.000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.125525  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3371  dienelactone hydrolase  29.96 
 
 		 320 aa  60.1  0.00000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0851  dienelactone hydrolase  27.6 
 
 		 281 aa  59.7  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0227  dienelactone hydrolase  29.76 
 
 		 283 aa  59.7  0.00000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.771569 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3694  dienelactone hydrolase  29.54 
 
 		 321 aa  58.5  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0643  dienelactone hydrolase  28.98 
 
 		 292 aa  58.5  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.424944  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0723  dienelactone hydrolase  26.94 
 
 		 281 aa  57  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1217  dienelactone hydrolase domain-containing protein  29.35 
 
 		 310 aa  54.3  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.135691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4308  putative dienelactone hydrolase family protein, putative signal peptide  27.44 
 
 		 308 aa  53.1  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0943242 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4106  dienelactone hydrolase  27.76 
 
 		 275 aa  52  0.000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4585  dienelactone hydrolase  28.71 
 
 		 275 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0150817  normal  0.0493147 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0072  dienelactone hydrolase  29.21 
 
 		 365 aa  50.8  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.885053  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1694  putative dienelactone hydrolase family protein  24.04 
 
 		 275 aa  50.1  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.986757  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0047  dienelactone hydrolase  27.88 
 
 		 356 aa  49.3  0.00007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2873  hypothetical protein  23.2 
 
 		 299 aa  48.1  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5282  hypothetical protein  27.7 
 
 		 334 aa  47  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4702  dienelactone hydrolase  25.1 
 
 		 328 aa  46.6  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.579597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4503  putative carboxymethylenebutenolidase  28.66 
 
 		 258 aa  43.9  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.247167  normal  0.813173 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5026  hypothetical protein  27.32 
 
 		 326 aa  43.1  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1858  dienelactone hydrolase  24.69 
 
 		 275 aa  43.1  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0385469 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4564  dienelactone hydrolase  27.37 
 
 		 335 aa  42.7  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4291  dienelactone hydrolase  31.58 
 
 		 283 aa  42.4  0.008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.697151 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>