65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_4020 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_3774  hypothetical protein  84.96 
 
 		 533 aa  852    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0113955  normal  0.0693003 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1247  hypothetical protein  69.81 
 
 		 546 aa  704    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000443968 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4020  hypothetical protein  100 
 
 		 536 aa  1068    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.905898  normal  0.886685 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1690  dienelactone hydrolase  81.37 
 
 		 534 aa  840    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1522  dienelactone hydrolase  47.64 
 
 		 512 aa  360  4e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1627  dienelactone hydrolase  42.01 
 
 		 526 aa  353  5.9999999999999994e-96  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.776343  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2726  hypothetical protein  43.44 
 
 		 510 aa  345  2e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.313145 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3351  putative membrane protein of unknown function  39.54 
 
 		 491 aa  299  8e-80  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.881704 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2066  dienelactone hydrolase  53.61 
 
 		 506 aa  297  3e-79  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.399368 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0253  hypothetical protein  33.77 
 
 		 493 aa  257  3e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2400  hypothetical protein  30.36 
 
 		 498 aa  162  2e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.330729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2129  hypothetical protein  30.66 
 
 		 498 aa  159  2e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0477  hypothetical protein  30.27 
 
 		 498 aa  156  1e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3970  hypothetical protein  31.21 
 
 		 501 aa  119  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0757024 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4116  hypothetical protein  31.32 
 
 		 363 aa  109  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.173783  normal  0.516746 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1186  hypothetical protein  26.17 
 
 		 576 aa  57.4  0.0000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.710855  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2765  peptidase S15  34.43 
 
 		 254 aa  52.4  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.835133 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4389  hypothetical protein  35.09 
 
 		 255 aa  50.8  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3126  alpha/beta hydrolase fold  34.31 
 
 		 303 aa  50.4  0.00008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.221809  normal  0.0127742 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6938  alpha/beta hydrolase fold protein  33.65 
 
 		 279 aa  48.9  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.178748 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2432  alpha/beta hydrolase fold  30.28 
 
 		 277 aa  48.9  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3436  alpha/beta hydrolase  32.67 
 
 		 256 aa  48.9  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07460  lysophospholipase  36.61 
 
 		 300 aa  48.9  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0863462 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3582  alpha/beta hydrolase fold protein  29.41 
 
 		 305 aa  47.4  0.0007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00156295  decreased coverage  0.0000136231 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0518  acylglycerol lipase  34.26 
 
 		 277 aa  47  0.0008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.645485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1390  alpha/beta hydrolase fold  23.7 
 
 		 310 aa  46.2  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1525  dienelactone hydrolase  28.95 
 
 		 241 aa  47  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.4212  normal  0.461619 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1097  alpha/beta hydrolase fold protein  27.87 
 
 		 298 aa  46.6  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3871  alpha/beta hydrolase fold protein  38.57 
 
 		 313 aa  46.6  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0819  hypothetical protein  30.97 
 
 		 253 aa  47  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10184  lysophospholipase  33.03 
 
 		 279 aa  45.8  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3544  alpha/beta hydrolase fold  30.89 
 
 		 317 aa  46.2  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.941882  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7336  Alpha/beta hydrolase  31.86 
 
 		 315 aa  45.8  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0267  hypothetical protein  33.04 
 
 		 318 aa  45.8  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.586637  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0798  hydrolase, putative  33.33 
 
 		 246 aa  45.8  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.905028 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3409  carboxymethylenebutenolidase  26.5 
 
 		 295 aa  45.8  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4372  alpha/beta hydrolase fold  32.2 
 
 		 296 aa  45.8  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5514  ABC transporter related  26.36 
 
 		 968 aa  45.1  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1073  Alpha/beta hydrolase fold  31.73 
 
 		 269 aa  45.1  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0149  acylglycerol lipase  33.64 
 
 		 279 aa  45.1  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.78006  normal  0.636715 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2754  alpha/beta hydrolase fold protein  34.26 
 
 		 284 aa  45.1  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0374  Acylglycerol lipase  31.31 
 
 		 279 aa  45.4  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2528  alpha/beta hydrolase fold protein  36.54 
 
 		 327 aa  45.1  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.757367  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0140  acylglycerol lipase  33.64 
 
 		 279 aa  45.1  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0130  acylglycerol lipase  33.64 
 
 		 279 aa  45.4  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.414511 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6464  carboxymethylenebutenolidase  29.03 
 
 		 234 aa  45.1  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4312  dienelactone hydrolase family protein  26.36 
 
 		 295 aa  44.7  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2322  ABC transporter-like protein  30.09 
 
 		 876 aa  44.7  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.255775 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0103  alpha/beta hydrolase  30.28 
 
 		 277 aa  44.7  0.004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1560  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  39.06 
 
 		 263 aa  45.1  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02875  predicted hydrolase  26.36 
 
 		 254 aa  44.7  0.005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1667  hypothetical protein  27.74 
 
 		 311 aa  44.3  0.005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000328892  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2807  hypothetical protein  29.46 
 
 		 312 aa  44.7  0.005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.550241  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3469  dienelactone hydrolase family protein  26.36 
 
 		 295 aa  44.3  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3286  dienelactone hydrolase family protein  26.36 
 
 		 295 aa  44.3  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01664  hydrolase, alpha/beta fold family, putative  39.06 
 
 		 272 aa  44.3  0.005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.178176  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3012  alpha/beta hydrolase fold protein  27.66 
 
 		 257 aa  44.3  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2885  alpha/beta hydrolase fold protein  33.82 
 
 		 275 aa  44.3  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00297178 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0273  hypothetical protein  37.31 
 
 		 277 aa  43.9  0.007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1735  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 313 aa  43.9  0.008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.319321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1754  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 313 aa  43.9  0.008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1801  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 313 aa  43.9  0.008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.920716  normal  0.37834 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0666  dienelactone hydrolase  27.97 
 
 		 284 aa  43.5  0.009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1579  alpha/beta fold family hydrolase  26.6 
 
 		 265 aa  43.5  0.01  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1259  alpha/beta hydrolase fold  28.69 
 
 		 284 aa  43.5  0.01  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>