63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_1186 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_1186  hypothetical protein  100 
 
 
576 aa  1144    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.710855  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1627  dienelactone hydrolase  28.69 
 
 
526 aa  75.1  0.000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.776343  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1522  dienelactone hydrolase  29.69 
 
 
512 aa  69.3  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1247  hypothetical protein  26.23 
 
 
546 aa  64.7  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000443968 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3774  hypothetical protein  25.96 
 
 
533 aa  57.8  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0113955  normal  0.0693003 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1690  dienelactone hydrolase  26.64 
 
 
534 aa  57.8  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4020  hypothetical protein  26.17 
 
 
536 aa  57.4  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.905898  normal  0.886685 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0293  Dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase  33.05 
 
 
321 aa  55.8  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.744416  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1264  dienelactone hydrolase domain protein  29.45 
 
 
305 aa  55.8  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2726  hypothetical protein  26.87 
 
 
510 aa  55.8  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.313145 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3351  putative membrane protein of unknown function  27.23 
 
 
491 aa  55.1  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.881704 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0253  hypothetical protein  26.72 
 
 
493 aa  54.3  0.000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1165  alpha/beta superfamily hydrolase  28.77 
 
 
305 aa  53.9  0.000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0773  esterase  33.64 
 
 
249 aa  53.5  0.000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000177288  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0732  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  25.95 
 
 
748 aa  53.5  0.000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0814063  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4518  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  31.06 
 
 
652 aa  53.1  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.164406 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0398  peptidase  34.15 
 
 
657 aa  53.1  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0785  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  29.01 
 
 
771 aa  52.4  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.355862  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1211  hypothetical protein  28.08 
 
 
305 aa  52  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0650  dipeptidyl-peptidase IV  28.24 
 
 
763 aa  52  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00104928  normal  0.120893 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4176  alpha/beta superfamily hydrolase  28.08 
 
 
305 aa  51.6  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3372  dipeptidyl-peptidase IV  28.24 
 
 
763 aa  51.6  0.00004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0367236  normal  0.0127919 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0448  peptidase  31.01 
 
 
678 aa  51.2  0.00005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.547634 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4260  hypothetical protein  33.9 
 
 
429 aa  50.8  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.241726 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2066  dienelactone hydrolase  26.46 
 
 
506 aa  50.4  0.00009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.399368 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2790  peptidase S15  30.47 
 
 
297 aa  50.4  0.00009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.23186 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3662  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  28.24 
 
 
766 aa  50.1  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0549477  hitchhiker  0.000000187493 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3843  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  28.24 
 
 
771 aa  50.1  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.036555  unclonable  0.0000141613 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3990  dipeptidyl peptidase IV  23.53 
 
 
763 aa  50.1  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3720  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  28.24 
 
 
767 aa  49.3  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0109234  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0677  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  28.24 
 
 
760 aa  49.3  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00440025  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0814  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  23.11 
 
 
765 aa  49.7  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000313146  hitchhiker  0.0000639736 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7591  alpha/beta fold family hydrolase  33.93 
 
 
301 aa  49.3  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0212  dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase-like protein  26.05 
 
 
257 aa  48.5  0.0003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09450  hypothetical protein  28.68 
 
 
348 aa  48.9  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.513646  normal  0.860642 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0456  hypothetical protein  34.78 
 
 
425 aa  48.5  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.891224  normal  0.426984 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0649  dipeptidyl-peptidase IV  27.48 
 
 
763 aa  48.9  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000821828  hitchhiker  0.00018889 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3769  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  26.56 
 
 
768 aa  48.5  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000158089  hitchhiker  0.00225371 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0256  ABC transporter related  47.27 
 
 
948 aa  48.5  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0574193 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0774  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  22.69 
 
 
750 aa  48.1  0.0004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00925268  hitchhiker  0.00131566 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6528  ABC transporter related  33.33 
 
 
897 aa  48.1  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0392546  normal  0.0789085 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2303  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  30.47 
 
 
615 aa  47.8  0.0006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0047  putative signal peptide protein  25.13 
 
 
342 aa  47.4  0.0008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.314925  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2457  putative signal peptide protein  27.27 
 
 
337 aa  47.4  0.0008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.914964  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2975  alpha/beta hydrolase fold protein  29.17 
 
 
307 aa  46.6  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0532  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  24.31 
 
 
767 aa  46.6  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.784675  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0798  hydrolase, putative  31.93 
 
 
246 aa  47  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.905028 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0039  conserved hypothetical signal peptide protein  26.99 
 
 
355 aa  46.6  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1438  membrane protein  28.89 
 
 
346 aa  45.8  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6038  hypothetical protein  32.52 
 
 
298 aa  46.2  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.491675  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0733  hypothetical protein  31.07 
 
 
342 aa  45.1  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.266553  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0838  dienelactone hydrolase  28.95 
 
 
302 aa  44.7  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18100  alpha/beta superfamily hydrolase  27.33 
 
 
318 aa  44.7  0.004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.111266  normal  0.7688 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0273  hypothetical protein  35.63 
 
 
277 aa  44.7  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0322  dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase-like protein  25.2 
 
 
274 aa  44.7  0.005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000337661  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2922  putative lipoprotein  30.09 
 
 
285 aa  44.7  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000434521 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0778  peptidase S15  32.77 
 
 
303 aa  44.3  0.006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.398198  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1578  dienelactone hydrolase  29.07 
 
 
255 aa  44.3  0.006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2985  peptidase S9B, dipeptidylpeptidase IV-like protein  25.16 
 
 
775 aa  44.3  0.007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4544  hypothetical protein  35.92 
 
 
490 aa  44.3  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0186679  normal  0.180104 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3465  peptidase S15  35.9 
 
 
317 aa  43.5  0.009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.499781 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1172  dienelactone hydrolase-like protein  30.77 
 
 
449 aa  43.9  0.009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.22553  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43540  putative hydrolase  29.93 
 
 
286 aa  43.5  0.01  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>