More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3219 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3219  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 		 270 aa  547  1e-155  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.910977  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5546  alpha/beta hydrolase fold protein  63.16 
 
 		 264 aa  319  3e-86  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2449  alpha/beta hydrolase fold  52.04 
 
 		 279 aa  261  6.999999999999999e-69  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0045755  normal  0.669691 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3061  alpha/beta hydrolase fold  51.09 
 
 		 280 aa  260  2e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0750  alpha/beta hydrolase fold  47.49 
 
 		 281 aa  247  1e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0913521  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0764  alpha/beta hydrolase fold  47.49 
 
 		 281 aa  247  1e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.116226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0744  alpha/beta hydrolase fold  47.49 
 
 		 281 aa  247  1e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.477105  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0974  alpha/beta hydrolase fold  45.56 
 
 		 260 aa  240  2e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5264  alpha/beta hydrolase fold  45.14 
 
 		 258 aa  238  5e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.764514 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10564  peroxidase bpoC (non-haem peroxidase)  47.1 
 
 		 262 aa  236  2e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0807819 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1019  alpha/beta hydrolase fold  44.19 
 
 		 286 aa  217  2e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.154023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1265  alpha/beta hydrolase fold protein  32.25 
 
 		 267 aa  112  9e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.463266  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3171  alpha/beta hydrolase fold protein  30.18 
 
 		 270 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3587  alpha/beta hydrolase fold protein  32.73 
 
 		 296 aa  108  1e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00848755 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3157  alpha/beta fold family hydrolase  30.19 
 
 		 266 aa  101  1e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0263  Alpha/beta hydrolase fold  31.95 
 
 		 266 aa  100  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.191481  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  29.55 
 
 		 264 aa  97.1  3e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0341  alpha/beta hydrolase fold  30.04 
 
 		 265 aa  96.3  5e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0572  alpha/beta hydrolase fold  29.17 
 
 		 266 aa  94  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2732  alpha/beta hydrolase fold  26.64 
 
 		 271 aa  93.6  3e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0446  3-oxoadipate enol-lactonase  28.62 
 
 		 264 aa  92.4  6e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1002  alpha/beta hydrolase fold  27.88 
 
 		 280 aa  91.3  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2294  alpha/beta hydrolase fold  28.36 
 
 		 263 aa  91.3  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.610151 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3377  alpha/beta hydrolase fold  30 
 
 		 273 aa  90.9  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1897  alpha/beta hydrolase fold  30.55 
 
 		 264 aa  90.5  3e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.595115  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0115  alpha/beta hydrolase fold protein  26.64 
 
 		 267 aa  89.4  6e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5984  alpha/beta hydrolase fold  32.52 
 
 		 300 aa  89  8e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0152397 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2443  alpha/beta hydrolase fold  32.1 
 
 		 275 aa  88.6  9e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.752916  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3605  alpha/beta hydrolase fold  26.83 
 
 		 284 aa  88.2  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.753861  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1348  3-oxoadipate enol-lactonase  30.04 
 
 		 256 aa  88.2  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.786206 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0643  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase  26.88 
 
 		 267 aa  87.4  2e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0291  hypothetical protein  25 
 
 		 264 aa  87.8  2e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3725  3-oxoadipate enol-lactonase  26.81 
 
 		 263 aa  87.4  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0511  alpha/beta hydrolase fold protein  29.73 
 
 		 265 aa  87  3e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327319  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1039  alpha/beta hydrolase fold protein  31.14 
 
 		 277 aa  86.3  5e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2222  alpha/beta hydrolase fold  30.15 
 
 		 301 aa  86.3  5e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.801481  normal  0.877247 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0307  hypothetical protein  24.74 
 
 		 264 aa  85.5  8e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0889  lipolytic enzyme  26.71 
 
 		 277 aa  84.7  0.000000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.70416 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13040  3-oxoadipate enol-lactonase  31.44 
 
 		 261 aa  85.1  0.000000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00980  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  30.11 
 
 		 279 aa  84.7  0.000000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1007  3-oxoadipate enol-lactonase  27.82 
 
 		 268 aa  83.6  0.000000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2713  alpha/beta hydrolase fold  26.73 
 
 		 315 aa  84  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.812736 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0843  Alpha/beta hydrolase fold  32.27 
 
 		 272 aa  83.6  0.000000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2677  Alpha/beta hydrolase  28.71 
 
 		 315 aa  82.8  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.219797 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3112  alpha/beta hydrolase fold  28.1 
 
 		 315 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.137258  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3962  3-oxoadipate enol-lactonase  25.84 
 
 		 266 aa  80.1  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.535477  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1857  3-oxoadipate enol-lactonase  28.11 
 
 		 260 aa  79.7  0.00000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.115671  normal  0.0686473 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1656  alpha/beta hydrolase fold  27.5 
 
 		 304 aa  79.7  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4206  3-oxoadipate enol-lactonase  26.6 
 
 		 268 aa  79.3  0.00000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4321  alpha/beta hydrolase fold  28.99 
 
 		 280 aa  79  0.00000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0798376 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3161  3-oxoadipate enol-lactonase  28.06 
 
