More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_1443 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_1443  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 
293 aa  585  1e-166  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.384489  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4900  alpha/beta hydrolase fold  35.79 
 
 
298 aa  133  3e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000488276 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4425  alpha/beta hydrolase fold  36.16 
 
 
302 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1124  hydrolase/oxidase  26.42 
 
 
292 aa  88.6  1e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.370065  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2354  alpha/beta hydrolase fold protein  29.67 
 
 
279 aa  77  0.0000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0658883  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0234  hypothetical protein  27.02 
 
 
330 aa  73.6  0.000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.833519 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18201  alpha/beta fold family hydrolase  25.62 
 
 
304 aa  71.6  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.392562  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1078  alpha/beta hydrolase fold protein  27.17 
 
 
314 aa  70.5  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.143754 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18171  alpha/beta fold family hydrolase  25.99 
 
 
303 aa  68.6  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47210  alpha/beta fold hydrolase  29.39 
 
 
296 aa  68.6  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18381  alpha/beta fold family hydrolase  25 
 
 
304 aa  68.2  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1701  alpha/beta hydrolase fold protein  27.27 
 
 
303 aa  67.4  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001876  biotin synthesis protein BioH  34.62 
 
 
261 aa  68.2  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4026  alpha/beta hydrolase fold protein  23.97 
 
 
298 aa  67  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1726  alpha/beta hydrolase fold protein  26.89 
 
 
303 aa  66.2  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2186  alpha/beta hydrolase fold  30.23 
 
 
276 aa  66.2  0.0000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000605842  normal  0.0104455 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0627  Alpha/beta hydrolase  26.97 
 
 
289 aa  65.9  0.0000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.355065 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15020  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  30.12 
 
 
297 aa  65.5  0.0000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.232435  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1108  alpha/beta hydrolase fold  28.46 
 
 
246 aa  65.5  0.0000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00367251  hitchhiker  0.00365287 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001619  beta-ketoadipate enol-lactone hydrolase  29.01 
 
 
271 aa  65.1  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00597314  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1728  alpha/beta hydrolase fold protein  26.72 
 
 
294 aa  65.1  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.637652  normal  0.0268844 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9195  alpha/beta hydrolase fold protein  25.91 
 
 
296 aa  64.7  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1174  alpha/beta fold family hydrolase  24.71 
 
 
303 aa  64.7  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1131  bioH protein  35 
 
 
263 aa  64.3  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1453  alpha/beta hydrolase fold  26.72 
 
 
294 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.249841 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3621  alpha/beta hydrolase fold protein  33.09 
 
 
335 aa  64.7  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0448853  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3200  bioH protein  23.74 
 
 
259 aa  64.3  0.000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.111327  normal  0.0170475 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_13371  predicted protein  28.24 
 
 
323 aa  63.9  0.000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.014385  normal  0.0363767 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20491  alpha/beta superfamily hydrolase/acyltransferase  24.71 
 
 
303 aa  64.3  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.79696 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5957  alpha/beta hydrolase fold  31.75 
 
 
296 aa  63.5  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0650876 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0068  alpha/beta hydrolase fold-containing protein  25.37 
 
 
297 aa  62.8  0.000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.392587  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0986  alpha/beta hydrolase fold protein  27.37 
 
 
279 aa  62.8  0.000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.900551 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4707  alpha/beta hydrolase fold  24.91 
 
 
293 aa  62.8  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00298325  normal  0.911417 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0199  carboxylesterase BioH  34.62 
 
 
261 aa  62.8  0.000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.701098  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5550  alpha/beta hydrolase fold  29.55 
 
 
281 aa  62.8  0.000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11862  haloalkane dehalogenase  26.92 
 
 
286 aa  62.4  0.000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.608613 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2642  alpha/beta hydrolase fold protein  36.89 
 
 
288 aa  62.4  0.000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.554493  normal  0.31164 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1736  alpha/beta hydrolase fold  40.62 
 
 
290 aa  62  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03993  putative bioH protein  35 
 
 
269 aa  62  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.39714  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00616  biotin biosynthesis protein BioH  31.71 
 
 
254 aa  62  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1354  alpha/beta hydrolase fold  25.18 
 
 
302 aa  62  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.420067  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7101  alpha/beta hydrolase fold protein  32.41 
 
 
289 aa  61.6  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.974573 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2242  alpha/beta hydrolase fold  25.75 
 
 
301 aa  62  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.545637  normal  0.560868 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1763  alpha/beta hydrolase fold  25.81 
 
 
282 aa  61.6  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.079054  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0318  alpha/beta hydrolase fold  23.97 
 
 
308 aa  62  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3846  hydrolase, alpha/beta fold family  30.36 
 
 
271 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4103  alpha/beta hydrolase fold  26.24 
 
 
301 aa  61.6  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.822842  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00853  hypothetical protein  27.54 
 
 
275 aa  61.2  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0955  alpha/beta hydrolase fold  35.66 
 
