289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0171 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010172  Mext_0171  dienelactone hydrolase  100 
 
 
234 aa  463  9.999999999999999e-131  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.946862  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0091  dienelactone hydrolase  87.61 
 
 
234 aa  395  1e-109  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.334688  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5090  dienelactone hydrolase  69.51 
 
 
215 aa  285  5e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.797701 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1173  dienelactone hydrolase  40.93 
 
 
197 aa  141  9.999999999999999e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4503  putative carboxymethylenebutenolidase  33.66 
 
 
258 aa  83.6  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.247167  normal  0.813173 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2055  dienelactone hydrolase  26.05 
 
 
251 aa  66.2  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.731615  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2787  carboxymethylenebutenolidase  27.8 
 
 
254 aa  66.2  0.0000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1245  dienelactone hydrolase  28.57 
 
 
261 aa  63.5  0.000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00955102  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1616  dienelactone hydrolase  29.26 
 
 
263 aa  62  0.000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.555158 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5221  putative carboxymethylenebutenolidase precursor (dienelactone hydrolase  35.71 
 
 
270 aa  60.5  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0554108  normal  0.200336 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0248  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  40.91 
 
 
631 aa  57.8  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0170  dienelactone hydrolase  30.77 
 
 
246 aa  58.2  0.0000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000135133  normal  0.545513 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3085  peptidase S15  27.8 
 
 
287 aa  58.2  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.918573  normal  0.256492 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1112  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.22 
 
 
656 aa  57.8  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.245577  normal  0.568355 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1898  Carboxymethylenebutenolidase  25.69 
 
 
292 aa  57.4  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.668e-17 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3694  dienelactone hydrolase  30.48 
 
 
321 aa  57.8  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3272  dienelactone hydrolase  28.57 
 
 
249 aa  56.2  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3795  esterase/lipase  25 
 
 
300 aa  55.5  0.0000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.662401  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3247  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  25.38 
 
 
324 aa  55.5  0.0000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0661  dienelactone hydrolase  24.12 
 
 
263 aa  55.5  0.0000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3371  dienelactone hydrolase  28.5 
 
 
320 aa  54.7  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6131  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25.74 
 
 
667 aa  54.3  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0790  dienelactone hydrolase  26.09 
 
 
269 aa  54.3  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0914  dienelactone hydrolase  22.99 
 
 
263 aa  53.9  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0594  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  22.46 
 
 
623 aa  54.3  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0347  dienelactone hydrolase  25.27 
 
 
262 aa  53.1  0.000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.971139  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3173  esterase YpfH  31.06 
 
 
205 aa  53.1  0.000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0181  twin-arginine translocation pathway signal  31.03 
 
 
291 aa  52.8  0.000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.972702  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1922  phospholipase/Carboxylesterase  33.33 
 
 
231 aa  52.4  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2281  dienelactone hydrolase  26.67 
 
 
245 aa  52  0.000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00187081 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3407  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  23.22 
 
 
680 aa  52  0.000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1790  dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase-like protein  40.22 
 
 
537 aa  52  0.000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0734041  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0640  Alpha/beta hydrolase  38.36 
 
 
303 aa  52  0.000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.225482 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0304  putative lipase  22.65 
 
 
334 aa  52  0.000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.726693  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3301  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.04 
 
 
829 aa  52  0.000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0243  carboxymethylenebutenolidase  25.81 
 
 
278 aa  51.6  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.110111 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1948  phospholipase/Carboxylesterase  32.79 
 
 
231 aa  51.2  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00810  prolyl oligopeptidase family protein  32.14 
 
 
345 aa  51.6  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3350  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  43.94 
 
 
716 aa  51.6  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.996189  normal  0.0472619 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0498  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  46.94 
 
 
575 aa  50.4  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0154886  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2724  phospholipase/carboxylesterase  36.36 
 
 
237 aa  50.8  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.124054  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0807  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.43 
 
 
827 aa  50.4  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000293911  hitchhiker  0.00280594 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0299  lipase, putative  21.79 
 
 
334 aa  50.8  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1805  dienelactone hydrolase  29.35 
 
 
245 aa  50.4  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.341986  normal  0.0741289 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1266  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25.54 
 
 
631 aa  50.1  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.211135  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4175  dienelactone hydrolase  27.83 
 
 
291 aa  50.1  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2303  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  23.53 
 
 
615 aa  50.4  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0265  dienelactone hydrolase family protein  28.57 
 
 
290 aa  50.4  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0312  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  40 
 
