68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_1247 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_1690  dienelactone hydrolase  68.46 
 
 		 534 aa  691    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4020  hypothetical protein  69.81 
 
 		 536 aa  703    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.905898  normal  0.886685 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1247  hypothetical protein  100 
 
 		 546 aa  1090    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000443968 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3774  hypothetical protein  72.8 
 
 		 533 aa  712    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0113955  normal  0.0693003 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1627  dienelactone hydrolase  44.74 
 
 		 526 aa  378  1e-103  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.776343  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2726  hypothetical protein  43.91 
 
 		 510 aa  347  2e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.313145 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2066  dienelactone hydrolase  58.73 
 
 		 506 aa  326  8.000000000000001e-88  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.399368 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3351  putative membrane protein of unknown function  43.18 
 
 		 491 aa  314  2.9999999999999996e-84  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.881704 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1522  dienelactone hydrolase  55.11 
 
 		 512 aa  288  2e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0253  hypothetical protein  35.54 
 
 		 493 aa  251  3e-65  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2129  hypothetical protein  36.4 
 
 		 498 aa  139  8.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0477  hypothetical protein  35.69 
 
 		 498 aa  138  2e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2400  hypothetical protein  35.89 
 
 		 498 aa  130  6e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.330729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3970  hypothetical protein  35.23 
 
 		 501 aa  108  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0757024 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4116  hypothetical protein  31.15 
 
 		 363 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.173783  normal  0.516746 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1186  hypothetical protein  26.22 
 
 		 576 aa  64.7  0.000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.710855  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2322  ABC transporter-like protein  30.54 
 
 		 876 aa  53.9  0.000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.255775 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07460  lysophospholipase  32 
 
 		 300 aa  52.4  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0863462 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2113  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase related protein  31.58 
 
 		 474 aa  51.2  0.00005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0819  hypothetical protein  31.18 
 
 		 253 aa  50.4  0.00008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3838  hypothetical protein  26.06 
 
 		 360 aa  49.3  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00401866  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3924  hypothetical protein  26.06 
 
 		 385 aa  49.7  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0127899  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3950  hypothetical protein  26.06 
 
 		 328 aa  49.3  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.992848 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1097  alpha/beta hydrolase fold protein  26.98 
 
 		 298 aa  48.5  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3436  alpha/beta hydrolase  26.49 
 
 		 256 aa  48.5  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1530  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase related protein  28.95 
 
 		 463 aa  48.1  0.0004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1735  alpha/beta hydrolase fold  34.4 
 
 		 313 aa  48.1  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.319321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1801  alpha/beta hydrolase fold  34.4 
 
 		 313 aa  48.1  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.920716  normal  0.37834 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6851  ABC-type multidrug transport system ATPase component-like protein  29.25 
 
 		 866 aa  48.1  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1754  alpha/beta hydrolase fold  34.4 
 
 		 313 aa  48.1  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0273  hypothetical protein  38.67 
 
 		 277 aa  47.8  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0772  alpha/beta fold family hydrolase  30.1 
 
 		 271 aa  47.8  0.0005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2650  dienelactone hydrolase  29.31 
 
 		 265 aa  47.4  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2665  dienelactone hydrolase  29.31 
 
 		 265 aa  47.4  0.0007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.858071  normal  0.690988 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2432  alpha/beta hydrolase fold  28.15 
 
 		 277 aa  47.4  0.0007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2621  dienelactone hydrolase  29.31 
 
 		 265 aa  47.4  0.0007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01664  hydrolase, alpha/beta fold family, putative  42.86 
 
 		 272 aa  46.6  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.178176  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6158  peptidase S15  27.34 
 
 		 295 aa  46.6  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0358  cinnamoyl ester hydrolase  33.33 
 
 		 281 aa  47  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1727  dienelactone hydrolase  31.43 
 
 		 254 aa  46.2  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1525  dienelactone hydrolase  30.51 
 
 		 241 aa  46.2  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.4212  normal  0.461619 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5514  ABC transporter related  27.41 
 
 		 968 aa  46.2  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1616  dienelactone hydrolase  26.63 
 
 		 263 aa  45.8  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.555158 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2042  carboxymethylenebutenolidase  28.5 
 
 		 291 aa  45.4  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000295478 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4372  alpha/beta hydrolase fold  31.53 
 
 		 296 aa  45.8  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6451  peptidase S15  27.34 
 
 		 295 aa  45.8  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0515284  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0374  Acylglycerol lipase  26.9 
 
 		 279 aa  46.2  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0356  alpha/beta hydrolase fold  28.12 
 
 		 256 aa  45.4  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.122696  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1417  peptidase S15  29.51 
 
 		 321 aa  45.1  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4389  hypothetical protein  37.27 
 
 		 255 aa  45.1  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7336  Alpha/beta hydrolase  27.87 
 
 		 315 aa  45.1  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5410  alpha/beta hydrolase fold protein  27.6 
 
 		 322 aa  45.4  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.459598  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2009  dienelactone hydrolase  26.24 
 
 		 310 aa  45.1  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1704  alpha/beta fold family hydrolase  28.79 
 
 		 262 aa  44.7  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000659233  normal  0.0248748 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40820  putative hydrolase  27.94 
 
 		 291 aa  44.7  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1150  dienelactone hydrolase  32.06 
 
 		 254 aa  44.7  0.005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3409  carboxymethylenebutenolidase  23.68 
 
 		 295 aa  44.7  0.005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4353  Carboxymethylenebutenolidase  25.86 
 
 		 275 aa  44.7  0.005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2790  alpha/beta hydrolase fold protein  32.38 
 
 		 276 aa  44.7  0.005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.067584  normal  0.84932 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2765  peptidase S15  33.03 
 
 		 254 aa  44.7  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.835133 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0666  dienelactone hydrolase  25.49 
 
 		 284 aa  44.3  0.006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1347  putative lipase  31.2 
 
 		 278 aa  44.3  0.006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0883  triacylglycerol lipase  25.83 
 
 		 301 aa  43.9  0.007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.613439  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0518  acylglycerol lipase  26.59 
 
 		 277 aa  43.9  0.008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.645485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2054  alpha/beta hydrolase fold  22.22 
 
 		 252 aa  43.5  0.009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0866141  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25840  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  33.33 
 
 		 944 aa  43.5  0.009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.128345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0369  esterase  32.14 
 
 		 241 aa  43.5  0.009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.284863  normal  0.0288609 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3465  peptidase S15  28.95 
 
 		 317 aa  43.5  0.009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.499781 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>