161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A0146 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A0146  putative signal peptide protein  100 
 
 
298 aa  607  9.999999999999999e-173  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0112  putative signal peptide protein  70.24 
 
 
309 aa  380  1e-104  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0268  putative signal peptide protein  67.86 
 
 
308 aa  362  6e-99  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.412129  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0127  putative signal peptide protein  63.89 
 
 
311 aa  348  9e-95  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.498965  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0119  conserved hypothetical signal peptide protein  62.26 
 
 
312 aa  345  5e-94  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0174  hypothetical protein  48.43 
 
 
429 aa  265  7e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0456  hypothetical protein  49.21 
 
 
425 aa  256  3e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.891224  normal  0.426984 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4260  hypothetical protein  49.6 
 
 
429 aa  255  6e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.241726 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2979  dienelactone hydrolase and related enzyme-like protein  48.02 
 
 
418 aa  240  2e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2842  dienelactone hydrolase and related enzyme-like protein  48.02 
 
 
419 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.89076 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0375  dienelactone hydrolase and related enzymes-like protein  48.02 
 
 
423 aa  238  5.999999999999999e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.822376 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6273  dienelactone hydrolase  48.02 
 
 
423 aa  238  1e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2945  dienelactone hydrolase and related enzyme-like protein  45.99 
 
 
423 aa  238  1e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2316  dienelactone hydrolase and related enzymes-like  45.99 
 
 
423 aa  236  3e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2930  dienelactone hydrolase and related enzymes-like protein  45.99 
 
 
423 aa  236  3e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.399688  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0341  hypothetical protein  47.22 
 
 
423 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3082  hypothetical protein  45.63 
 
 
442 aa  229  5e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.509455  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0393  hypothetical protein  45.63 
 
 
442 aa  229  5e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0414  hypothetical protein  45.63 
 
 
442 aa  229  5e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2274  hypothetical protein  45.63 
 
 
442 aa  229  5e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0575  hypothetical protein  45.63 
 
 
432 aa  229  6e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2013  peptidase  45.63 
 
 
441 aa  229  6e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26540  hypothetical protein  38.64 
 
 
279 aa  162  6e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6867  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase  35.38 
 
 
304 aa  148  9e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4903  hypothetical protein  35.77 
 
 
372 aa  148  9e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6409  dienelactone hydrolase-like protein  36.21 
 
 
346 aa  134  3e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1669  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase  29.75 
 
 
331 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133823  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2675  hypothetical protein  32.39 
 
 
390 aa  118  9.999999999999999e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1291  hypothetical protein  31.71 
 
 
351 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2524  hypothetical protein  33.46 
 
 
292 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.953611 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3085  peptidase S15  34.59 
 
 
287 aa  65.9  0.0000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.918573  normal  0.256492 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2573  peptidase S15  32.88 
 
 
497 aa  59.3  0.00000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000331981  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4106  dienelactone hydrolase  27.86 
 
 
275 aa  57.4  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2538  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  30.72 
 
 
611 aa  56.6  0.0000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4783  hypothetical protein  30.17 
 
 
253 aa  56.2  0.0000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3141  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  30.77 
 
 
596 aa  55.8  0.0000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.91649  normal  0.671974 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0209  putative prolyl oligopeptidase family protein  27.21 
 
 
652 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4702  dienelactone hydrolase  27.27 
 
 
328 aa  55.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.579597  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0581  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  29.3 
 
 
628 aa  55.5  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.402001 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0187  putative prolyl oligopeptidase family protein  26.53 
 
 
654 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0167  prolyl oligopeptidase family protein  26.53 
 
 
655 aa  54.3  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3931  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  28.22 
 
 
695 aa  54.7  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0988778 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0165  prolyl oligopeptidase family protein  26.53 
 
 
654 aa  54.3  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5512  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.39 
 
 
634 aa  54.7  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.398053  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2704  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  28 
 
 
660 aa  54.3  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00329778  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0153  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.46 
 
 
654 aa  54.7  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5132  prolyl oligopeptidase family protein  26.49 
 
 
654 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0839  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.98 
 
 
651 aa  53.9  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0843  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.19 
 
 
653 aa  53.9  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0193  putative prolyl oligopeptidase family protein  28.46 
 
