47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_1690 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_4020  hypothetical protein  81.37 
 
 		 536 aa  840    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.905898  normal  0.886685 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1247  hypothetical protein  68.46 
 
 		 546 aa  696    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000443968 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3774  hypothetical protein  79.28 
 
 		 533 aa  801    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0113955  normal  0.0693003 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1690  dienelactone hydrolase  100 
 
 		 534 aa  1069    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2066  dienelactone hydrolase  51.71 
 
 		 506 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.399368 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1627  dienelactone hydrolase  43.53 
 
 		 526 aa  366  1e-100  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.776343  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2726  hypothetical protein  43.81 
 
 		 510 aa  363  4e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.313145 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1522  dienelactone hydrolase  48.16 
 
 		 512 aa  355  1e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3351  putative membrane protein of unknown function  39.73 
 
 		 491 aa  310  5e-83  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.881704 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0253  hypothetical protein  34.91 
 
 		 493 aa  261  2e-68  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2400  hypothetical protein  29.98 
 
 		 498 aa  151  3e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.330729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2129  hypothetical protein  37.45 
 
 		 498 aa  146  1e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0477  hypothetical protein  37.08 
 
 		 498 aa  145  3e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3970  hypothetical protein  30.66 
 
 		 501 aa  117  6e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0757024 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4116  hypothetical protein  33.04 
 
 		 363 aa  100  6e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.173783  normal  0.516746 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1186  hypothetical protein  26.64 
 
 		 576 aa  57.8  0.0000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.710855  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2432  alpha/beta hydrolase fold  30.3 
 
 		 277 aa  50.8  0.00006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3126  alpha/beta hydrolase fold  31.25 
 
 		 303 aa  50.8  0.00006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.221809  normal  0.0127742 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3544  alpha/beta hydrolase fold  31.62 
 
 		 317 aa  47.4  0.0006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.941882  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0819  hypothetical protein  27.07 
 
 		 253 aa  47.4  0.0007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3582  alpha/beta hydrolase fold protein  29.17 
 
 		 305 aa  46.6  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00156295  decreased coverage  0.0000136231 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1097  alpha/beta hydrolase fold protein  27.83 
 
 		 298 aa  46.6  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7336  Alpha/beta hydrolase  30.83 
 
 		 315 aa  47  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3436  alpha/beta hydrolase  31.37 
 
 		 256 aa  47  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10184  lysophospholipase  33.94 
 
 		 279 aa  45.4  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4372  alpha/beta hydrolase fold  30.7 
 
 		 296 aa  45.4  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2322  ABC transporter-like protein  27.74 
 
 		 876 aa  45.1  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.255775 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1525  dienelactone hydrolase  28.57 
 
 		 241 aa  45.1  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.4212  normal  0.461619 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0518  acylglycerol lipase  31.78 
 
 		 277 aa  45.4  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.645485  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0798  hydrolase, putative  34.23 
 
 		 246 aa  44.7  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.905028 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07460  lysophospholipase  28.93 
 
 		 300 aa  45.1  0.004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0863462 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0130  acylglycerol lipase  32.48 
 
 		 279 aa  44.7  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.414511 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0149  acylglycerol lipase  32.48 
 
 		 279 aa  44.7  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.78006  normal  0.636715 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0140  acylglycerol lipase  32.48 
 
 		 279 aa  44.7  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5514  ABC transporter related  26.36 
 
 		 968 aa  44.7  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1259  alpha/beta hydrolase fold  31.19 
 
 		 284 aa  44.3  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3174  alpha/beta hydrolase fold protein  26.02 
 
 		 282 aa  43.9  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6938  alpha/beta hydrolase fold protein  29.09 
 
 		 279 aa  44.3  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.178748 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2922  alpha/beta hydrolase fold protein  26.02 
 
 		 282 aa  44.3  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0719  hypothetical protein  31.58 
 
 		 283 aa  44.3  0.006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.19261  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0356  alpha/beta hydrolase fold  27.5 
 
 		 256 aa  43.9  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.122696  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2198  alpha/beta hydrolase fold  22.44 
 
 		 343 aa  44.3  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00385806  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2528  alpha/beta hydrolase fold protein  30.72 
 
 		 327 aa  43.9  0.007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.757367  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3871  alpha/beta hydrolase fold protein  35.71 
 
 		 313 aa  43.9  0.007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3976  dienelactone hydrolase  28.57 
 
 		 296 aa  43.9  0.008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0374  Acylglycerol lipase  28.35 
 
 		 279 aa  43.5  0.01  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2765  peptidase S15  32.73 
 
 		 254 aa  43.5  0.01  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.835133 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>