46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_2726 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_2726  hypothetical protein  100 
 
 		 510 aa  981    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.313145 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3351  putative membrane protein of unknown function  60.99 
 
 		 491 aa  484  1e-135  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.881704 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0253  hypothetical protein  52.04 
 
 		 493 aa  417  9.999999999999999e-116  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1690  dienelactone hydrolase  42.8 
 
 		 534 aa  381  1e-104  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1247  hypothetical protein  43.91 
 
 		 546 aa  378  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000443968 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3774  hypothetical protein  44.4 
 
 		 533 aa  371  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0113955  normal  0.0693003 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4020  hypothetical protein  43.37 
 
 		 536 aa  362  1e-98  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.905898  normal  0.886685 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1522  dienelactone hydrolase  48.47 
 
 		 512 aa  340  4e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1627  dienelactone hydrolase  43.1 
 
 		 526 aa  310  5.9999999999999995e-83  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.776343  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2066  dienelactone hydrolase  42.92 
 
 		 506 aa  272  1e-71  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.399368 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0477  hypothetical protein  42.56 
 
 		 498 aa  246  8e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2129  hypothetical protein  42.35 
 
 		 498 aa  244  3e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2400  hypothetical protein  42.14 
 
 		 498 aa  236  8e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.330729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3970  hypothetical protein  31.24 
 
 		 501 aa  145  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0757024 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4116  hypothetical protein  36.08 
 
 		 363 aa  137  5e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.173783  normal  0.516746 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1186  hypothetical protein  26.87 
 
 		 576 aa  56.2  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.710855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6460  peptidase S15  31.08 
 
 		 308 aa  51.2  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.412944  normal  0.0890268 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4372  alpha/beta hydrolase fold  32.5 
 
 		 296 aa  50.8  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2113  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase related protein  31.36 
 
 		 474 aa  50.1  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3976  dienelactone hydrolase  30.32 
 
 		 296 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1003  hydrolase of the alpha/beta superfamily  30.83 
 
 		 377 aa  49.7  0.0001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.508552 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1972  alpha/beta hydrolase fold  32.76 
 
 		 302 aa  49.3  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0542244  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2009  dienelactone hydrolase  30.19 
 
 		 310 aa  48.1  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0819  hypothetical protein  27.38 
 
 		 253 aa  48.5  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3126  alpha/beta hydrolase fold  31.78 
 
 		 303 aa  46.6  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.221809  normal  0.0127742 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1530  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase related protein  32.76 
 
 		 463 aa  46.2  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6528  ABC transporter related  36.29 
 
 		 897 aa  46.6  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0392546  normal  0.0789085 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1011  hypothetical protein  35.64 
 
 		 329 aa  45.8  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.676735  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5514  ABC transporter related  25.81 
 
 		 968 aa  45.4  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04550  lysophospholipase  30.88 
 
 		 290 aa  46.2  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2621  dienelactone hydrolase  34.82 
 
 		 265 aa  45.1  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1754  alpha/beta hydrolase fold  30.47 
 
 		 313 aa  45.4  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2650  dienelactone hydrolase  34.82 
 
 		 265 aa  45.1  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1735  alpha/beta hydrolase fold  30.47 
 
 		 313 aa  45.1  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.319321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2665  dienelactone hydrolase  34.82 
 
 		 265 aa  45.1  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.858071  normal  0.690988 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1801  alpha/beta hydrolase fold  30.47 
 
 		 313 aa  45.4  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.920716  normal  0.37834 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6851  ABC-type multidrug transport system ATPase component-like protein  32.46 
 
 		 866 aa  44.7  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2807  hypothetical protein  32.2 
 
 		 312 aa  44.3  0.005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.550241  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2322  ABC transporter-like protein  29.84 
 
 		 876 aa  43.9  0.006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.255775 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3671  alpha/beta hydrolase fold  30.43 
 
 		 314 aa  43.9  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.416177 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01664  hydrolase, alpha/beta fold family, putative  45.45 
 
 		 272 aa  44.3  0.006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.178176  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2901  alpha/beta hydrolase fold  34.44 
 
 		 272 aa  43.9  0.007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0641701  normal  0.105734 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1544  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase related protein  28.28 
 
 		 448 aa  43.9  0.007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000180144  normal  0.131474 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2852  alpha/beta hydrolase fold  24.34 
 
 		 297 aa  43.9  0.007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.142259  normal  0.522222 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16031  putative alpha/beta hydrolase superfamily protein  21.43 
 
 		 323 aa  43.9  0.008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6845  hypothetical protein  24.84 
 
 		 306 aa  43.5  0.01  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>