144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_3439 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011989  Avi_3439  hypothetical protein  100 
 
 
324 aa  668    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.149001  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0804  putative aminopeptidase protein  70.51 
 
 
306 aa  432  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.151925 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0917  putative aminopeptidase protein  70.51 
 
 
306 aa  418  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0248171  normal  0.161085 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4236  hypothetical protein  32.83 
 
 
335 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.740763  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2527  Dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase-like protein  32.77 
 
 
394 aa  114  2.0000000000000002e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.367082  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1648  Dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase -like protein  41.07 
 
 
710 aa  114  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.158982  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3337  hypothetical protein  28.21 
 
 
342 aa  95.1  1e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3085  peptidase S15  30.81 
 
 
287 aa  74.3  0.000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.918573  normal  0.256492 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1306  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase  31.36 
 
 
651 aa  66.6  0.0000000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3350  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  32.18 
 
 
716 aa  62  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.996189  normal  0.0472619 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0751  Dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase -like protein  28.06 
 
 
720 aa  59.7  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00616106  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3798  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  31.61 
 
 
634 aa  58.2  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2300  dipeptidyl aminopeptidases/acylaminoacyl-peptidases-like  27.91 
 
 
327 aa  56.2  0.0000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000887585 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3530  Dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase -like protein  33.12 
 
 
649 aa  56.2  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00138387  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3317  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.89 
 
 
957 aa  55.5  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.13719 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0158  prolyl oligopeptidase family protein  24.73 
 
 
655 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0114  peptidase S9, prolyl oligopeptidase  27.93 
 
 
674 aa  54.3  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2759  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.89 
 
 
937 aa  53.9  0.000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000369969  normal  0.171772 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0246  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.6 
 
 
666 aa  54.3  0.000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.346688  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1095  hypothetical protein  32.59 
 
 
253 aa  53.9  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.103267 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3567  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.91 
 
 
695 aa  53.5  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.304997  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2568  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.73 
 
 
766 aa  53.5  0.000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.169893  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0191  prolyl oligopeptidase family protein, putative  24.73 
 
 
652 aa  53.1  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3465  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  24.37 
 
 
943 aa  53.1  0.000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000288116 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0153  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  23.76 
 
 
654 aa  53.1  0.000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25820  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl peptidase  31.76 
 
 
648 aa  53.1  0.000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0167  prolyl oligopeptidase family protein  24.31 
 
 
655 aa  52.8  0.000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0165  prolyl oligopeptidase family protein  24.31 
 
 
654 aa  52.8  0.000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0904  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  33.33 
 
 
664 aa  52.8  0.000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.496036  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0187  putative prolyl oligopeptidase family protein  24.31 
 
 
654 aa  52.8  0.000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0132  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.37 
 
 
674 aa  52.8  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1722  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.57 
 
 
762 aa  52.4  0.000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3511  prolyl oligopeptidase family protein  28.49 
 
 
638 aa  52.4  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0160  prolyl oligopeptidase family protein  24.31 
 
 
655 aa  52  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2116  peptidase S9, prolyl oligopeptidase  29.86 
 
 
648 aa  52  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.577161  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0293  Dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase  33.61 
 
 
321 aa  52.4  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.744416  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0193  putative prolyl oligopeptidase family protein  24.31 
 
 
655 aa  52  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.685951  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2704  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  23.96 
 
 
660 aa  51.2  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00329778  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5512  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  34.13 
 
 
634 aa  51.6  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.398053  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0121  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.37 
 
 
674 aa  51.6  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0209  putative prolyl oligopeptidase family protein  27.59 
 
 
652 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1373  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  28.4 
 
 
620 aa  51.2  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0272535 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0152  Acetyl xylan esterase  27.18 
 
 
321 aa  51.6  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1529  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.91 
 
 
622 aa  50.8  0.00003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0498  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  29.73 
 
 
575 aa  50.8  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0154886  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1655  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.49 
 
 
692 aa  50.8  0.00003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2781  BAAT/Acyl-CoA thioester hydrolase  26.09 
 
