37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_0253 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_0253  hypothetical protein  100 
 
 
493 aa  946    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2726  hypothetical protein  52.33 
 
 
510 aa  405  1e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.313145 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3351  putative membrane protein of unknown function  50.72 
 
 
491 aa  401  9.999999999999999e-111  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.881704 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3774  hypothetical protein  35.52 
 
 
533 aa  262  1e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0113955  normal  0.0693003 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1247  hypothetical protein  36.27 
 
 
546 aa  261  2e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000443968 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1690  dienelactone hydrolase  34.91 
 
 
534 aa  260  3e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4020  hypothetical protein  34.09 
 
 
536 aa  254  3e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.905898  normal  0.886685 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1522  dienelactone hydrolase  41.22 
 
 
512 aa  251  2e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1627  dienelactone hydrolase  36.15 
 
 
526 aa  226  5.0000000000000005e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.776343  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2129  hypothetical protein  38.9 
 
 
498 aa  187  4e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0477  hypothetical protein  38.69 
 
 
498 aa  187  5e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2400  hypothetical protein  37.14 
 
 
498 aa  183  6e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.330729  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2066  dienelactone hydrolase  39.29 
 
 
506 aa  160  4e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.399368 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3970  hypothetical protein  33.58 
 
 
501 aa  126  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0757024 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4116  hypothetical protein  32.65 
 
 
363 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.173783  normal  0.516746 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1186  hypothetical protein  26.95 
 
 
576 aa  53.9  0.000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.710855  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0536  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  35.65 
 
 
398 aa  52  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.13712  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3471  alpha/beta hydrolase fold protein  31.06 
 
 
272 aa  48.9  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.525161  normal  0.0346812 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0293  Dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase  34.21 
 
 
321 aa  48.5  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.744416  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1212  alpha/beta hydrolase fold  31.54 
 
 
344 aa  48.1  0.0004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2350  dienelactone hydrolase  27.54 
 
 
259 aa  47.4  0.0007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.722074  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4246  dipeptidyl aminopeptidases/acylaminoacyl-peptidases-like  32.2 
 
 
316 aa  47  0.0009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.760723  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4372  alpha/beta hydrolase fold  33.07 
 
 
296 aa  46.2  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3976  dienelactone hydrolase  31.9 
 
 
296 aa  46.6  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7336  Alpha/beta hydrolase  27.81 
 
 
315 aa  45.8  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6851  ABC-type multidrug transport system ATPase component-like protein  29.2 
 
 
866 aa  45.1  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3012  alpha/beta hydrolase fold protein  31.43 
 
 
257 aa  45.1  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1011  hypothetical protein  43.75 
 
 
329 aa  44.3  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.676735  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1140  alpha/beta hydrolase fold  31.75 
 
 
320 aa  44.7  0.004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.64719  normal  0.115917 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6460  peptidase S15  31.93 
 
 
308 aa  44.7  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.412944  normal  0.0890268 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2731  hypothetical protein  35 
 
 
279 aa  44.3  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3027  ABC transporter related  32.77 
 
 
1010 aa  44.3  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0527794  hitchhiker  0.00388212 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18650  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  34.75 
 
 
350 aa  43.9  0.006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.303619  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2600  Carboxymethylenebutenolidase  28.57 
 
 
264 aa  43.9  0.006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1329  hypothetical protein  33.33 
 
 
223 aa  43.5  0.009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1491  hypothetical protein  33.33 
 
 
236 aa  43.5  0.009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.199591  normal  0.464106 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2983  alpha/beta hydrolase fold protein  35.97 
 
 
303 aa  43.1  0.01  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.283426 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>