More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2789 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_2789  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 
300 aa  605  9.999999999999999e-173  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00980  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  69.18 
 
 
279 aa  384  1e-105  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2223  alpha/beta hydrolase fold  62.24 
 
 
286 aa  345  8e-94  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4462  alpha/beta hydrolase fold protein  59.35 
 
 
277 aa  309  2.9999999999999997e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.18079  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0715  alpha/beta hydrolase fold protein  35.38 
 
 
285 aa  133  3.9999999999999996e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.178917 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3041  alpha/beta hydrolase fold protein  33.8 
 
 
269 aa  119  9e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.592764 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0928  alpha/beta hydrolase fold protein  30.63 
 
 
285 aa  94.4  2e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.911189 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5546  alpha/beta hydrolase fold protein  30.8 
 
 
264 aa  82.8  0.000000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2677  Alpha/beta hydrolase  30.03 
 
 
315 aa  77  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.219797 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  29.29 
 
 
262 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  29.09 
 
 
267 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  28.73 
 
 
270 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  25.81 
 
 
265 aa  73.6  0.000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7676  alpha/beta hydrolase fold protein  27.07 
 
 
269 aa  72.4  0.000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  28.42 
 
 
312 aa  72.4  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  28.73 
 
 
270 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0259  alpha/beta hydrolase fold protein  27.7 
 
 
308 aa  72.4  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.951313  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  28.36 
 
 
270 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0572  alpha/beta hydrolase fold  30.11 
 
 
266 aa  70.9  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3219  alpha/beta hydrolase fold protein  28.37 
 
 
270 aa  71.6  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.910977  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2713  alpha/beta hydrolase fold  28.98 
 
 
315 aa  71.2  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.812736 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  26.15 
 
 
296 aa  70.5  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4026  alpha/beta hydrolase fold protein  25.86 
 
 
298 aa  70.5  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  28.36 
 
 
270 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3377  alpha/beta hydrolase fold  28.27 
 
 
273 aa  69.7  0.00000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_15323  predicted protein  29.04 
 
 
272 aa  69.3  0.00000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00155902  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3967  alpha/beta hydrolase fold  42 
 
 
306 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1083  alpha/beta hydrolase fold  27.68 
 
 
291 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4400  alpha/beta hydrolase fold  42 
 
 
306 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.334375 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4844  alpha/beta hydrolase fold protein  27.61 
 
 
308 aa  69.3  0.00000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1548  alpha/beta hydrolase fold  26.07 
 
 
287 aa  68.9  0.00000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.133161  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0672  alpha/beta hydrolase superfamily protein  28.48 
 
 
344 aa  68.9  0.00000000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0529058  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4104  putative epoxide hydrolase  29.29 
 
 
302 aa  68.6  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.526897  normal  0.0962746 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_5003  hypothetical protein  42.57 
 
 
305 aa  68.2  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.219261  hitchhiker  0.00420621 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1033  alpha/beta hydrolase fold  39.67 
 
 
280 aa  68.9  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0702791 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1002  alpha/beta hydrolase fold  29.79 
 
 
280 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3092  alpha/beta hydrolase fold protein  38.21 
 
 
309 aa  68.6  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000150861 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2642  alpha/beta hydrolase fold protein  28.62 
 
 
288 aa  67.8  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.554493  normal  0.31164 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1988  alpha/beta hydrolase superfamily protein  28.85 
 
 
321 aa  67.8  0.0000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.150126 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18650  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  38.94 
 
 
350 aa  68.2  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.303619  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1990  alpha/beta hydrolase fold  39.32 
 
 
308 aa  67.4  0.0000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3182  alpha/beta hydrolase fold  29.39 
 
 
267 aa  67.8  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.44747  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0095  alpha/beta hydrolase fold  25.61 
 
 
305 aa  67.4  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000119942  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0971  alpha/beta hydrolase fold  26.01 
 
 
287 aa  67.4  0.0000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.419723 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1174  alpha/beta fold family hydrolase  27.8 
 
 
303 aa  67  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1736  alpha/beta hydrolase fold  41.67 
 
 
290 aa  66.6  0.0000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  27.08 
 
 
291 aa  67  0.0000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  27.08 
 
 
291 aa  67  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5295  alpha/beta hydrolase fold  27.13 
 
 
267 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  27.08 
 
 
291 aa  67  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1492  alpha/beta hydrolase fold  27.18 
 
 
291 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6337  alpha/beta hydrolase fold  27.18 
 
 
291 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20491  alpha/beta superfamily hydrolase/acyltransferase  27.8 
 
 
303 aa  66.6  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.79696 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7003  alpha/beta hydrolase fold  27.18 
 
 
291 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00535586 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1083  alpha/beta hydrolase fold  27.31 
 
