249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_4503 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_4503  putative carboxymethylenebutenolidase  100 
 
 		 258 aa  514  1.0000000000000001e-145  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.247167  normal  0.813173 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0171  dienelactone hydrolase  33.66 
 
 		 234 aa  93.2  3e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.946862  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0091  dienelactone hydrolase  34.16 
 
 		 234 aa  92.4  7e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.334688  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1173  dienelactone hydrolase  28.64 
 
 		 197 aa  76.3  0.0000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2787  carboxymethylenebutenolidase  26.25 
 
 		 254 aa  72.4  0.000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5090  dienelactone hydrolase  31.72 
 
 		 215 aa  72.4  0.000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.797701 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4585  dienelactone hydrolase  32.27 
 
 		 275 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0150817  normal  0.0493147 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4876  carboxymethylenebutenolidase  29.69 
 
 		 254 aa  67  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.21455 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2805  Carboxymethylenebutenolidase  26.39 
 
 		 290 aa  65.9  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.103542  normal  0.354876 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3312  Carboxymethylenebutenolidase  26.27 
 
 		 290 aa  65.5  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2733  carboxymethylenebutenolidase  29.28 
 
 		 290 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.193118 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4106  dienelactone hydrolase  26.89 
 
 		 275 aa  63.2  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3058  carboxymethylenebutenolidase, putative  29.49 
 
 		 242 aa  63.2  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.566276 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1199  Carboxymethylenebutenolidase  25.94 
 
 		 214 aa  62.8  0.000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1987  twin-arginine translocation pathway signal  28.24 
 
 		 291 aa  62  0.000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1898  Carboxymethylenebutenolidase  25.91 
 
 		 292 aa  61.6  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.668e-17 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3245  carboxymethylenebutenolidase  27.59 
 
 		 291 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0210034 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1951  dienelactone hydrolase  27.73 
 
 		 291 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2140  Carboxymethylenebutenolidase  31.25 
 
 		 291 aa  60.1  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.324009 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1804  carboxymethylenebutenolidase  32.03 
 
 		 291 aa  60.5  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.692278  normal  0.911676 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1445  carboxymethylenebutenolidase  27.31 
 
 		 246 aa  59.7  0.00000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.80402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0243  carboxymethylenebutenolidase  30.47 
 
 		 278 aa  59.7  0.00000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.110111 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1016  Carboxymethylenebutenolidase  32.69 
 
 		 250 aa  58.9  0.00000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.387888 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2055  dienelactone hydrolase  26.05 
 
 		 251 aa  58.5  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.731615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2216  dienelactone hydrolase  29.23 
 
 		 291 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.60917  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4070  Carboxymethylenebutenolidase  29.69 
 
 		 275 aa  58.2  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1783  Carboxymethylenebutenolidase  30.77 
 
 		 227 aa  58.2  0.0000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0841  dienelactone hydrolase  30.33 
 
 		 228 aa  57.8  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.540975  normal  0.335069 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2684  dienelactone hydrolase  26.87 
 
 		 237 aa  57.8  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0227  dienelactone hydrolase  26.67 
 
 		 283 aa  57  0.0000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.771569 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3285  Carboxymethylenebutenolidase  28.91 
 
 		 280 aa  57  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4491  twin-arginine translocation pathway signal  29.23 
 
 		 291 aa  57  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3647  dienelactone hydrolase family protein  24.66 
 
 		 290 aa  57  0.0000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3874  carboxymethylenebutenolidase  29.23 
 
 		 291 aa  57  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.630972  normal  0.609004 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3963  carboxymethylenebutenolidase  27.03 
 
 		 268 aa  56.6  0.0000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.141261 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3653  carboxymethylenebutenolidase  29.23 
 
 		 291 aa  57  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.19765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0790  dienelactone hydrolase  26.32 
 
 		 269 aa  56.2  0.0000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0609  carboxymethylenebutenolidase  31.78 
 
 		 290 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7870  putative carboxymethylenebutenolidase  33.1 
 
 		 223 aa  56.6  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4825  carboxymethylenebutenolidase  29.23 
 
 		 291 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00463404  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2276  Carboxymethylenebutenolidase  38.26 
 
 		 234 aa  56.6  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0914  dienelactone hydrolase  27.89 
 
 		 263 aa  56.2  0.0000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2724  twin-arginine translocation pathway signal  27.78 
 
 		 299 aa  56.2  0.0000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.368309 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1756  Carboxymethylenebutenolidase  31.75 
 
 		 291 aa  56.2  0.0000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4149  Carboxymethylenebutenolidase  24.43 
 
 		 271 aa  55.8  0.0000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2806  dienelactone hydrolase family protein  25 
 
 		 295 aa  55.8  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.614525  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3771  carboxymethylenebutenolidase  26.29 
 
 		 291 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0116114 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3951  carboxymethylenebutenolidase  24.66 
 
 		 290 aa  55.8  0.0000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0265  dienelactone hydrolase family protein  24.66 
 
 		 290 aa  55.8  0.0000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4353  Carboxymethylenebutenolidase  28.91 
 
