44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_3351 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_3351  putative membrane protein of unknown function  100 
 
 		 491 aa  956    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.881704 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2726  hypothetical protein  61.95 
 
 		 510 aa  510  1e-143  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.313145 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0253  hypothetical protein  50.72 
 
 		 493 aa  430  1e-119  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1247  hypothetical protein  43.18 
 
 		 546 aa  354  2e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000443968 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3774  hypothetical protein  41.11 
 
 		 533 aa  345  8e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0113955  normal  0.0693003 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1690  dienelactone hydrolase  39.73 
 
 		 534 aa  340  2.9999999999999998e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4020  hypothetical protein  39.58 
 
 		 536 aa  330  4e-89  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.905898  normal  0.886685 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1627  dienelactone hydrolase  41.88 
 
 		 526 aa  310  5e-83  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.776343  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1522  dienelactone hydrolase  46.17 
 
 		 512 aa  299  6e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2066  dienelactone hydrolase  42.56 
 
 		 506 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.399368 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2400  hypothetical protein  41.8 
 
 		 498 aa  260  5.0000000000000005e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.330729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2129  hypothetical protein  44.33 
 
 		 498 aa  260  5.0000000000000005e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0477  hypothetical protein  44 
 
 		 498 aa  259  8e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3970  hypothetical protein  35.24 
 
 		 501 aa  119  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0757024 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4116  hypothetical protein  33.98 
 
 		 363 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.173783  normal  0.516746 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1186  hypothetical protein  27.23 
 
 		 576 aa  56.2  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.710855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2113  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase related protein  29.37 
 
 		 474 aa  51.2  0.00004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4372  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 296 aa  50.4  0.00007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1801  alpha/beta hydrolase fold  32.28 
 
 		 313 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.920716  normal  0.37834 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1735  alpha/beta hydrolase fold  32.28 
 
 		 313 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.319321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1754  alpha/beta hydrolase fold  32.28 
 
 		 313 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1417  peptidase S15  31.36 
 
 		 321 aa  48.5  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1530  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase related protein  27.78 
 
 		 463 aa  47.8  0.0005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01664  hydrolase, alpha/beta fold family, putative  48.94 
 
 		 272 aa  47.8  0.0005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.178176  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5514  ABC transporter related  28.36 
 
 		 968 aa  47.4  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0256  hypothetical protein  27.81 
 
 		 485 aa  47  0.0008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0267  hypothetical protein  30 
 
 		 318 aa  46.2  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.586637  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6528  ABC transporter related  37.23 
 
 		 897 aa  46.2  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0392546  normal  0.0789085 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3871  alpha/beta hydrolase fold protein  34.09 
 
 		 313 aa  46.2  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2807  hypothetical protein  33.87 
 
 		 312 aa  45.8  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.550241  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3008  alpha/beta hydrolase fold  31.45 
 
 		 295 aa  45.4  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.792567  normal  0.417001 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2322  ABC transporter-like protein  28.57 
 
 		 876 aa  45.4  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.255775 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2964  alpha/beta hydrolase fold  31.45 
 
 		 295 aa  45.4  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0497  BAAT/Acyl-CoA thioester hydrolase  32.17 
 
 		 326 aa  45.1  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.702531  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2852  alpha/beta hydrolase fold  25.64 
 
 		 297 aa  44.7  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.142259  normal  0.522222 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1150  dienelactone hydrolase  33.98 
 
 		 254 aa  44.3  0.004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1525  dienelactone hydrolase  31.53 
 
 		 241 aa  44.7  0.004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.4212  normal  0.461619 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3021  peptidase S15  28.46 
 
 		 292 aa  44.7  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3465  peptidase S15  30.58 
 
 		 317 aa  44.7  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.499781 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7336  Alpha/beta hydrolase  27.42 
 
 		 315 aa  44.3  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6460  peptidase S15  27.42 
 
 		 308 aa  44.3  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.412944  normal  0.0890268 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3471  alpha/beta hydrolase fold protein  27.91 
 
 		 272 aa  43.9  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.525161  normal  0.0346812 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1491  hypothetical protein  28.57 
 
 		 236 aa  43.5  0.01  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.199591  normal  0.464106 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0798  hydrolase, putative  35.87 
 
 		 246 aa  43.5  0.01  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.905028 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>