 
264 aa  50.4  0.00004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3968  peptidase S9B, dipeptidylpeptidase IV-like  31.03 
 
 
735 aa  50.4  0.00004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.507879  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0613  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  29.73 
 
 
655 aa  50.4  0.00004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2979  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.89 
 
 
931 aa  50.4  0.00004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.874911  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0272  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  29.89 
 
 
686 aa  50.1  0.00005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2778  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  24.87 
 
 
955 aa  49.7  0.00007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1119  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.94 
 
 
688 aa  49.7  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.734549  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3136  hypothetical protein  36.27 
 
 
258 aa  49.3  0.00009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0718166  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5039  hypothetical protein  36.63 
 
 
252 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00504479 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1065  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  31.78 
 
 
667 aa  48.9  0.0001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1427  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.79 
 
 
682 aa  48.5  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00782  Dipeptidyl peptidase IV  25.56 
 
 
741 aa  48.9  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0118527  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1211  esterase, PHB depolymerase family  28.24 
 
 
312 aa  48.9  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0349548 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2817  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.97 
 
 
822 aa  48.1  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  34.86 
 
 
264 aa  48.1  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3407  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  24.16 
 
 
680 aa  48.5  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5132  prolyl oligopeptidase family protein  26.72 
 
 
654 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36540  hypothetical protein  33.63 
 
 
258 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0232099  normal  0.968112 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00330  hypothetical protein  33.71 
 
 
248 aa  47.4  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0116  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.09 
 
 
726 aa  47  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0529  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.67 
 
 
634 aa  47.4  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0398  peptidase  29.03 
 
 
657 aa  47  0.0005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3740  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  23 
 
 
681 aa  46.6  0.0006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3813  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  23 
 
 
681 aa  46.6  0.0006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1369  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  24.37 
 
 
944 aa  46.6  0.0006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0132501  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1355  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  23.83 
 
 
944 aa  46.6  0.0006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.229344  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1394  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  23.83 
 
 
944 aa  46.6  0.0006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.4092  hitchhiker  0.00475521 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02409  putative lipase/esterase  31.86 
 
 
379 aa  46.6  0.0006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0505  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  21.89 
 
 
709 aa  46.6  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0956  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  26.67 
 
 
672 aa  46.2  0.0007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0118  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  30.88 
 
 
687 aa  46.2  0.0007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.125913  normal  0.195999 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1193  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.76 
 
 
642 aa  46.2  0.0007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2990  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  23.83 
 
 
944 aa  46.2  0.0007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00257397  hitchhiker  0.00000788258 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1149  Acylaminoacyl-peptidase  28.99 
 
 
618 aa  46.2  0.0008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0889139 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4254  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.54 
 
 
698 aa  46.2  0.0008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0432871 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1126  peptidase S15  23.64 
 
 
335 aa  46.2  0.0008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0211  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.54 
 
 
673 aa  46.2  0.0008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.692132 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3938  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  23 
 
 
681 aa  45.8  0.0009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1753  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.88 
 
 
673 aa  45.4  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3954  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  32.77 
 
 
694 aa  45.4  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.871148  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0209  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.54 
 
 
698 aa  45.8  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0582441  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4244  peptidase S15  27.08 
 
 
256 aa  45.8  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.100247  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1443  putative lipoprotein  26.92 
 
 
301 aa  45.4  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4128  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.54 
 
 
673 aa  45.8  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.658271  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1372  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25.57 
 
 
677 aa  45.4  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.330488  normal  0.102589 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2888  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25.27 
 
 
678 aa  44.7  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0760896  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4537  peptidase, putative  26.81 
 
 
675 aa  45.1  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2922  putative lipase/esterase  28.57 
 
 
307 aa  44.7  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0755  peptidase, putative  22.17 
 
 
688 aa  45.1  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0248  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.06 
 
 
631 aa  44.7  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1105  lipoprotein  33.81 
 
 
307 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03155  Acylaminoacyl-peptidase  33.04 
 
 
685 aa  44.7  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0857  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  24.19 
 
 
670 aa  44.7  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2040  esterase-like protein  31.67 
 
 
1002 aa  44.3  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.400928  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>