143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_0174 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A4260  hypothetical protein  75.31 
 
 		 429 aa  644    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.241726 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0174  hypothetical protein  100 
 
 		 429 aa  881    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0456  hypothetical protein  72.49 
 
 		 425 aa  637    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.891224  normal  0.426984 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0575  hypothetical protein  57.91 
 
 		 432 aa  511  1e-144  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3082  hypothetical protein  57.91 
 
 		 442 aa  512  1e-144  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.509455  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2013  peptidase  57.91 
 
 		 441 aa  511  1e-144  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0393  hypothetical protein  57.91 
 
 		 442 aa  512  1e-144  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0414  hypothetical protein  57.91 
 
 		 442 aa  512  1e-144  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2274  hypothetical protein  57.91 
 
 		 442 aa  512  1e-144  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6273  dienelactone hydrolase  59.77 
 
 		 423 aa  511  1e-143  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0341  hypothetical protein  59.72 
 
 		 423 aa  509  1e-143  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0375  dienelactone hydrolase and related enzymes-like protein  63.78 
 
 		 423 aa  509  1e-143  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.822376 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2945  dienelactone hydrolase and related enzyme-like protein  58.9 
 
 		 423 aa  504  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2316  dienelactone hydrolase and related enzymes-like  58.9 
 
 		 423 aa  504  1e-141  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2930  dienelactone hydrolase and related enzymes-like protein  58.9 
 
 		 423 aa  504  1e-141  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.399688  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2842  dienelactone hydrolase and related enzyme-like protein  61.11 
 
 		 419 aa  502  1e-141  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.89076 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2979  dienelactone hydrolase and related enzyme-like protein  64.75 
 
 		 418 aa  500  1e-140  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0268  putative signal peptide protein  50 
 
 		 308 aa  280  4e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.412129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0119  conserved hypothetical signal peptide protein  52.36 
 
 		 312 aa  278  1e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0127  putative signal peptide protein  51.97 
 
 		 311 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.498965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0146  putative signal peptide protein  48.43 
 
 		 298 aa  264  2e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0112  putative signal peptide protein  46.36 
 
 		 309 aa  249  5e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4903  hypothetical protein  35.51 
 
 		 372 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26540  hypothetical protein  44 
 
 		 279 aa  208  2e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1291  hypothetical protein  28.53 
 
 		 351 aa  131  3e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2675  hypothetical protein  28.05 
 
 		 390 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6867  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase  31.15 
 
 		 304 aa  123  7e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6409  dienelactone hydrolase-like protein  30.45 
 
 		 346 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1669  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase  27.52 
 
 		 331 aa  92  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133823  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2524  hypothetical protein  26.94 
 
 		 292 aa  70.1  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.953611 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3931  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  30.21 
 
 		 695 aa  62.8  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0988778 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3141  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  31.21 
 
 		 596 aa  60.5  0.00000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.91649  normal  0.671974 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3085  peptidase S15  30.37 
 
 		 287 aa  60.5  0.00000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.918573  normal  0.256492 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3188  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.62 
 
 		 612 aa  59.7  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5100  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  31.43 
 
 		 635 aa  57.8  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2538  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.37 
 
 		 611 aa  55.1  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3346  hypothetical protein  28.77 
 
 		 320 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0581  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25.36 
 
 		 628 aa  55.1  0.000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.402001 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3112  hypothetical protein  28.37 
 
 		 337 aa  54.3  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.200391  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3018  hypothetical protein  28.08 
 
 		 338 aa  53.9  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.277726  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2294  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  34.23 
 
 		 776 aa  54.3  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.237204  normal  0.953855 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2909  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  35.14 
 
 		 735 aa  53.5  0.000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.390736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0312  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  25.48 
 
 		 588 aa  53.5  0.000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4783  hypothetical protein  30.53 
 
 		 253 aa  53.1  0.000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4702  dienelactone hydrolase  25.33 
 
 		 328 aa  52.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.579597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0602  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.59 
 
 		 653 aa  52.8  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0774537 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3126  hypothetical protein  28.57 
 
 		 342 aa  52  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3372  hypothetical protein  28.57 
 
 		 341 aa  52  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0027  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.19 
 
 		 642 aa  51.6  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.018636  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3348  hypothetical protein  27.4 
 
 		 339 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.077916  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3662  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25.33 
 
 		 621 aa  51.2  0.00004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0540328  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0469  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  30.7 
 
