274 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1956 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008262  CPR_1956  alpha/beta fold family hydrolase  100 
 
 
308 aa  630  1e-180  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.374782  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2244  alpha/beta fold family hydrolase  98.04 
 
 
306 aa  618  1e-176  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1457  alpha/beta hydrolase fold  45.72 
 
 
307 aa  277  2e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.331552  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1861  hydrolase, alpha/beta fold family  46.71 
 
 
307 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3481  hydrolase, alpha/beta fold family  45.39 
 
 
307 aa  272  7e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.38371 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1976  hydrolase, alpha/beta fold family  45.72 
 
 
307 aa  270  2e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1945  alpha/beta fold family hydrolase  45.72 
 
 
307 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1718  alpha/beta hydrolase fold  45.13 
 
 
307 aa  268  7e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.170685  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1701  alpha/beta fold family hydrolase  45.72 
 
 
307 aa  268  8.999999999999999e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1898  hydrolase, alpha/beta fold family  45.72 
 
 
307 aa  267  2e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1724  alpha/beta fold family hydrolase  45.72 
 
 
307 aa  267  2e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1860  alpha/beta fold family hydrolase  45.72 
 
 
307 aa  267  2e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1676  alpha/beta fold family hydrolase  45.39 
 
 
307 aa  265  5.999999999999999e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2146  alpha/beta fold family hydrolase  40.54 
 
 
304 aa  245  6e-64  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3810  alpha/beta hydrolase fold  38.24 
 
 
326 aa  241  1e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1494  alpha/beta hydrolase fold  38.33 
 
 
326 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0365671  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2528  alpha/beta hydrolase fold protein  38.74 
 
 
327 aa  234  2.0000000000000002e-60  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.757367  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4058  alpha/beta hydrolase fold  36.67 
 
 
314 aa  222  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1338  alpha/beta hydrolase fold  36 
 
 
314 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.51137  normal  0.315185 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4551  alpha/beta fold family hydrolase  36 
 
 
314 aa  220  3e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0902601  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4355  Alpha/beta hydrolase fold  38.52 
 
 
314 aa  218  1e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0367  lysophospholipase-like protein  37.17 
 
 
313 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3846  alpha/beta hydrolase fold  37 
 
 
314 aa  210  3e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1823  hypothetical protein  38.16 
 
 
316 aa  208  1e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.334434  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21320  hypothetical protein  37.46 
 
 
316 aa  206  3e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.964841  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3544  alpha/beta hydrolase fold  35.03 
 
 
317 aa  204  1e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.941882  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1390  alpha/beta hydrolase fold  34.75 
 
 
310 aa  197  2.0000000000000003e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1814  lysophospholipase  35.41 
 
 
310 aa  191  9e-48  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1032  alpha/beta hydrolase fold protein  36.46 
 
 
324 aa  189  7e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.212267 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0367  alpha/beta hydrolase fold  36.81 
 
 
306 aa  184  2.0000000000000003e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00100514  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1717  lysophospholipase L2  33.93 
 
 
314 aa  183  4.0000000000000006e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21580  lysophospholipase  34.97 
 
 
313 aa  175  8e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.768051  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2119  hypothetical protein  30.43 
 
 
314 aa  172  5e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.651142  normal  0.48644 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2931  hypothetical protein  32.57 
 
 
316 aa  171  1e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2882  alpha/beta hydrolase fold protein  33.7 
 
 
309 aa  171  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.355624  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0869  alpha/beta fold family hydrolase  31.79 
 
 
308 aa  166  5e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.381761  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1458  hypothetical protein  30.22 
 
 
314 aa  164  2.0000000000000002e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.969107  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1413  hypothetical protein  30.22 
 
 
323 aa  164  2.0000000000000002e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2622  alpha/beta hydrolase fold  32 
 
 
314 aa  163  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.790671  normal  0.924395 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1387  alpha/beta hydrolase fold  33.94 
 
 
305 aa  159  6e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1361  alpha/beta hydrolase fold  33.94 
 
 
305 aa  159  6e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000732277  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl099  lysophospholipase  33.45 
 
 
309 aa  156  4e-37  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4031  putative lysophospholipase L2  31.31 
 
 
291 aa  154  1e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.17288  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2041  alpha/beta hydrolase fold protein  30.51 
 
 
306 aa  152  1e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12170  lysophospholipase  30.56 
 
 
334 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2622  hypothetical protein  30.32 
 
 
312 aa  147  2.0000000000000003e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0847  hypothetical protein  29.39 
 
 
301 aa  143  3e-33  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.653287  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2034  alpha/beta hydrolase fold  30.13 
 
 
311 aa  140  3e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0738  lysophospholipase  28.67 
 
 
310 aa  132  9e-30  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000217511  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0726  alpha/beta hydrolase fold  26.76 
 
