More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4462 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4462  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 		 277 aa  544  1e-154  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.18079  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2789  alpha/beta hydrolase fold protein  59.35 
 
 		 300 aa  310  2e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00980  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  61.65 
 
 		 279 aa  306  2.0000000000000002e-82  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2223  alpha/beta hydrolase fold  61.65 
 
 		 286 aa  305  5.0000000000000004e-82  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0715  alpha/beta hydrolase fold protein  42.34 
 
 		 285 aa  155  5.0000000000000005e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.178917 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3041  alpha/beta hydrolase fold protein  37.96 
 
 		 269 aa  122  6e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.592764 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  29.63 
 
 		 262 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0928  alpha/beta hydrolase fold protein  34.27 
 
 		 285 aa  94  2e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.911189 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  31.11 
 
 		 267 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  29.3 
 
 		 265 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  27.99 
 
 		 270 aa  83.2  0.000000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  27.99 
 
 		 270 aa  83.2  0.000000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  27.99 
 
 		 270 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  27.61 
 
 		 270 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7003  alpha/beta hydrolase fold  29.86 
 
 		 291 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00535586 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0971  alpha/beta hydrolase fold  30.57 
 
 		 287 aa  79.3  0.00000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.419723 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1083  alpha/beta hydrolase fold  29.17 
 
 		 291 aa  79  0.00000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1492  alpha/beta hydrolase fold  29.51 
 
 		 291 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6337  alpha/beta hydrolase fold  29.51 
 
 		 291 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2367  alpha/beta hydrolase fold  29.23 
 
 		 291 aa  77.4  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.926143  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1083  alpha/beta hydrolase fold  28.82 
 
 		 291 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4587  hydrolase; menaquinone biosynthesis related protein; prolyl aminopeptidase  26.46 
 
 		 270 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4967  hydrolase, alpha/beta fold family  26.46 
 
 		 270 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1402  alpha/beta hydrolase fold protein  30.8 
 
 		 298 aa  74.7  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0653602  normal  0.476592 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  27.52 
 
 		 291 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7676  alpha/beta hydrolase fold protein  32.72 
 
 		 269 aa  75.1  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  27.52 
 
 		 291 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  27.52 
 
 		 291 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5546  alpha/beta hydrolase fold protein  33.68 
 
 		 264 aa  73.9  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5014  alpha/beta fold family hydrolase  26.46 
 
 		 270 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4996  hydrolase, alpha/beta fold family  26.46 
 
 		 270 aa  72.8  0.000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.556402  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0918  alpha/beta hydrolase fold  32.48 
 
 		 255 aa  72.8  0.000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.891406  normal  0.241554 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  28.01 
 
 		 290 aa  72.8  0.000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1824  alpha/beta hydrolase fold protein  30.56 
 
 		 309 aa  72.4  0.000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4609  hydrolase; menaquinone biosynthesis related protein; prolyl aminopeptidase  26.46 
 
 		 270 aa  72  0.000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4749  alpha/beta fold family hydrolase  26.12 
 
 		 270 aa  72  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0253  hydrolase, alpha/beta fold family  26.8 
 
 		 270 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000360358  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5110  alpha/beta fold family hydrolase  26.12 
 
 		 270 aa  72  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.98697  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1078  alpha/beta hydrolase fold protein  30.79 
 
 		 314 aa  71.6  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.143754 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2011  alpha/beta hydrolase fold  32.47 
 
 		 298 aa  70.9  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.404957 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2631  alpha/beta hydrolase fold protein  30 
 
 		 268 aa  70.9  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.794805 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2846  alpha/beta hydrolase  30.18 
 
 		 263 aa  70.9  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.455911  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  29.87 
 
 		 295 aa  70.9  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1736  alpha/beta hydrolase fold  32.39 
 
 		 290 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4985  SHCHC synthase  26.46 
 
 		 270 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.30423  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3664  alpha/beta hydrolase fold protein  28.91 
 
 		 350 aa  70.1  0.00000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1310  alpha/beta hydrolase fold protein  31.49 
 
 		 301 aa  70.1  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2731  hydrolase, alpha/beta fold family  30.29 
 
 		 258 aa  69.3  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0095  alpha/beta hydrolase fold  29.6 
 
 		 305 aa  68.9  0.00000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000119942  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1988  alpha/beta hydrolase superfamily protein  29.71 
 
 		 321 aa  69.3  0.00000000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.150126 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3492  alpha/beta hydrolase fold  26.83 
 
 		 270 aa  69.3  0.00000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5333  protein of unknown function DUF309  30.51 
 
 		 494 aa  69.3  0.00000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0481251 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4521  alpha/beta hydrolase fold  28.2 
 
 		 270 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.78404  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0881  alpha/beta hydrolase fold protein  30.07 
 