 		 261 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5285  3-oxoadipate enol-lactonase  28.06 
 
 		 261 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.221975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3245  alpha/beta hydrolase fold  25.81 
 
 		 271 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2189  3-oxoadipate enol-lactonase  31.02 
 
 		 259 aa  78.2  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5020  3-oxoadipate enol-lactonase  28.06 
 
 		 261 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0819  alpha/beta hydrolase fold  29.09 
 
 		 312 aa  78.2  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.897652 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3126  Alpha/beta hydrolase  28.42 
 
 		 261 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1677  alpha/beta hydrolase fold  27.08 
 
 		 356 aa  77.8  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.2178 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2555  alpha/beta hydrolase fold protein  32.06 
 
 		 234 aa  77.8  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.249679  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1595  alpha/beta hydrolase fold  27.82 
 
 		 275 aa  77.4  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.649162  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  28 
 
 		 265 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3210  alpha/beta hydrolase fold protein  30.43 
 
 		 271 aa  77  0.0000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.45774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4474  3-oxoadipate enol-lactonase  27.7 
 
 		 261 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5110  3-oxoadipate enol-lactonase  27.7 
 
 		 261 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5749  3-oxoadipate enol-lactonase  27.7 
 
 		 261 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.74876  normal  0.111233 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0780  alpha/beta hydrolase fold  24.89 
 
 		 276 aa  76.3  0.0000000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0600224  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2523  alpha/beta hydrolase fold protein  27.74 
 
 		 267 aa  75.9  0.0000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.737323 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3171  proline iminopeptidase  29.82 
 
 		 298 aa  75.9  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1548  alpha/beta hydrolase fold  28.87 
 
 		 287 aa  76.3  0.0000000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.133161  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1663  3-oxoadipate enol-lactonase  26.74 
 
 		 263 aa  75.5  0.0000000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0244187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1118  alpha/beta hydrolase fold  26.15 
 
 		 275 aa  74.7  0.000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3959  alpha/beta hydrolase fold  28.32 
 
 		 264 aa  75.5  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.166818 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2306  alpha/beta hydrolase fold  29.21 
 
 		 262 aa  75.1  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0095  alpha/beta hydrolase fold  25.93 
 
 		 305 aa  74.7  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000119942  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8806  hydrolase  30.22 
 
 		 254 aa  74.3  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2629  alpha/beta hydrolase fold protein  27.74 
 
 		 263 aa  73.9  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000794828  hitchhiker  0.00279844 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2375  alpha/beta hydrolase fold protein  28.42 
 
 		 274 aa  74.7  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.153241  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1308  alpha/beta fold family hydrolase  26.53 
 
 		 275 aa  73.9  0.000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.100773  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0148  alpha/beta hydrolase fold  26.91 
 
 		 266 aa  73.6  0.000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.443703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3860  prolyl aminopeptidase  25.21 
 
 		 286 aa  73.9  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.4706  normal  0.0554671 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1090  hydrolase, alpha/beta fold family  27.24 
 
 		 275 aa  73.6  0.000000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1108  alpha/beta hydrolase fold  29.74 
 
 		 246 aa  73.2  0.000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00367251  hitchhiker  0.00365287 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1996  alpha/beta hydrolase fold  26.45 
 
 		 254 aa  73.2  0.000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.507588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2861  hypothetical protein  26.39 
 
 		 306 aa  73.2  0.000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.759766  normal  0.114107 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2292  alpha/beta hydrolase fold  28.62 
 
 		 275 aa  72.8  0.000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.288944 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  25.18 
 
 		 262 aa  72.4  0.000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0037  putative alpha/beta hydrolase  28.52 
 
 		 276 aa  72.4  0.000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4215  alpha/beta hydrolase fold  30.04 
 
 		 271 aa  72.4  0.000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756479  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7714  alpha/beta hydrolase fold protein  30.34 
 
 		 286 aa  72.4  0.000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3228  alpha/beta hydrolase fold protein  27.08 
 
 		 278 aa  72.4  0.000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5939  3-oxoadipate enol-lactonase  25.83 
 
 		 275 aa  72  0.000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.178478 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1384  alpha/beta hydrolase fold protein  26.48 
 
 		 280 aa  71.6  0.00000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.291568  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0560  3-oxoadipate enol-lactonase  26.52 
 
 		 262 aa  71.6  0.00000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.027284  normal  0.123793 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4916  alpha/beta hydrolase fold  27.76 
 
 		 277 aa  71.6  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.503338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2789  alpha/beta hydrolase fold protein  28.37 
 
 		 300 aa  71.6  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2628  non-heme peroxidase, putative  29.29 
 
 		 273 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2061  alpha/beta hydrolase fold  26.26 
 
 		 368 aa  70.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.112445  normal  0.60255 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3847  Alpha/beta hydrolase fold-1  26.26 
 
 		 263 aa  71.2  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0751  alpha/beta hydrolase fold  24.11 
 
 		 270 aa  70.9  0.00000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.158146 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3491  3-oxoadipate enol-lactonase  28.73 
 
 		 262 aa  70.9  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.323872  normal  0.346177 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>