101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_1918 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_1918  alpha/beta hydrolase  100 
 
 		 325 aa  642    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0569  alpha/beta hydrolase  97.54 
 
 		 325 aa  598  1e-170  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1457  alpha/beta hydrolase  73.99 
 
 		 303 aa  446  1.0000000000000001e-124  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4496  alpha/beta hydrolase-like protein  54.79 
 
 		 302 aa  310  2e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0805  alpha/beta hydrolase fold  53.77 
 
 		 302 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.308415  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5485  Alpha/beta hydrolase  52.24 
 
 		 346 aa  301  1e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4634  hypothetical protein  53.8 
 
 		 314 aa  300  2e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2728  hypothetical protein  51.8 
 
 		 336 aa  298  7e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0371718  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2670  hypothetical protein  51.8 
 
 		 417 aa  298  9e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.686285  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4620  alpha/beta hydrolase fold  53.47 
 
 		 300 aa  296  2e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.505321  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0643  hypothetical protein  51.48 
 
 		 336 aa  296  4e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.107821  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2369  hypothetical protein  51.48 
 
 		 336 aa  296  4e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.841526  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2916  hypothetical protein  51.48 
 
 		 336 aa  296  4e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.282253  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1684  hypothetical protein  51.48 
 
 		 336 aa  296  4e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.490109  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1818  hypothetical protein  48.96 
 
 		 473 aa  293  2e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1095  alpha/beta hydrolase fold  52.08 
 
 		 348 aa  294  2e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2091  alpha/beta hydrolase  51.61 
 
 		 352 aa  291  7e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2192  alpha/beta hydrolase  50 
 
 		 346 aa  291  1e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.457111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2214  alpha/beta hydrolase  51.13 
 
 		 357 aa  290  3e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0316  Alpha/beta hydrolase fold  50.33 
 
 		 317 aa  286  4e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.151069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5902  alpha/beta hydrolase  50.33 
 
 		 346 aa  285  9e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.169357  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2175  alpha/beta hydrolase  50.33 
 
 		 346 aa  285  9e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.306533  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0205  alpha/beta hydrolase  42.62 
 
 		 328 aa  228  9e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1984  alpha/beta hydrolase  44.37 
 
 		 327 aa  226  6e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21420  predicted alpha/beta hydrolase  47.71 
 
 		 300 aa  210  3e-53  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1450  alpha/beta hydrolase  88.78 
 
 		 104 aa  176  6e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3462  putative hydrolase  38.06 
 
 		 291 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.339923  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0815  putative hydrolase  39.2 
 
 		 298 aa  173  2.9999999999999996e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4327  alpha/beta hydrolase-like protein  39.58 
 
 		 305 aa  167  2e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3867  alpha/beta hydrolase-like protein  39.51 
 
 		 305 aa  166  4e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.55924 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40820  putative hydrolase  35.89 
 
 		 291 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0596  putative hydrolase  41.18 
 
 		 298 aa  163  4.0000000000000004e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.443892 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1341  putative hydrolase  39.11 
 
 		 300 aa  161  2e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3931  alpha/beta hydrolase-like  38.46 
 
 		 305 aa  159  4e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.269531  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4435  alpha/beta hydrolase-like protein  38.46 
 
 		 305 aa  159  4e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5870  alpha/beta hydrolase-like protein  38.81 
 
 		 305 aa  159  6e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.205699 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1527  alpha/beta hydrolase-like  37.41 
 
 		 305 aa  158  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.114402 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0575  putative hydrolase  41.43 
 
 		 298 aa  151  2e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4709  alpha/beta hydrolase-like protein  36.62 
 
 		 295 aa  143  3e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0396894  decreased coverage  0.00396778 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3632  alpha/beta hydrolase-like protein  36.62 
 
 		 295 aa  143  3e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3029  hypothetical protein  35.09 
 
 		 295 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2079  hypothetical protein  35.29 
 
