More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2223 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_2223  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 286 aa  568  1e-161  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00980  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  65.48 
 
 		 279 aa  355  3.9999999999999996e-97  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2789  alpha/beta hydrolase fold protein  62.99 
 
 		 300 aa  353  1e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4462  alpha/beta hydrolase fold protein  62.01 
 
 		 277 aa  311  5.999999999999999e-84  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.18079  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0715  alpha/beta hydrolase fold protein  36.59 
 
 		 285 aa  133  3e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.178917 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3041  alpha/beta hydrolase fold protein  34.83 
 
 		 269 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.592764 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0928  alpha/beta hydrolase fold protein  31.6 
 
 		 285 aa  97.1  3e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.911189 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2677  Alpha/beta hydrolase  30.13 
 
 		 315 aa  94.7  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.219797 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2713  alpha/beta hydrolase fold  27.74 
 
 		 315 aa  83.6  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.812736 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1548  alpha/beta hydrolase fold  28.23 
 
 		 287 aa  80.9  0.00000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.133161  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3236  alpha/beta hydrolase fold protein  28.62 
 
 		 308 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00307159  normal  0.0988326 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1736  alpha/beta hydrolase fold  30.72 
 
 		 290 aa  77  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3112  alpha/beta hydrolase fold  25.57 
 
 		 315 aa  77  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.137258  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3036  alpha/beta hydrolase fold protein  29.35 
 
 		 310 aa  74.3  0.000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4215  alpha/beta hydrolase fold  30.32 
 
 		 271 aa  73.6  0.000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0572  alpha/beta hydrolase fold  30.94 
 
 		 266 aa  72.8  0.000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0881  alpha/beta hydrolase fold protein  36.6 
 
 		 307 aa  72.8  0.000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.415782 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4148  alpha/beta hydrolase fold protein  29.18 
 
 		 278 aa  72.4  0.000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0778335  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5788  alpha/beta hydrolase fold protein  27.9 
 
 		 321 aa  72  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2427  alpha/beta hydrolase fold  29.76 
 
 		 278 aa  72  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4002  alpha/beta hydrolase fold  41.82 
 
 		 351 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.228982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4104  putative epoxide hydrolase  43.86 
 
 		 302 aa  70.5  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.526897  normal  0.0962746 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4844  alpha/beta hydrolase fold protein  26.8 
 
 		 308 aa  70.1  0.00000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3967  alpha/beta hydrolase fold  38.84 
 
 		 306 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4400  alpha/beta hydrolase fold  38.84 
 
 		 306 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.334375 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5157  alpha/beta hydrolase fold  28.14 
 
 		 341 aa  69.3  0.00000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  27.65 
 
 		 312 aa  68.9  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18650  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  41.44 
 
 		 350 aa  68.9  0.00000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.303619  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0971  alpha/beta hydrolase fold  27.37 
 
 		 287 aa  68.6  0.0000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.419723 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1002  alpha/beta hydrolase fold  28.26 
 
 		 280 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5546  alpha/beta hydrolase fold protein  29.45 
 
 		 264 aa  67.8  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3150  bromoperoxidase  29.5 
 
 		 278 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.908823  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0723  alpha/beta hydrolase fold protein  36.96 
 
 		 270 aa  67.4  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3828  alpha/beta hydrolase fold protein  27.51 
 
 		 330 aa  67.4  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.792867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1492  alpha/beta hydrolase fold  28.31 
 
 		 291 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0095  alpha/beta hydrolase fold  26.32 
 
 		 305 aa  67.4  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000119942  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6337  alpha/beta hydrolase fold  28.31 
 
 		 291 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1990  alpha/beta hydrolase fold  42.31 
 
 		 308 aa  67.4  0.0000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0448  alpha/beta hydrolase fold  27.82 
 
 		 292 aa  67  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.122113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2561  alpha/beta hydrolase fold  27.37 
 
 		 286 aa  67.4  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0975578  normal  0.452958 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7003  alpha/beta hydrolase fold  28.31 
 
 		 291 aa  67  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00535586 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11967  epoxide hydrolase ephB  39.45 
 
 		 356 aa  66.6  0.0000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.36863  normal  0.493708 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  25.55 
 
 		 265 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1653  chloride peroxidase  26.16 
 
 		 277 aa  66.2  0.0000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3219  alpha/beta hydrolase fold protein  34.19 
 
 		 270 aa  66.6  0.0000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.910977  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2011  alpha/beta hydrolase fold  30.71 
 
 		 298 aa  66.2  0.0000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.404957 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6136  alpha/beta hydrolase fold protein  28.78 
 
 		 294 aa  66.2  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.015637 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0209  alpha/beta hydrolase fold protein  26.53 
 
 		 301 aa  65.9  0.0000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.994667  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0069  alpha/beta hydrolase fold protein  40.62 
 
 		 279 aa  65.5  0.0000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.55127e-28 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2628  non-heme peroxidase, putative  28.41 
 
