More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0788 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_0788  histidine triad (HIT) protein  100 
 
 		 455 aa  915    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.864692  normal  0.369294 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2753  hypothetical protein  48.69 
 
 		 293 aa  234  3e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.999004  normal  0.272807 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8503  putative lipoprotein  34.55 
 
 		 276 aa  158  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3139  histidine triad (HIT) protein  46.85 
 
 		 143 aa  127  6e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0448341 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1829  putative HIT family protein  46.04 
 
 		 145 aa  125  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21440  putative HIT family protein  43.06 
 
 		 145 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.117632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0746  histidine triad (HIT) protein  45.65 
 
 		 145 aa  114  5e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00337572 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1532  histidine triad (HIT) protein  42.66 
 
 		 145 aa  113  7.000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.77898  normal  0.453293 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2024  histidine triad (HIT) protein  43.26 
 
 		 140 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4689  histidine triad (HIT) protein  44.93 
 
 		 142 aa  108  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0956525  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4320  histidine triad (HIT) protein  44.93 
 
 		 142 aa  108  2e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0862778  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1771  histidine triad (HIT) protein  44.6 
 
 		 143 aa  106  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0123943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1125  HIT family protein  41.13 
 
 		 140 aa  105  1e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.20711  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4837  histidine triad (HIT) protein  44.93 
 
 		 140 aa  106  1e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0161096  normal  0.332557 
 
 
-
 
NC_004310  BR1168  HIT family protein  40.43 
 
 		 140 aa  105  2e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.247304  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2405  histidine triad (HIT) protein  40.15 
 
 		 142 aa  104  3e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.112602  normal  0.457991 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2290  histidine triad (HIT) protein  45.99 
 
 		 139 aa  104  3e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.777464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3753  histidine triad (HIT) protein  44.68 
 
 		 145 aa  103  6e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.052098 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4754  hypothetical protein  43.48 
 
 		 141 aa  102  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.419636  normal  0.737034 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1574  histidine triad (HIT) protein  39.72 
 
 		 141 aa  102  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.650242  normal  0.227098 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3046  histidine triad (HIT) protein  40.58 
 
 		 142 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.422459 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1376  histidine triad (HIT) protein  44.03 
 
 		 145 aa  102  1e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4476  putative histidine triad (HIT) protein  42.45 
 
 		 141 aa  102  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000626279 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3968  histidine triad (HIT) protein  41.73 
 
 		 141 aa  101  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3549  histidine triad (HIT) protein  43.09 
 
 		 142 aa  101  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.276085  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1666  histidine triad (HIT) protein  45.26 
 
 		 142 aa  101  3e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.225024  normal  0.108561 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2451  histidine triad (HIT) protein  41.61 
 
 		 142 aa  101  3e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.94056  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0254  histidine triad (HIT) protein  38.73 
 
 		 145 aa  100  5e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3878  histidine triad (HIT) protein  38.85 
 
 		 142 aa  100  7e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000287053  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0579  histidine triad domain-containing protein  40.43 
 
 		 140 aa  99  1e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0235717  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3316  histidine triad (HIT) protein  41.01 
 
 		 142 aa  98.2  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.33287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4702  histidine triad (HIT) protein  39.72 
 
 		 144 aa  97.8  4e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00557305 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3536  histidine triad (HIT) protein  43.07 
 
 		 144 aa  97.8  4e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.806394 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0075  histidine triad (HIT) protein  40.6 
 
 		 138 aa  97.4  5e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.850691  normal  0.167835 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2926  histidine triad (HIT) protein  39.86 
 
 		 149 aa  96.7  8e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0006  histidine triad (HIT) protein  38.97 
 
 		 142 aa  96.7  8e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0070148  unclonable  0.000000000279381 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3327  histidine triad (HIT) protein  42.22 
 
 		 139 aa  95.9  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.036152 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1120  histidine triad (HIT) protein  42.34 
 
 		 139 aa  95.5  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.636565  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2534  HIT family protein  46.9 
 
 		 141 aa  95.5  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.91947  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3136  histidine triad (HIT) protein  44.72 
 
 		 145 aa  95.5  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.186474  normal  0.519956 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2559  HIT family protein  42.34 
 
 		 138 aa  94  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.609142  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1579  HIT family protein  42.34 
 
 		 139 aa  94  5e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.380866  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2703  HIT family protein  42.34 
 
 		 138 aa  94  5e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0207  HIT family protein  42.34 
 
 		 138 aa  94  5e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1382  HIT family protein  42.34 
 
 		 138 aa  94  5e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0979  HIT family protein  42.34 
 
 		 138 aa  94  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.721312  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0238  HIT family protein  42.34 
 
 		 138 aa  94  5e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1292  histidine triad (HIT) protein  42.03 
 
 		 145 aa  93.2  8e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.268815  normal  0.885199 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0492  HIT family protein  42.34 
 