 
655 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.685951  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0191  prolyl oligopeptidase family protein, putative  28.46 
 
 
652 aa  52.8  0.000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0158  prolyl oligopeptidase family protein  25.85 
 
 
655 aa  52.8  0.000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1694  putative dienelactone hydrolase family protein  24.91 
 
 
275 aa  52.8  0.000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.986757  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4797  hypothetical protein  32.9 
 
 
297 aa  52.4  0.000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.252351  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3188  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  30.82 
 
 
612 aa  52.4  0.000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0160  prolyl oligopeptidase family protein  26.53 
 
 
655 aa  52.4  0.000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0602  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.81 
 
 
653 aa  51.6  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0774537 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0791  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  26.51 
 
 
653 aa  51.2  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1858  dienelactone hydrolase  28 
 
 
275 aa  51.2  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0385469 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0027  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.86 
 
 
642 aa  51.6  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.018636  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1709  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25.62 
 
 
594 aa  50.8  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4518  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  23.7 
 
 
652 aa  50.4  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.164406 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2471  dienelactone hydrolase  26.42 
 
 
302 aa  50.4  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.164719  normal  0.138775 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2274  Acylaminoacyl-peptidase  27.95 
 
 
632 aa  50.4  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0474921  normal  0.561641 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3175  dienelactone hydrolase  25.73 
 
 
272 aa  50.1  0.00005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.391894  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1963  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25.58 
 
 
669 aa  50.1  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.159211  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2468  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  31.2 
 
 
628 aa  49.7  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0724  prolyl oligopeptidase family protein  36.62 
 
 
648 aa  48.5  0.0001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.866947 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0746  hypothetical protein  32.59 
 
 
532 aa  48.5  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.2892  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1823  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  36.36 
 
 
633 aa  48.9  0.0001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.272231  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7591  alpha/beta fold family hydrolase  29.68 
 
 
301 aa  48.5  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0448  peptidase  24.17 
 
 
678 aa  48.5  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.547634 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1119  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25.38 
 
 
688 aa  48.5  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.734549  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0393  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.69 
 
 
692 aa  48.9  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25840  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  32.09 
 
 
944 aa  48.1  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.128345  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0078  prolyl oligopeptidase family protein  25.29 
 
 
665 aa  47.8  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0591  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  29.09 
 
 
675 aa  47.8  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25820  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl peptidase  29.32 
 
 
648 aa  48.1  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3511  prolyl oligopeptidase family protein  26.53 
 
 
638 aa  47  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4204  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.01 
 
 
688 aa  47.8  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3371  dienelactone hydrolase  28.89 
 
 
320 aa  47.4  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0776  peptidase S15  33.64 
 
 
517 aa  47  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3328  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  27.21 
 
 
680 aa  47  0.0004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2074  peptidase S15  32.76 
 
 
524 aa  46.6  0.0005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.419616  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0636  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  30 
 
 
633 aa  46.2  0.0006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3662  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.22 
 
 
621 aa  46.2  0.0006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0540328  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2322  ABC transporter-like protein  32.56 
 
 
876 aa  46.6  0.0006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.255775 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6187  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  28.06 
 
 
656 aa  45.8  0.0008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.317055 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3626  dienelactone hydrolase  26.5 
 
 
301 aa  45.8  0.0008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1104  dipeptidyl peptidase IV  27.52 
 
 
752 aa  45.4  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0130  hydrolase CocE/NonD family protein subfamily  33.61 
 
 
572 aa  45.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.275557  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1592  peptidase S15  30.17 
 
 
580 aa  45.1  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00000232254  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1638  CocE/NonD family hydrolase  33.61 
 
 
567 aa  45.4  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1556  CocE/NonD family hydrolase  33.61 
 
 
572 aa  45.4  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.56743  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0257  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  24.82 
 
 
692 aa  45.1  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000173307  normal  0.117372 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1675  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.53 
 
 
683 aa  45.1  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.270345  hitchhiker  0.000408122 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1406  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.3 
 
 
676 aa  45.4  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.999048  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7213  putative dienelactone hydrolase  29.59 
 
 
284 aa  45.8  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.125525  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3412  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  30.77 
 
 
690 aa  45.1  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0581677 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0723  dienelactone hydrolase  26.63 
 
 
281 aa  44.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>