37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_1627 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008789  Hhal_1627  dienelactone hydrolase  100 
 
 
526 aa  1019    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.776343  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1247  hypothetical protein  45.23 
 
 
546 aa  421  1e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000443968 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1690  dienelactone hydrolase  43.53 
 
 
534 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1522  dienelactone hydrolase  51.89 
 
 
512 aa  402  9.999999999999999e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4020  hypothetical protein  42.01 
 
 
536 aa  385  1e-106  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.905898  normal  0.886685 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3774  hypothetical protein  42.77 
 
 
533 aa  386  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0113955  normal  0.0693003 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2066  dienelactone hydrolase  44.99 
 
 
506 aa  336  7e-91  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.399368 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2726  hypothetical protein  43.57 
 
 
510 aa  324  3e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.313145 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3351  putative membrane protein of unknown function  41.96 
 
 
491 aa  308  1.0000000000000001e-82  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.881704 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0253  hypothetical protein  37.85 
 
 
493 aa  248  2e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2129  hypothetical protein  36.04 
 
 
498 aa  187  4e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0477  hypothetical protein  36.17 
 
 
498 aa  186  8e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2400  hypothetical protein  35.67 
 
 
498 aa  176  9e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.330729  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3970  hypothetical protein  31.92 
 
 
501 aa  119  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0757024 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4116  hypothetical protein  33.46 
 
 
363 aa  111  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.173783  normal  0.516746 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1186  hypothetical protein  28.69 
 
 
576 aa  75.9  0.000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.710855  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4372  alpha/beta hydrolase fold  32.48 
 
 
296 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12329  hypothetical protein  33.98 
 
 
281 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1528  alpha/beta hydrolase fold  26.67 
 
 
295 aa  48.9  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.109222  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1234  alpha/beta hydrolase fold protein  30.97 
 
 
335 aa  48.9  0.0002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.34416  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  31.52 
 
 
314 aa  47.4  0.0006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1172  dienelactone hydrolase-like protein  29 
 
 
449 aa  46.6  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.22553  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1972  alpha/beta hydrolase fold  27.27 
 
 
302 aa  46.2  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0542244  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44153  predicted protein  28.74 
 
 
507 aa  46.6  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1735  alpha/beta hydrolase fold  31.62 
 
 
313 aa  45.4  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.319321  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1801  alpha/beta hydrolase fold  31.62 
 
 
313 aa  45.4  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.920716  normal  0.37834 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0843  alpha/beta hydrolase fold protein  24.67 
 
 
333 aa  45.8  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1754  alpha/beta hydrolase fold  31.62 
 
 
313 aa  45.4  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1097  alpha/beta hydrolase fold protein  24.06 
 
 
298 aa  45.8  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6690  alpha/beta hydrolase fold  28.35 
 
 
328 aa  45.1  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1956  alpha/beta fold family hydrolase  25.42 
 
 
308 aa  45.1  0.003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.374782  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3012  alpha/beta hydrolase fold protein  27.12 
 
 
257 aa  44.7  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4937  alpha/beta hydrolase fold protein  31.45 
 
 
258 aa  44.3  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.451506  normal  0.754378 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2885  alpha/beta hydrolase fold protein  46.81 
 
 
275 aa  43.9  0.007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00297178 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0883  triacylglycerol lipase  28.81 
 
 
301 aa  43.9  0.008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.613439  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1341  putative hydrolase  32 
 
 
300 aa  43.5  0.008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2322  ABC transporter-like protein  41.51 
 
 
876 aa  43.5  0.009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.255775 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>