28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1011 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_1011  hypothetical protein  100 
 
 		 329 aa  672    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.676735  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1021  alpha/beta hydrolase fold protein  26.52 
 
 		 286 aa  46.6  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.256677  normal  0.0572877 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1053  alpha/beta hydrolase fold protein  35.06 
 
 		 285 aa  46.6  0.0006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4462  alpha/beta hydrolase fold protein  52.17 
 
 		 277 aa  45.8  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.18079  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4116  hypothetical protein  43.08 
 
 		 363 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.173783  normal  0.516746 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1764  alpha/beta hydrolase fold  41.33 
 
 		 271 aa  45.8  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.718391  normal  0.0637777 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16600  alpha/beta family hydrolase  34.35 
 
 		 301 aa  45.1  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.579607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0315  alpha/beta hydrolase fold  39.39 
 
 		 300 aa  44.7  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4592  alpha/beta hydrolase fold  39.39 
 
 		 296 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12329  hypothetical protein  29.06 
 
 		 281 aa  44.7  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3723  alpha/beta hydrolase fold  38.57 
 
 		 281 aa  44.7  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0906881  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7311  Alpha/beta hydrolase  37.18 
 
 		 303 aa  44.3  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.602855  normal  0.723346 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0617  peptidase S15  39.44 
 
 		 283 aa  44.3  0.003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.000016795  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4231  alpha/beta hydrolase fold protein  42.42 
 
 		 364 aa  44.3  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0282585  normal  0.128374 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3970  hypothetical protein  26.19 
 
 		 501 aa  43.9  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0757024 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1782  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  28.8 
 
 		 314 aa  44.3  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.226072  normal  0.0341375 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0253  hypothetical protein  43.75 
 
 		 493 aa  44.3  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1918  alpha/beta hydrolase  31.87 
 
 		 325 aa  44.3  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0569  alpha/beta hydrolase  32.29 
 
 		 325 aa  43.9  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3351  putative membrane protein of unknown function  29.13 
 
 		 491 aa  43.5  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.881704 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1443  putative lipoprotein  33.96 
 
 		 301 aa  43.5  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1158  hypothetical protein  39.13 
 
 		 337 aa  43.5  0.005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000000697684  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2062  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  29.25 
 
 		 314 aa  43.5  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.543903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2726  hypothetical protein  47.73 
 
 		 510 aa  43.1  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.313145 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4117  lipoprotein  33.81 
 
 		 307 aa  43.1  0.007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6851  ABC-type multidrug transport system ATPase component-like protein  27.7 
 
 		 866 aa  43.1  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4998  epocide hydrolase domain-containing protein  30.39 
 
 		 367 aa  42.7  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2004  alpha/beta hydrolase fold  37.25 
 
 		 317 aa  42.7  0.009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.914633  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>