94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_0596 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_0596  putative hydrolase  100 
 
 
298 aa  597  1e-169  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.443892 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0575  putative hydrolase  98.99 
 
 
298 aa  589  1e-167  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1341  putative hydrolase  71.58 
 
 
300 aa  408  1e-113  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0815  putative hydrolase  65.77 
 
 
298 aa  385  1e-106  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40820  putative hydrolase  49.04 
 
 
291 aa  248  9e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3462  putative hydrolase  47.31 
 
 
291 aa  236  3e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.339923  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0808  hypothetical protein  36.1 
 
 
285 aa  191  9e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00976323  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1464  hypothetical protein  32.73 
 
 
328 aa  188  1e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0797  putative hydrolase  40.64 
 
 
330 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0805  alpha/beta hydrolase fold  40.93 
 
 
302 aa  169  6e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.308415  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0316  Alpha/beta hydrolase fold  39.46 
 
 
317 aa  168  8e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.151069  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4634  hypothetical protein  40 
 
 
314 aa  168  1e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4620  alpha/beta hydrolase fold  40.23 
 
 
300 aa  168  1e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.505321  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4496  alpha/beta hydrolase-like protein  39.62 
 
 
302 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1918  alpha/beta hydrolase  41.43 
 
 
325 aa  163  3e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1095  alpha/beta hydrolase fold  38.36 
 
 
348 aa  155  7e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0569  alpha/beta hydrolase  41.57 
 
 
325 aa  155  9e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2192  alpha/beta hydrolase  36.57 
 
 
346 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.457111  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2091  alpha/beta hydrolase  38.43 
 
 
352 aa  153  4e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5485  Alpha/beta hydrolase  37.12 
 
 
346 aa  152  7e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2214  alpha/beta hydrolase  37.87 
 
 
357 aa  152  8e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5902  alpha/beta hydrolase  36.19 
 
 
346 aa  152  1e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.169357  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2175  alpha/beta hydrolase  36.19 
 
 
346 aa  152  1e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.306533  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1457  alpha/beta hydrolase  36.25 
 
 
303 aa  149  4e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2728  hypothetical protein  37.05 
 
 
336 aa  149  7e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0371718  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2670  hypothetical protein  37.05 
 
 
417 aa  149  8e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.686285  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2916  hypothetical protein  36.69 
 
 
336 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.282253  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1684  hypothetical protein  36.69 
 
 
336 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.490109  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0643  hypothetical protein  36.69 
 
 
336 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.107821  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2369  hypothetical protein  36.69 
 
 
336 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.841526  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0427  alpha/beta hydrolase fold  38.11 
 
 
289 aa  147  3e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0205  alpha/beta hydrolase  36.36 
 
 
328 aa  144  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3610  Alpha/beta hydrolase  38.11 
 
 
289 aa  143  3e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.830859 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0438  hypothetical protein  39.37 
 
 
312 aa  142  5e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.124542 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1490  alpha/beta fold family hydrolase  37.1 
 
 
462 aa  142  7e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.679445  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3029  hypothetical protein  37.1 
 
 
295 aa  142  8e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1460  alpha/beta fold family hydrolase  37.1 
 
 
293 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.93684  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0548  hypothetical protein  37.1 
 
 
293 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.491359  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0605  hypothetical protein  37.1 
 
 
293 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1818  hypothetical protein  35.61 
 
 
473 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1594  alpha/beta fold family hydrolase  37.1 
 
 
293 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1265  hypothetical protein  37.1 
 
 
293 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00885366  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1273  hypothetical protein  31.27 
 
 
296 aa  136  4e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0496483  hitchhiker  0.00827301 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1964  hypothetical protein  34.98 
 
 
291 aa  135  6.0000000000000005e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0677628  normal  0.253327 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00524  alpha/beta hydrolase-like protein  27.8 
 
 
288 aa  134  1.9999999999999998e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1897  alpha/beta hydrolase-like protein  29.7 
 
 
321 aa  132  5e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.249943  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2795  hypothetical protein  36.14 
 
 
293 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0611315  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4058  alpha/beta hydrolase-like protein  33.9 
 
 
292 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1984  alpha/beta hydrolase  36.8 
 
 
327 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2873  alpha/beta hydrolase  36.65 
 