 
310 aa  129  7.000000000000001e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0989591  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0898  lysophospholipase-like protein  27.3 
 
 
308 aa  125  6e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.308964 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1097  alpha/beta hydrolase fold protein  29.43 
 
 
298 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11180  lysophospholipase  26.58 
 
 
308 aa  115  6.9999999999999995e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.529406 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1234  alpha/beta hydrolase fold protein  31.43 
 
 
335 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.34416  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1122  hydrolase  27.52 
 
 
310 aa  108  1e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0567705  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1713  alpha/beta hydrolase fold protein  27.53 
 
 
267 aa  89  9e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2671  alpha/beta hydrolase fold protein  24.26 
 
 
270 aa  84  0.000000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.661252 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0518  acylglycerol lipase  24.03 
 
 
277 aa  83.2  0.000000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.645485  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0150  alpha/beta hydrolase fold  25.09 
 
 
279 aa  82  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0681813  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2871  alpha/beta fold family hydrolase  23.58 
 
 
303 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.856592  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2932  alpha/beta fold family hydrolase  23.58 
 
 
303 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl474  lysophospholipase  25 
 
 
309 aa  79  0.0000000000001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0415  alpha/beta fold family hydrolase  23.72 
 
 
303 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0214  alpha/beta fold family hydrolase  23.27 
 
 
280 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2559  alpha/beta fold family hydrolase  23.27 
 
 
280 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0935  alpha/beta fold family hydrolase  23.72 
 
 
303 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2981  alpha/beta fold family hydrolase  23.72 
 
 
303 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0130  acylglycerol lipase  25.17 
 
 
279 aa  76.6  0.0000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.414511 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10184  lysophospholipase  24.75 
 
 
279 aa  77  0.0000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0140  acylglycerol lipase  25.44 
 
 
279 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0149  acylglycerol lipase  25.44 
 
 
279 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.78006  normal  0.636715 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1409  alpha/beta hydrolase fold protein  32 
 
 
278 aa  73.2  0.000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.539385 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2246  alpha/beta hydrolase fold  24.92 
 
 
302 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1347  putative lipase  22.84 
 
 
278 aa  72.4  0.000000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2799  alpha/beta hydrolase fold  24.66 
 
 
284 aa  72  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.61266  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0402  alpha/beta hydrolase  30.5 
 
 
279 aa  72.4  0.00000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0934  alpha/beta hydrolase fold  23 
 
 
320 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1375  Lysophospholipase  28.33 
 
 
363 aa  70.9  0.00000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0801  Lysophospholipase-like protein  28.77 
 
 
296 aa  70.1  0.00000000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1649  alpha/beta fold family hydrolase  23.17 
 
 
318 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.605923  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31710  lysophospholipase  34.15 
 
 
274 aa  69.3  0.00000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2956  alpha/beta hydrolase fold  24.25 
 
 
277 aa  69.3  0.00000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0579  alpha/beta hydrolase fold  23.32 
 
 
302 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.483442  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1058  alpha/beta hydrolase fold  23.32 
 
 
302 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4171  Alpha/beta hydrolase  23 
 
 
306 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.753522 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_157  hydrolase, alpha/beta fold family  24.22 
 
 
277 aa  68.2  0.0000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.379638  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0374  Acylglycerol lipase  25 
 
 
279 aa  67.4  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1017  alpha/beta hydrolase fold  23 
 
 
302 aa  67  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2790  alpha/beta hydrolase fold protein  24.24 
 
 
276 aa  66.6  0.0000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.067584  normal  0.84932 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4867  alpha/beta hydrolase fold  31.17 
 
 
328 aa  65.9  0.0000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.606344 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1050  alpha/beta hydrolase fold protein  31.36 
 
 
345 aa  65.5  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.10497  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3556  alpha/beta hydrolase fold protein  26.33 
 
 
330 aa  65.5  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.108163 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1698  alpha/beta hydrolase fold protein  31.54 
 
 
559 aa  63.9  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90406  hitchhiker  0.0000305694 
 
 
-
 
NC_002936  DET0149  alpha/beta fold family hydrolase  24.04 
 
 
277 aa  63.5  0.000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0222  acylglycerol lipase  24.57 
 
 
277 aa  63.5  0.000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6038  alpha/beta hydrolase fold  28.79 
 
 
294 aa  63.2  0.000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0615  alpha/beta hydrolase fold  33.64 
 
 
268 aa  63.2  0.000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1597  Acylglycerol lipase  23.51 
 
 
288 aa  63.2  0.000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.581241  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0197  acylglycerol lipase  35.19 
 
 
288 aa  62.8  0.000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.868848 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1664  alpha/beta hydrolase fold  31.78 
 
 
341 aa  62.4  0.000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>