 		 138 aa  93.2  9e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0494  putative HIT-like protein  38.13 
 
 		 144 aa  91.7  3e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2807  histidine triad (HIT) protein  41.8 
 
 		 145 aa  90.9  4e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2801  histidine triad (HIT) protein  37.68 
 
 		 139 aa  90.1  6e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.106273  normal  0.788809 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1561  histidine triad (HIT) protein  36.84 
 
 		 139 aa  90.1  7e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0781  histidine triad (HIT) protein  42.19 
 
 		 135 aa  90.1  7e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5333  histidine triad (HIT) protein  43.7 
 
 		 139 aa  89.7  9e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4823  histidine triad (HIT) protein  43.7 
 
 		 139 aa  89.7  9e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.784878 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0206  histidine triad (HIT) protein  43.7 
 
 		 143 aa  89.7  9e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.577034 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5415  histidine triad (HIT) protein  43.7 
 
 		 139 aa  89.7  9e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.269942  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4791  histidine triad (HIT) protein  43.7 
 
 		 139 aa  89.7  9e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5446  histidine triad (HIT) protein  43.7 
 
 		 139 aa  89.7  9e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.311796 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4665  histidine triad (HIT) protein  41.01 
 
 		 146 aa  89.4  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0394805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2539  histidine triad (HIT) protein  36.36 
 
 		 139 aa  89.4  1e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.170824 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1302  histidine triad (HIT) protein  46.23 
 
 		 146 aa  89  1e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2416  histidine triad (HIT) protein  37.96 
 
 		 146 aa  88.2  3e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0525465  normal  0.0378675 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2848  histidine triad (HIT) protein  40.78 
 
 		 136 aa  87.4  4e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0952  histidine triad (HIT) protein  46.23 
 
 		 143 aa  86.7  7e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000117681  hitchhiker  0.00115812 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0004  histidine triad (HIT) protein  39.85 
 
 		 149 aa  86.7  9e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0275782 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1076  histidine triad (HIT) protein  43.12 
 
 		 146 aa  86.7  9e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.179252 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2145  histidine triad (HIT) protein  44.23 
 
 		 146 aa  86.3  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.538577  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2454  histidine triad (HIT) protein  37.88 
 
 		 145 aa  86.3  0.000000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.832288  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3108  histidine triad (HIT) protein  37.88 
 
 		 143 aa  86.3  0.000000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0211  histidine triad (HIT) protein  34.75 
 
 		 145 aa  85.5  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1891  histidine triad (HIT) protein  37.78 
 
 		 137 aa  84.7  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1376  histidine triad (HIT) protein  43.27 
 
 		 151 aa  83.6  0.000000000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.341423  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf126  HINT (histidine triad nucleotide-binding protein) family member  41.35 
 
 		 107 aa  82  0.00000000000002  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0962  histidine triad (HIT) protein  40.59 
 
 		 144 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0814  histidine triad (HIT) protein  39.6 
 
 		 144 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4221  HIT family protein  39.05 
 
 		 144 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.071329  normal  0.0179678 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1083  HIT family protein  39.05 
 
 		 144 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1573  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolase  36.36 
 
 		 139 aa  81.3  0.00000000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1151  HIT family protein  39.6 
 
 		 165 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0966  HIT family protein  39.6 
 
 		 144 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0957  HIT family protein  39.6 
 
 		 144 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3726  histidine triad (HIT) protein  41.51 
 
 		 138 aa  80.9  0.00000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1212  HIT family protein  39.6 
 
 		 144 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1124  HIT family protein  39.6 
 
 		 144 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4014  histidine triad (HIT) protein  35.82 
 
 		 137 aa  80.9  0.00000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0978  HIT family protein  39.6 
 
 		 144 aa  80.5  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1047  HIT family protein  39.6 
 
 		 144 aa  80.5  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3592  histidine triad (HIT) protein  48.15 
 
 		 120 aa  80.5  0.00000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3451  histidine triad (HIT) protein  36.96 
 
 		 149 aa  80.9  0.00000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.923698  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0644  histidine triad (HIT) protein  39.6 
 
 		 140 aa  80.5  0.00000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4498  histidine triad (HIT) protein  43.56 
 
 		 140 aa  80.5  0.00000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2280  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases  40.59 
 
 		 132 aa  80.5  0.00000000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1925  histidine triad (HIT) protein  42.57 
 
 		 140 aa  79.3  0.0000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1891  histidine triad (HIT) protein  42.57 
 
 		 140 aa  79.3  0.0000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.472953  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1740  histidine triad protein  34.31 
 
 		 139 aa  77.8  0.0000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.458061 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2900  histidine triad (HIT) protein  37.88 
 
 		 131 aa  77.8  0.0000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.276504  normal  0.0712491 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3302  HIT family protein  37.88 
 
 		 131 aa  77.8  0.0000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2038  histidine triad (HIT) protein  41.38 
 
 		 126 aa  77.8  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000923798  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>