 
291 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.723814  normal  0.157524 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2212  hypothetical protein  30.3 
 
 
297 aa  129  7.000000000000001e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.140894 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2079  hypothetical protein  34.04 
 
 
301 aa  127  3e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.16044 
 
 
-
 
NC_003296  RS01912  hypothetical protein  33.33 
 
 
290 aa  124  2e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0709181 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3632  alpha/beta hydrolase-like protein  34.53 
 
 
295 aa  123  4e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4709  alpha/beta hydrolase-like protein  34.53 
 
 
295 aa  123  4e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0396894  decreased coverage  0.00396778 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0520  hypothetical protein  28.83 
 
 
287 aa  121  9.999999999999999e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3867  alpha/beta hydrolase-like protein  33.99 
 
 
305 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.55924 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4327  alpha/beta hydrolase-like protein  33.96 
 
 
305 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48210  putative hydrolase  34.17 
 
 
294 aa  120  3e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000506825  normal  0.0564296 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1527  alpha/beta hydrolase-like  33.45 
 
 
305 aa  119  7e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.114402 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21420  predicted alpha/beta hydrolase  36.79 
 
 
300 aa  117  3e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0686  hypothetical protein  30.5 
 
 
286 aa  117  3e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0130174 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5870  alpha/beta hydrolase-like protein  33.45 
 
 
305 aa  116  5e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.205699 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3931  alpha/beta hydrolase-like  32.01 
 
 
305 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.269531  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4435  alpha/beta hydrolase-like protein  32.01 
 
 
305 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47510  putative hydrolase  34.54 
 
 
279 aa  105  6e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0288  hypothetical protein  32.71 
 
 
290 aa  100  3e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.935727  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0301  hypothetical protein  32.71 
 
 
290 aa  100  3e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.851897  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2996  alpha/beta hydrolase-like protein  31.58 
 
 
306 aa  93.6  4e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.983134  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3343  alpha/beta hydrolase-like protein  31.58 
 
 
306 aa  93.6  4e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1672  alpha/beta hydrolase fold  34.29 
 
 
288 aa  88.6  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.324929  normal  0.537045 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3622  alpha/beta hydrolase fold protein  38.62 
 
 
301 aa  88.6  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1678  hypothetical protein  32.38 
 
 
284 aa  75.9  0.0000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2936  alpha/beta hydrolase fold  29.88 
 
 
317 aa  72.8  0.000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0681221 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3956  alpha/beta hydrolase fold  32.31 
 
 
334 aa  70.9  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00786101  normal  0.0406632 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2606  alpha/beta hydrolase  28.97 
 
 
278 aa  62.8  0.000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.210789  normal  0.690565 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1504  hypothetical protein  28.45 
 
 
308 aa  60.1  0.00000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0349086  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3679  alpha/beta hydrolase fold protein  23.57 
 
 
279 aa  56.6  0.0000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.2542  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10184  lysophospholipase  31.37 
 
 
279 aa  49.3  0.00008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0150  alpha/beta hydrolase fold  32.35 
 
 
279 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0681813  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1713  alpha/beta hydrolase fold protein  27.41 
 
 
267 aa  48.9  0.0001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0878  hypothetical protein  33.33 
 
 
334 aa  48.1  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000343609  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0877  hypothetical protein  25 
 
 
316 aa  47.8  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000690525  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1450  alpha/beta hydrolase  32.26 
 
 
104 aa  45.8  0.0009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0898  lysophospholipase-like protein  27.67 
 
 
308 aa  45.4  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.308964 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0518  acylglycerol lipase  30.39 
 
 
277 aa  45.4  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.645485  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1097  alpha/beta hydrolase fold protein  26.05 
 
 
298 aa  45.8  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3672  Acylglycerol lipase  28.7 
 
 
279 aa  45.4  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2034  alpha/beta hydrolase fold  27.62 
 
 
311 aa  44.7  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3674  Acylglycerol lipase  26.15 
 
 
280 aa  44.7  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2066  dienelactone hydrolase  37.5 
 
 
506 aa  43.9  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.399368 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2246  alpha/beta hydrolase fold  34.07 
 
 
302 aa  43.9  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0374  Acylglycerol lipase  29.9 
 
 
279 aa  43.5  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2622  hypothetical protein  32.46 
 
 
312 aa  42.4  0.01  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>