 		 638 aa  51.2  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3343  hypothetical protein  27.21 
 
 		 337 aa  50.4  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.975652  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2573  peptidase S15  31.86 
 
 		 497 aa  50.4  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000331981  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4518  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.07 
 
 		 652 aa  50.1  0.00007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.164406 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2704  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  31.36 
 
 		 660 aa  50.1  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00329778  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0522  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  32.48 
 
 		 610 aa  50.1  0.00009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.450113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3533  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  23.04 
 
 		 697 aa  49.7  0.00009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1241  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  30.83 
 
 		 721 aa  49.3  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.349009  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1709  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25.23 
 
 		 594 aa  49.3  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0078  prolyl oligopeptidase family protein  27.73 
 
 		 665 aa  49.3  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5512  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25.94 
 
 		 634 aa  49.7  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.398053  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1694  putative dienelactone hydrolase family protein  23.81 
 
 		 275 aa  49.7  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.986757  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02809  dipeptidyl peptidase IV  30.23 
 
 		 729 aa  49.3  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2245  Dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase  31.19 
 
 		 320 aa  49.7  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.563783 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3325  hypothetical protein  26.57 
 
 		 317 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3511  prolyl oligopeptidase family protein  30.09 
 
 		 638 aa  48.5  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2269  putative dienelactone hydrolase  26.04 
 
 		 266 aa  48.5  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.672728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7213  putative dienelactone hydrolase  27.42 
 
 		 284 aa  48.5  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.125525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25820  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl peptidase  33.03 
 
 		 648 aa  48.5  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0448  peptidase  28.95 
 
 		 678 aa  48.9  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.547634 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0440  ABC transporter related protein  30.16 
 
 		 868 aa  48.9  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.620247 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1963  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.43 
 
 		 669 aa  48.1  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.159211  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0649  dipeptidyl-peptidase IV  27.78 
 
 		 763 aa  48.1  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000821828  hitchhiker  0.00018889 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0785  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  27.78 
 
 		 771 aa  48.1  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.355862  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2274  Acylaminoacyl-peptidase  24.9 
 
 		 632 aa  48.5  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0474921  normal  0.561641 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1375  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  24.35 
 
 		 708 aa  48.1  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.635972  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1195  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.27 
 
 		 645 aa  47.8  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.430413  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4547  protein of unknown function DUF1400  27.72 
 
 		 533 aa  47.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6187  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.42 
 
 		 656 aa  47.4  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.317055 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0650  dipeptidyl-peptidase IV  26.98 
 
 		 763 aa  47.4  0.0005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00104928  normal  0.120893 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3372  dipeptidyl-peptidase IV  27.78 
 
 		 763 aa  47.4  0.0005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0367236  normal  0.0127919 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3393  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  31.82 
 
 		 619 aa  47  0.0006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3843  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  26.45 
 
 		 771 aa  47  0.0007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.036555  unclonable  0.0000141613 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3662  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  26.45 
 
 		 766 aa  47  0.0007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0549477  hitchhiker  0.000000187493 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2249  peptidase S15  29.37 
 
 		 474 aa  46.6  0.0008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000310265  normal  0.111012 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4124  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  23.93 
 
 		 645 aa  46.6  0.0008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4323  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  23.93 
 
 		 645 aa  46.6  0.0009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3990  dipeptidyl peptidase IV  26.98 
 
 		 763 aa  46.6  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0143  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  23.93 
 
 		 645 aa  46.2  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0257  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  30 
 
 		 692 aa  45.8  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000173307  normal  0.117372 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0774  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  25.64 
 
 		 750 aa  46.2  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00925268  hitchhiker  0.00131566 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0677  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  26.98 
 
 		 760 aa  46.2  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00440025  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3720  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  25.33 
 
 		 767 aa  46.2  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0109234  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00782  Dipeptidyl peptidase IV  26.09 
 
 		 741 aa  45.8  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0118527  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1104  dipeptidyl peptidase IV  25.49 
 
 		 752 aa  45.1  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4106  dienelactone hydrolase  25 
 
 		 275 aa  45.8  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1592  peptidase S15  29.57 
 
 		 580 aa  45.8  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00000232254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6851  ABC-type multidrug transport system ATPase component-like protein  30.22 
 
 		 866 aa  45.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0398  peptidase  25.93 
 
 		 657 aa  45.4  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>