38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1669 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_1669  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase  100 
 
 		 331 aa  676    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133823  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6867  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase  35.9 
 
 		 304 aa  188  1e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6409  dienelactone hydrolase-like protein  37.1 
 
 		 346 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0146  putative signal peptide protein  30.62 
 
 		 298 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0456  hypothetical protein  29.13 
 
 		 425 aa  107  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.891224  normal  0.426984 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4260  hypothetical protein  29.13 
 
 		 429 aa  107  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.241726 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0375  dienelactone hydrolase and related enzymes-like protein  32.03 
 
 		 423 aa  102  8e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.822376 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2979  dienelactone hydrolase and related enzyme-like protein  30.74 
 
 		 418 aa  102  9e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0268  putative signal peptide protein  27.86 
 
 		 308 aa  102  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.412129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2842  dienelactone hydrolase and related enzyme-like protein  31.25 
 
 		 419 aa  101  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.89076 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0112  putative signal peptide protein  29.02 
 
 		 309 aa  101  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0127  putative signal peptide protein  27.54 
 
 		 311 aa  100  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.498965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2316  dienelactone hydrolase and related enzymes-like  32.03 
 
 		 423 aa  99.8  5e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2930  dienelactone hydrolase and related enzymes-like protein  32.03 
 
 		 423 aa  99.8  5e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.399688  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0119  conserved hypothetical signal peptide protein  27.67 
 
 		 312 aa  97.4  3e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2945  dienelactone hydrolase and related enzyme-like protein  31.64 
 
 		 423 aa  96.7  5e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6273  dienelactone hydrolase  30.86 
 
 		 423 aa  94.4  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2675  hypothetical protein  31.16 
 
 		 390 aa  95.1  2e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0341  hypothetical protein  33.17 
 
 		 423 aa  93.2  5e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4903  hypothetical protein  28.74 
 
 		 372 aa  92.8  7e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0174  hypothetical protein  27.52 
 
 		 429 aa  92  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1291  hypothetical protein  26.04 
 
 		 351 aa  90.1  4e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2274  hypothetical protein  32.16 
 
 		 442 aa  90.5  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0414  hypothetical protein  32.16 
 
 		 442 aa  90.5  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0393  hypothetical protein  32.16 
 
 		 442 aa  90.5  4e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2013  peptidase  32.16 
 
 		 441 aa  90.1  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3082  hypothetical protein  32.16 
 
 		 442 aa  90.5  4e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.509455  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0575  hypothetical protein  32.16 
 
 		 432 aa  90.5  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2524  hypothetical protein  27.35 
 
 		 292 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.953611 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26540  hypothetical protein  29.41 
 
 		 279 aa  79.7  0.00000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4783  hypothetical protein  30.26 
 
 		 253 aa  56.6  0.0000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4702  dienelactone hydrolase  31.39 
 
 		 328 aa  45.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.579597  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0358  cinnamoyl ester hydrolase  25.7 
 
 		 281 aa  44.3  0.003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1756  alpha/beta hydrolase fold  26.92 
 
 		 260 aa  43.5  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1709  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  30.61 
 
 		 594 aa  43.5  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3188  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  32.19 
 
 		 612 aa  43.5  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3085  peptidase S15  29.79 
 
 		 287 aa  42.7  0.007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.918573  normal  0.256492 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3662  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  28.78 
 
 		 621 aa  42.7  0.008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0540328  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>