62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2066 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_2066  dienelactone hydrolase  100 
 
 		 506 aa  975    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.399368 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1247  hypothetical protein  56.42 
 
 		 546 aa  509  1e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000443968 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1690  dienelactone hydrolase  52.28 
 
 		 534 aa  479  1e-134  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3774  hypothetical protein  54 
 
 		 533 aa  473  1e-132  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0113955  normal  0.0693003 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4020  hypothetical protein  49.62 
 
 		 536 aa  450  1e-125  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.905898  normal  0.886685 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1627  dienelactone hydrolase  45.19 
 
 		 526 aa  364  2e-99  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.776343  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1522  dienelactone hydrolase  50.91 
 
 		 512 aa  361  1e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2726  hypothetical protein  42.71 
 
 		 510 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.313145 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3351  putative membrane protein of unknown function  41.8 
 
 		 491 aa  296  6e-79  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.881704 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0253  hypothetical protein  36.24 
 
 		 493 aa  242  1e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2129  hypothetical protein  35.58 
 
 		 498 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0477  hypothetical protein  35.17 
 
 		 498 aa  147  6e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2400  hypothetical protein  34.35 
 
 		 498 aa  145  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.330729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3970  hypothetical protein  29.82 
 
 		 501 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0757024 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4116  hypothetical protein  33.62 
 
 		 363 aa  94.4  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.173783  normal  0.516746 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2600  Carboxymethylenebutenolidase  35.07 
 
 		 264 aa  57  0.0000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4372  alpha/beta hydrolase fold  34.78 
 
 		 296 aa  55.8  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4246  dipeptidyl aminopeptidases/acylaminoacyl-peptidases-like  32.41 
 
 		 316 aa  55.1  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.760723  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0819  hypothetical protein  32.46 
 
 		 253 aa  53.9  0.000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2322  ABC transporter-like protein  32.56 
 
 		 876 aa  52.4  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.255775 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1186  hypothetical protein  26.46 
 
 		 576 aa  52  0.00003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.710855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1801  alpha/beta hydrolase fold  35.14 
 
 		 313 aa  51.2  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.920716  normal  0.37834 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1754  alpha/beta hydrolase fold  35.14 
 
 		 313 aa  51.2  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1735  alpha/beta hydrolase fold  35.14 
 
 		 313 aa  51.2  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.319321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3830  Triacylglycerol lipase  34.23 
 
 		 298 aa  50.8  0.00006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0300878  normal  0.0105482 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7336  Alpha/beta hydrolase  28.69 
 
 		 315 aa  50.4  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1417  peptidase S15  33.61 
 
 		 321 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6851  ABC-type multidrug transport system ATPase component-like protein  31.71 
 
 		 866 aa  48.9  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3976  dienelactone hydrolase  33.33 
 
 		 296 aa  49.3  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1972  alpha/beta hydrolase fold  31.48 
 
 		 302 aa  49.3  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0542244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6460  peptidase S15  30.65 
 
 		 308 aa  48.1  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.412944  normal  0.0890268 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2964  alpha/beta hydrolase fold  28.1 
 
 		 295 aa  48.5  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3008  alpha/beta hydrolase fold  28.1 
 
 		 295 aa  48.5  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.792567  normal  0.417001 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2348  alpha/beta hydrolase fold protein  27.41 
 
 		 275 aa  48.5  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01664  hydrolase, alpha/beta fold family, putative  50 
 
 		 272 aa  47  0.0007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.178176  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0267  hypothetical protein  30.63 
 
 		 318 aa  46.2  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.586637  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6451  peptidase S15  29.05 
 
 		 295 aa  46.2  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0515284  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2885  alpha/beta hydrolase fold protein  33.63 
 
 		 275 aa  46.2  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00297178 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0440  ABC transporter related protein  29.63 
 
 		 868 aa  45.8  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.620247 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2905  hypothetical protein  31.4 
 
 		 295 aa  45.8  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000728427  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5514  ABC transporter related  30.83 
 
 		 968 aa  45.1  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2621  dienelactone hydrolase  29.08 
 
 		 265 aa  45.1  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2650  dienelactone hydrolase  29.08 
 
 		 265 aa  45.1  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2665  dienelactone hydrolase  29.08 
 
 		 265 aa  45.1  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.858071  normal  0.690988 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1525  dienelactone hydrolase  32.48 
 
 		 241 aa  44.7  0.004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.4212  normal  0.461619 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2852  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 		 297 aa  44.7  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.142259  normal  0.522222 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1727  dienelactone hydrolase  32.99 
 
 		 254 aa  44.3  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33270  Dienelactone hydrolase protein  26.73 
 
 		 261 aa  44.3  0.006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.669671  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4484  BAAT/Acyl-CoA thioester hydrolase  37.63 
 
 		 477 aa  43.9  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.061544  normal  0.0537303 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3126  alpha/beta hydrolase fold  27.78 
 
 		 303 aa  43.9  0.006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.221809  normal  0.0127742 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3471  alpha/beta hydrolase fold protein  27.07 
 
 		 272 aa  44.3  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.525161  normal  0.0346812 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0594  dienelactone hydrolase  29.75 
 
 		 305 aa  44.3  0.006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0256  hypothetical protein  30.3 
 
 		 485 aa  44.3  0.006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1021  alpha/beta hydrolase fold protein  29.75 
 
 		 286 aa  43.5  0.008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.256677  normal  0.0572877 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3582  alpha/beta hydrolase fold protein  30.91 
 
 		 305 aa  43.5  0.008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00156295  decreased coverage  0.0000136231 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1886  hypothetical protein  30.15 
 
 		 326 aa  43.5  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2807  hypothetical protein  28.35 
 
 		 312 aa  43.5  0.008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.550241  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0596  putative hydrolase  37.5 
 
 		 298 aa  43.5  0.009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.443892 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0815  putative hydrolase  36.36 
 
 		 298 aa  43.5  0.009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04550  lysophospholipase  35.59 
 
 		 290 aa  43.1  0.01  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6938  alpha/beta hydrolase fold protein  27.27 
 
 		 279 aa  43.1  0.01  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.178748 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3671  alpha/beta hydrolase fold  27.86 
 
 		 314 aa  43.5  0.01  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.416177 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>