 		 273 aa  65.5  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4112  alpha/beta hydrolase fold protein  27.59 
 
 		 278 aa  65.1  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.308124  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1579  alpha/beta hydrolase fold protein  27.7 
 
 		 287 aa  65.5  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0299453  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4328  alpha/beta hydrolase fold protein  40.57 
 
 		 324 aa  65.1  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0524  alpha/beta hydrolase fold protein  30.07 
 
 		 308 aa  64.7  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2941  bromoperoxidase  28.62 
 
 		 278 aa  64.3  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2090  bromoperoxidase  29.47 
 
 		 278 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2915  arylesterase (aryl-ester hydrolase)  28.62 
 
 		 278 aa  64.3  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0086  alpha/beta hydrolase fold  39.84 
 
 		 279 aa  64.3  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3165  bromoperoxidase  28.62 
 
 		 278 aa  64.3  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0230592  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3173  bromoperoxidase  28.62 
 
 		 278 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6731  alpha/beta hydrolase fold  26.21 
 
 		 323 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0693  alpha/beta hydrolase fold  23.79 
 
 		 258 aa  64.3  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0259  alpha/beta hydrolase fold protein  29.13 
 
 		 308 aa  64.7  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.951313  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_5003  hypothetical protein  42 
 
 		 305 aa  63.9  0.000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.219261  hitchhiker  0.00420621 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2267  alpha/beta hydrolase fold  42.86 
 
 		 278 aa  63.9  0.000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00239733 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4771  alpha/beta hydrolase fold  28.14 
 
 		 315 aa  63.5  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2854  alpha/beta hydrolase fold protein  28.95 
 
 		 276 aa  63.5  0.000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4857  alpha/beta hydrolase fold  28.14 
 
 		 315 aa  63.5  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3926  alpha/beta hydrolase fold protein  40.82 
 
 		 322 aa  63.5  0.000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.838043  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0474  alpha/beta hydrolase fold protein  27.44 
 
 		 307 aa  63.5  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1083  alpha/beta hydrolase fold  27.94 
 
 		 291 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1479  alpha/beta hydrolase fold protein  27.35 
 
 		 257 aa  63.5  0.000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1433  alpha/beta hydrolase fold  27.35 
 
 		 257 aa  63.2  0.000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3377  alpha/beta hydrolase fold  26.09 
 
 		 273 aa  63.2  0.000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0511  alpha/beta hydrolase fold protein  28.1 
 
 		 311 aa  63.2  0.000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2642  alpha/beta hydrolase fold protein  27.64 
 
 		 288 aa  62.8  0.000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.554493  normal  0.31164 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0107  Alpha/beta hydrolase fold  28.87 
 
 		 286 aa  62.4  0.000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3158  bromoperoxidase  28.78 
 
 		 278 aa  62.4  0.000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00429075  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3625  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 		 274 aa  62.4  0.000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3998  alpha/beta hydrolase fold  38.18 
 
 		 344 aa  62.4  0.000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.260619  normal  0.902376 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2929  alpha/beta hydrolase fold  24.56 
 
 		 287 aa  62.4  0.000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.912564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29750  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  37.82 
 
 		 293 aa  62  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1443  alpha/beta hydrolase fold protein  26.19 
 
 		 293 aa  62  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.384489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4044  alpha/beta hydrolase fold  28.73 
 
 		 310 aa  61.6  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0326  alpha/beta hydrolase fold protein  37.84 
 
 		 311 aa  62  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00559412  normal  0.025641 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4078  alpha/beta hydrolase fold  26.57 
 
 		 267 aa  61.6  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1822  alpha/beta hydrolase fold  26.32 
 
 		 267 aa  62  0.00000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0693506  normal  0.197549 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1078  alpha/beta hydrolase fold protein  26.69 
 
 		 253 aa  61.2  0.00000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  28.88 
 
 		 262 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3092  alpha/beta hydrolase fold protein  40 
 
 		 309 aa  60.8  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000150861 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1144  alpha/beta hydrolase fold protein  39.25 
 
 		 323 aa  61.2  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.273901  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1039  alpha/beta hydrolase fold protein  26.71 
 
 		 277 aa  61.2  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1348  3-oxoadipate enol-lactonase  28.03 
 
 		 256 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.786206 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3157  alpha/beta fold family hydrolase  31.34 
 
 		 266 aa  60.5  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1083  alpha/beta hydrolase fold  27.57 
 
 		 291 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1988  alpha/beta hydrolase superfamily protein  27.18 
 
 		 321 aa  60.8  0.00000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.150126 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1703  alpha/beta hydrolase fold  33.61 
 
 		 502 aa  60.5  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2696  alpha/beta hydrolase fold  26.19 
 
 		 291 aa  60.5  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.498963  decreased coverage  0.00208278 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1033  alpha/beta hydrolase fold  33.11 
 
 		 280 aa  60.1  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0702791 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0198  hydrolase, alpha/beta fold family  26.74 
 
 		 279 aa  60.1  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>