 
309 aa  61.2  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17211  alpha/beta superfamily hydrolase/acyltransferase  24.14 
 
 
314 aa  60.8  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.951969 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3924  bioH protein  34.29 
 
 
255 aa  60.8  0.00000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.936  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1721  alpha/beta fold family hydrolase  25 
 
 
304 aa  60.5  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0960045  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2223  alpha/beta hydrolase fold  27.27 
 
 
286 aa  60.5  0.00000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5169  alpha/beta hydrolase fold  29.17 
 
 
281 aa  60.8  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3781  alpha/beta hydrolase fold  24.71 
 
 
293 aa  60.8  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.668878  normal  0.527561 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2270  alpha/beta hydrolase fold  25.93 
 
 
298 aa  60.8  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2806  alpha/beta hydrolase fold protein  26.56 
 
 
284 aa  60.5  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.645937  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5258  alpha/beta hydrolase fold  29.17 
 
 
281 aa  60.8  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.976099  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2740  alpha/beta hydrolase fold  32.26 
 
 
294 aa  59.7  0.00000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0269  hypothetical protein  26.53 
 
 
293 aa  59.7  0.00000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1448  alpha/beta hydrolase fold  27.1 
 
 
294 aa  59.7  0.00000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.358742 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4230  bioH protein  29.66 
 
 
258 aa  59.7  0.00000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.763657  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0253  hydrolase, alpha/beta fold family  25.56 
 
 
270 aa  59.3  0.00000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000360358  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2996  alpha/beta hydrolase fold protein  31.88 
 
 
335 aa  59.3  0.00000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.761802  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3153  alpha/beta hydrolase fold  24.74 
 
 
271 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0769848 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0535  alpha/beta hydrolase fold  26.98 
 
 
298 aa  59.3  0.00000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2524  alpha/beta hydrolase fold  25.91 
 
 
271 aa  58.9  0.00000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.191212  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10077  oxidoreductase  24.31 
 
 
276 aa  58.9  0.00000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.101689 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25921  alpha/beta superfamily hydrolase/acyltransferase  27.15 
 
 
319 aa  58.9  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4967  hydrolase, alpha/beta fold family  25.44 
 
 
270 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3235  alpha/beta hydrolase fold  21.85 
 
 
316 aa  58.9  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.423188  normal  0.602457 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3689  alpha/beta hydrolase fold protein  29.64 
 
 
302 aa  58.5  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0547  twin-arginine translocation pathway signal  31.43 
 
 
356 aa  58.5  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1030  alpha/beta hydrolase fold  21.8 
 
 
280 aa  58.9  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.999949  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0074  alpha/beta hydrolase fold  29.73 
 
 
275 aa  58.9  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1452  hydrolase, alpha/beta fold family  28.7 
 
 
271 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000259756 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3137  alpha/beta hydrolase fold  25.89 
 
 
271 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0771  alpha/beta hydrolase fold protein  26.26 
 
 
312 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17551  alpha/beta fold family hydrolase  26.94 
 
 
303 aa  57.8  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.412462  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4587  hydrolase; menaquinone biosynthesis related protein; prolyl aminopeptidase  25.09 
 
 
270 aa  57.8  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0013  Alpha/beta hydrolase fold  24.37 
 
 
300 aa  57.8  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.798898  normal  0.992459 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0197  alpha/beta hydrolase fold protein  24.22 
 
 
280 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6488  Alpha/beta hydrolase  25.36 
 
 
271 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.642032 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3633  alpha/beta hydrolase fold  30.33 
 
 
315 aa  57.8  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0170844  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0923  alpha/beta hydrolase fold protein  25.59 
 
 
296 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1418  alpha/beta hydrolase fold protein  24.8 
 
 
276 aa  58.2  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.961025  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2200  alpha/beta hydrolase fold protein  32.79 
 
 
278 aa  58.2  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2011  alpha/beta hydrolase fold  29.06 
 
 
298 aa  58.2  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.404957 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0912  alpha/beta hydrolase fold  27.17 
 
 
264 aa  58.2  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1042  alpha/beta hydrolase fold  27.76 
 
 
265 aa  57.8  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3779  alpha/beta fold family hydrolase  28.7 
 
 
271 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.385884  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0950  alpha/beta hydrolase fold protein  25.59 
 
 
296 aa  57.4  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1353  alpha/beta hydrolase fold  23.68 
 
 
339 aa  57.4  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.687878  normal  0.202512 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0185  hypothetical protein  27 
 
 
303 aa  57.4  0.0000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3075  alpha/beta hydrolase fold  25.43 
 
 
267 aa  57  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.260909 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2065  cyclic nucleotide-binding protein  32.35 
 
 
462 aa  57.4  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02030  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  29.63 
 
 
341 aa  57  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4632  bioH protein  34.29 
 
 
264 aa  56.6  0.0000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1554  biotin biosynthesis protein BioH  31.37 
 
 
239 aa  56.6  0.0000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4195  alpha/beta hydrolase fold protein  25.48 
 
 
308 aa  57  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.558809 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>