 		 307 aa  68.6  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.415782 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2510  alpha/beta hydrolase fold protein  30.51 
 
 		 267 aa  67.8  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00182924  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3157  alpha/beta fold family hydrolase  31.25 
 
 		 266 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3962  3-oxoadipate enol-lactonase  24.91 
 
 		 266 aa  67.8  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.535477  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5295  alpha/beta hydrolase fold  26.62 
 
 		 267 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  29.47 
 
 		 287 aa  67.4  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1548  alpha/beta hydrolase fold  26.12 
 
 		 287 aa  67.4  0.0000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.133161  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3779  cyclic nucleotide-binding protein  29.02 
 
 		 453 aa  67  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0440455  normal  0.0476196 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1310  alpha/beta hydrolase fold  28.84 
 
 		 269 aa  67  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.557665  normal  0.708974 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1981  alpha/beta hydrolase fold protein  31.27 
 
 		 278 aa  66.6  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.141718 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0572  alpha/beta hydrolase fold  30.74 
 
 		 266 aa  67  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1033  alpha/beta hydrolase fold  43.48 
 
 		 280 aa  66.6  0.0000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0702791 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1002  alpha/beta hydrolase fold  29.2 
 
 		 280 aa  66.2  0.0000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0843  Alpha/beta hydrolase fold  31.48 
 
 		 272 aa  66.2  0.0000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0269  hypothetical protein  30.74 
 
 		 293 aa  66.2  0.0000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3061  alpha/beta hydrolase fold  27.84 
 
 		 280 aa  65.5  0.0000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3219  alpha/beta hydrolase fold protein  29.01 
 
 		 270 aa  65.5  0.0000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.910977  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22060  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  35.11 
 
 		 262 aa  65.9  0.0000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00549421  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0209  alpha/beta hydrolase fold protein  30.5 
 
 		 301 aa  65.1  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.994667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3776  alpha/beta hydrolase fold  28.81 
 
 		 361 aa  65.1  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.904669  decreased coverage  0.00241214 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2677  Alpha/beta hydrolase  26.71 
 
 		 315 aa  65.1  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.219797 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0186  alpha/beta hydrolase fold protein  31.32 
 
 		 258 aa  65.1  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1259  alpha/beta hydrolase fold  28.3 
 
 		 284 aa  65.1  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1790  alpha/beta hydrolase fold  30.6 
 
 		 268 aa  65.1  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.911201  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4844  alpha/beta hydrolase fold protein  29.01 
 
 		 308 aa  64.3  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4696  alpha/beta hydrolase fold  24.57 
 
 		 270 aa  64.3  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  27.36 
 
 		 314 aa  64.3  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3182  alpha/beta hydrolase fold  28.26 
 
 		 267 aa  64.3  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.44747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0132  putative hydrolase  28.57 
 
 		 311 aa  63.9  0.000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.282626  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0084  3-oxoadipate enol-lactonase  29.93 
 
 		 282 aa  63.9  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1589  alpha/beta hydrolase fold  28.11 
 
 		 297 aa  63.5  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000678244  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3171  proline iminopeptidase  28.33 
 
 		 298 aa  63.9  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3126  alpha/beta hydrolase fold  31.4 
 
 		 303 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.221809  normal  0.0127742 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4215  alpha/beta hydrolase fold  29.43 
 
 		 271 aa  63.5  0.000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756479  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1140  alpha/beta hydrolase fold  28.47 
 
 		 320 aa  63.5  0.000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.64719  normal  0.115917 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0832  alpha/beta hydrolase fold  29.5 
 
 		 266 aa  63.2  0.000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2642  alpha/beta hydrolase fold protein  28.16 
 
 		 288 aa  63.2  0.000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.554493  normal  0.31164 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3044  alpha/beta hydrolase fold protein  26.85 
 
 		 278 aa  63.2  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2090  alpha/beta hydrolase fold  27.13 
 
 		 267 aa  63.2  0.000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18201  alpha/beta fold family hydrolase  23.73 
 
 		 304 aa  63.2  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.392562  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0225  alpha/beta hydrolase fold  28.84 
 
 		 272 aa  62.8  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.701432  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  27.8 
 
 		 296 aa  62.8  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2445  alpha/beta hydrolase fold  26.28 
 
 		 340 aa  62.8  0.000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.54824  normal  0.191947 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_15323  predicted protein  24.56 
 
 		 272 aa  62.8  0.000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00155902  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4189  alpha/beta hydrolase fold protein  30.77 
 
 		 281 aa  62.8  0.000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5157  alpha/beta hydrolase fold  27.43 
 
 		 341 aa  62.8  0.000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2916  alpha/beta hydrolase fold protein  27.08 
 
 		 284 aa  62.4  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>