 
291 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0881  alpha/beta hydrolase fold protein  36.97 
 
 
307 aa  66.2  0.0000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.415782 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3243  alpha/beta hydrolase fold protein  38.46 
 
 
270 aa  66.2  0.0000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2532  hypothetical protein  27.03 
 
 
299 aa  66.2  0.0000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.236123  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5788  alpha/beta hydrolase fold protein  26.81 
 
 
321 aa  66.2  0.0000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3621  alpha/beta hydrolase fold protein  25.84 
 
 
335 aa  65.9  0.0000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0448853  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1824  alpha/beta hydrolase fold protein  27.72 
 
 
309 aa  65.9  0.0000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4328  alpha/beta hydrolase fold protein  28.35 
 
 
324 aa  65.5  0.0000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2696  alpha/beta hydrolase fold  25.68 
 
 
291 aa  65.5  0.0000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.498963  decreased coverage  0.00208278 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3112  alpha/beta hydrolase fold  28.96 
 
 
315 aa  65.9  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.137258  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36070  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  26.47 
 
 
313 aa  65.5  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.338915  normal  0.660761 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0837  alpha/beta fold family hydrolase  27.09 
 
 
299 aa  65.1  0.000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2097  alpha/beta hydrolase fold  28.94 
 
 
281 aa  65.1  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.421865  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6440  alpha/beta hydrolase fold  26.07 
 
 
268 aa  65.1  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.200854 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4215  alpha/beta hydrolase fold  28.78 
 
 
271 aa  65.1  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756479  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4002  alpha/beta hydrolase fold  37.3 
 
 
351 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.228982  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3775  Alpha/beta hydrolase fold  25.72 
 
 
273 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0763681  normal  0.29946 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1078  alpha/beta hydrolase fold protein  30 
 
 
314 aa  64.7  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.143754 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3813  alpha/beta hydrolase fold protein  25.43 
 
 
264 aa  64.7  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.580817  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4078  alpha/beta hydrolase fold  28.41 
 
 
267 aa  64.7  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0994  alpha/beta hydrolase fold  27.74 
 
 
285 aa  64.7  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.131767  normal  0.180783 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0013  Alpha/beta hydrolase fold  26.39 
 
 
300 aa  63.9  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.798898  normal  0.992459 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4421  alpha/beta hydrolase fold protein  26.4 
 
 
299 aa  63.9  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1144  alpha/beta hydrolase fold protein  37.7 
 
 
323 aa  63.5  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.273901  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3157  alpha/beta fold family hydrolase  28.83 
 
 
266 aa  63.5  0.000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3236  alpha/beta hydrolase fold protein  40.78 
 
 
308 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00307159  normal  0.0988326 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1259  alpha/beta hydrolase fold  27.97 
 
 
284 aa  63.5  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0524  alpha/beta hydrolase fold protein  28.08 
 
 
308 aa  63.5  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3625  alpha/beta hydrolase fold  26.83 
 
 
274 aa  63.5  0.000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0362  alpha/beta hydrolase fold protein  27.61 
 
 
323 aa  63.5  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.737133 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4334  alpha/beta hydrolase fold protein  34.51 
 
 
278 aa  63.5  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0684332 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2189  3-oxoadipate enol-lactonase  29.32 
 
 
259 aa  63.2  0.000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3036  alpha/beta hydrolase fold protein  36.59 
 
 
310 aa  63.2  0.000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0222  alpha/beta hydrolase fold  30.33 
 
 
308 aa  62.8  0.000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.267301 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0911  alpha/beta hydrolase fold protein  27.62 
 
 
276 aa  62.8  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.139412 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  25.09 
 
 
290 aa  62.8  0.000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1135  putative hydrolase protein  30 
 
 
307 aa  62.8  0.000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1225  alpha/beta hydrolase fold  32.02 
 
 
292 aa  62.4  0.000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.475843  normal  0.369187 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1463  Alpha/beta hydrolase  30.04 
 
 
278 aa  62.4  0.000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.234917  normal  0.480235 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0800  alpha/beta hydrolase fold  27.68 
 
 
267 aa  62.4  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.156653 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3150  bromoperoxidase  29.46 
 
 
278 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.908823  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4828  alpha/beta hydrolase fold-containing protein  26.09 
 
 
301 aa  62  0.00000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2256  alpha/beta hydrolase fold protein  26.01 
 
 
297 aa  62  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11967  epoxide hydrolase ephB  39.62 
 
 
356 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.36863  normal  0.493708 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17211  alpha/beta superfamily hydrolase/acyltransferase  28.72 
 
 
314 aa  61.6  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.951969 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1074  alpha/beta hydrolase fold protein  27.04 
 
 
305 aa  62  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.444129  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>