 		 275 aa  56.2  0.0000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4054  dienelactone hydrolase family protein  24.43 
 
 		 271 aa  55.8  0.0000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1245  dienelactone hydrolase  25.24 
 
 		 261 aa  55.8  0.0000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00955102  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0949  Carboxymethylenebutenolidase  29.22 
 
 		 261 aa  55.5  0.0000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00366545  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4351  dienelactone hydrolase family protein  24.43 
 
 		 271 aa  55.5  0.0000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4230  phospholipase/Carboxylesterase  41.57 
 
 		 268 aa  55.5  0.0000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.58568  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4178  carboxymethylenebutenolidase  24.43 
 
 		 271 aa  55.5  0.0000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0221316 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4302  dienelactone hydrolase family protein  27.08 
 
 		 270 aa  55.5  0.0000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03717  predicted hydrolase  24.43 
 
 		 269 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00397  carboxylesterase  27.75 
 
 		 309 aa  55.1  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03666  hypothetical protein  24.43 
 
 		 267 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5271  dienelactone hydrolase family protein  24.43 
 
 		 271 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.198587 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4562  Carboxymethylenebutenolidase  26.05 
 
 		 297 aa  54.7  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.546274  normal  0.125824 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5319  Carboxymethylenebutenolidase  33.33 
 
 		 223 aa  55.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.319881  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1943  carboxymethylenebutenolidase  35.66 
 
 		 302 aa  54.7  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0524201  normal  0.0241824 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0283  carboxymethylenebutenolidase  37.19 
 
 		 222 aa  55.1  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4247  dienelactone hydrolase  25.23 
 
 		 291 aa  54.3  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.750594  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4294  dienelactone hydrolase  25.23 
 
 		 291 aa  54.3  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4198  dienelactone hydrolase  25.23 
 
 		 291 aa  54.3  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2042  carboxymethylenebutenolidase  32.03 
 
 		 291 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000295478 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4206  dienelactone hydrolase family protein  24.43 
 
 		 269 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000877073 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4175  dienelactone hydrolase  25.23 
 
 		 291 aa  54.3  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2198  dienelactone hydrolase  26.87 
 
 		 252 aa  54.3  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0102291  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3130  Carboxymethylenebutenolidase  30.59 
 
 		 296 aa  53.9  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3409  carboxymethylenebutenolidase  25.91 
 
 		 295 aa  54.3  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0324  carboxymethylenebutenolidase  30 
 
 		 256 aa  53.5  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4024  twin-arginine translocation pathway signal  26.19 
 
 		 278 aa  53.5  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0848  carboxymethylenebutenolidase  30 
 
 		 291 aa  53.5  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2540  carboxymethylenebutenolidase  30 
 
 		 339 aa  53.5  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2398  carboxymethylenebutenolidase  30 
 
 		 339 aa  53.9  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5221  putative carboxymethylenebutenolidase precursor (dienelactone hydrolase  28.91 
 
 		 270 aa  53.1  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0554108  normal  0.200336 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0186  Carboxymethylenebutenolidase  28.12 
 
 		 275 aa  53.1  0.000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0181  twin-arginine translocation pathway signal  26.06 
 
 		 291 aa  53.5  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.972702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1342  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  24.16 
 
 		 299 aa  53.1  0.000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.38743  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5769  carboxymethylenebutenolidase  33.59 
 
 		 295 aa  53.1  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3272  dienelactone hydrolase  28.42 
 
 		 249 aa  53.1  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1506  carboxymethylenebutenolidase  30 
 
 		 291 aa  53.1  0.000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.893969  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1700  carboxymethylenebutenolidase  30 
 
 		 291 aa  53.1  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0358  carboxymethylenebutenolidase  30 
 
 		 291 aa  53.1  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3399  phospholipase/Carboxylesterase  38.89 
 
 		 886 aa  52.8  0.000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0843548  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3874  dienelactone hydrolase  27.8 
 
 		 244 aa  52.8  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0470688  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2832  dienelactone hydrolase  24.61 
 
 		 290 aa  52.4  0.000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4421  carboxymethylenebutenolidase  29.46 
 
 		 290 aa  52.4  0.000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.842964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0381  carboxymethylenebutenolidase  29.49 
 
 		 291 aa  52  0.000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0738  dienelactone hydrolase  26.91 
 
 		 270 aa  51.2  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.303831  normal  0.797206 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1858  dienelactone hydrolase  27.4 
 
 		 275 aa  51.6  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0385469 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3327  carboxymethylenebutenolidase  26.97 
 
 		 295 aa  52  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0147  dienelactone hydrolase  31.75 
 
 		 227 aa  51.6  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2091  carboxymethylenebutenolidase  27.96 
 
 		 303 aa  52  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.449099  normal  0.243646 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0969  carboxymethylenebutenolidase  26.19 
 
 		 275 aa  51.2  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.35084  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6786  Carboxymethylenebutenolidase  23.94 
 
 		 294 aa  50.8  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00592953  hitchhiker  0.00000947309 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>