 
588 aa  50.1  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4294  dienelactone hydrolase  27.83 
 
 
291 aa  50.1  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0056  putative esterase  21.92 
 
 
317 aa  50.1  0.00003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.728822  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4247  dienelactone hydrolase  27.83 
 
 
291 aa  50.1  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.750594  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3504  esterase YpfH  27.66 
 
 
229 aa  50.1  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4659  dienelactone hydrolase  22.28 
 
 
257 aa  50.1  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3647  dienelactone hydrolase family protein  28.57 
 
 
290 aa  50.1  0.00003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3951  carboxymethylenebutenolidase  28.57 
 
 
290 aa  50.4  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4214  hypothetical protein  26.63 
 
 
262 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4730  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  27.23 
 
 
288 aa  50.1  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.788247  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4198  dienelactone hydrolase  27.83 
 
 
291 aa  50.1  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2536  dienelactone hydrolase family protein  26.04 
 
 
270 aa  49.7  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4302  dienelactone hydrolase family protein  27.83 
 
 
270 aa  49.7  0.00004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4232  dienelactone hydrolase  26 
 
 
263 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.215176  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02838  conserved hypothetical protein  33.64 
 
 
366 aa  49.3  0.00005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.002534  hitchhiker  0.00464158 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0943  Carboxymethylenebutenolidase  28.85 
 
 
287 aa  49.3  0.00005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00110752 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0755  peptidase, putative  24.53 
 
 
688 aa  49.3  0.00005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0851  dienelactone hydrolase  26.4 
 
 
281 aa  49.3  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2198  dienelactone hydrolase  27.32 
 
 
252 aa  48.9  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0102291  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3063  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.89 
 
 
688 aa  49.3  0.00006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0642  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  24.67 
 
 
826 aa  48.9  0.00006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.224163  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0793  esterase  25.75 
 
 
250 aa  48.9  0.00006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00954215  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0568  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25 
 
 
823 aa  48.9  0.00006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000257692  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0597  dienelactone hydrolase family protein  26.79 
 
 
243 aa  48.9  0.00006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0612  dienelactone hydrolase family protein  26.79 
 
 
243 aa  48.9  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0739  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  32.82 
 
 
309 aa  48.9  0.00007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.231286  hitchhiker  0.00721171 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00397  carboxylesterase  32.38 
 
 
309 aa  48.9  0.00007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4351  dienelactone hydrolase family protein  26.96 
 
 
271 aa  48.5  0.00008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3662  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.54 
 
 
621 aa  48.5  0.00008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0540328  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1951  dienelactone hydrolase  30.97 
 
 
291 aa  48.9  0.00008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03717  predicted hydrolase  26.96 
 
 
269 aa  48.5  0.00009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5271  dienelactone hydrolase family protein  26.96 
 
 
271 aa  48.5  0.00009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.198587 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03666  hypothetical protein  26.96 
 
 
267 aa  48.5  0.00009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49330  hypothetical protein  26.13 
 
 
262 aa  48.5  0.00009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.295044  normal  0.0937035 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02809  dipeptidyl peptidase IV  26.62 
 
 
729 aa  48.5  0.00009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0490  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  22.33 
 
 
675 aa  48.5  0.00009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4149  Carboxymethylenebutenolidase  26.96 
 
 
271 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4206  dienelactone hydrolase family protein  26.96 
 
 
269 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000877073 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1632  phospholipase/carboxylesterase  36.36 
 
 
224 aa  47.8  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0881  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  23.39 
 
 
709 aa  47.8  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4178  carboxymethylenebutenolidase  26.96 
 
 
271 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0221316 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1980  dienelactone hydrolase  25.83 
 
 
245 aa  48.1  0.0001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.228213 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0582  E3 binding domain protein  35.71 
 
 
467 aa  48.1  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0787  dienelactone hydrolase family protein  27.09 
 
 
356 aa  47.8  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.307266  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1626  dienelactone hydrolase  25.4 
 
 
242 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0197057 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6997  dienelactone hydrolase  25.97 
 
 
300 aa  48.1  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.253602 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3412  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  21.68 
 
 
690 aa  48.1  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0581677 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4054  dienelactone hydrolase family protein  26.96 
 
 
271 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2704  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  40 
 
 
660 aa  47.8  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00329778  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17781  hypothetical protein  24.44 
 
 
681 aa  48.1  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.46714 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0914  dienelactone hydrolase  23.7 
 
 
255 aa  47.8  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.177135  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3021  peptidase S15  30.43 
 
 
292 aa  47.8  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>