 		 301 aa  135  7.000000000000001e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.16044 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1265  hypothetical protein  35.09 
 
 		 293 aa  135  8e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00885366  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0605  hypothetical protein  35.09 
 
 		 293 aa  135  8e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1460  alpha/beta fold family hydrolase  35.09 
 
 		 293 aa  135  8e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.93684  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0548  hypothetical protein  35.09 
 
 		 293 aa  135  8e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.491359  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1490  alpha/beta fold family hydrolase  34.53 
 
 		 462 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.679445  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1594  alpha/beta fold family hydrolase  35.36 
 
 		 293 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1464  hypothetical protein  28.92 
 
 		 328 aa  126  6e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1964  hypothetical protein  33.2 
 
 		 291 aa  125  7e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0677628  normal  0.253327 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0438  hypothetical protein  34.88 
 
 		 312 aa  125  8.000000000000001e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.124542 
 
 
-
 
NC_004310  BR0288  hypothetical protein  33.9 
 
 		 290 aa  124  2e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.935727  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0301  hypothetical protein  33.9 
 
 		 290 aa  124  2e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.851897  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2795  hypothetical protein  34.04 
 
 		 293 aa  123  3e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0611315  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1273  hypothetical protein  31.34 
 
 		 296 aa  121  1.9999999999999998e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0496483  hitchhiker  0.00827301 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0808  hypothetical protein  26.47 
 
 		 285 aa  120  3e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00976323  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48210  putative hydrolase  34.44 
 
 		 294 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000506825  normal  0.0564296 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0686  hypothetical protein  30.89 
 
 		 286 aa  109  7.000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0130174 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2212  hypothetical protein  27.27 
 
 		 297 aa  108  2e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.140894 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2873  alpha/beta hydrolase  31.93 
 
 		 291 aa  107  3e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.723814  normal  0.157524 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4058  alpha/beta hydrolase-like protein  30.71 
 
 		 292 aa  106  6e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0427  alpha/beta hydrolase fold  31.48 
 
 		 289 aa  106  7e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00524  alpha/beta hydrolase-like protein  30 
 
 		 288 aa  105  7e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01912  hypothetical protein  31.79 
 
 		 290 aa  103  4e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0709181 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0520  hypothetical protein  26.04 
 
 		 287 aa  103  4e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3610  Alpha/beta hydrolase  30.21 
 
 		 289 aa  102  8e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.830859 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1897  alpha/beta hydrolase-like protein  24.91 
 
 		 321 aa  102  1e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.249943  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0797  putative hydrolase  32.6 
 
 		 330 aa  99.4  7e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47510  putative hydrolase  32.6 
 
 		 279 aa  83.2  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3343  alpha/beta hydrolase-like protein  30.35 
 
 		 306 aa  82.4  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2996  alpha/beta hydrolase-like protein  30.39 
 
 		 306 aa  80.1  0.00000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.983134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1678  hypothetical protein  32.08 
 
 		 284 aa  79.7  0.00000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3956  alpha/beta hydrolase fold  32.25 
 
 		 334 aa  79.3  0.00000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00786101  normal  0.0406632 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3622  alpha/beta hydrolase fold protein  36.59 
 
 		 301 aa  78.6  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1672  alpha/beta hydrolase fold  29.93 
 
 		 288 aa  76.6  0.0000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.324929  normal  0.537045 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2936  alpha/beta hydrolase fold  31.36 
 
 		 317 aa  76.3  0.0000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0681221 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2606  alpha/beta hydrolase  30.97 
 
 		 278 aa  63.2  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.210789  normal  0.690565 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1504  hypothetical protein  28.12 
 
 		 308 aa  58.2  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0349086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2909  hypothetical protein  33.33 
 
 		 284 aa  48.9  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00394962  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1494  alpha/beta hydrolase fold  27.16 
 
 		 326 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0365671  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2687  hypothetical protein  33.33 
 
 		 284 aa  47.4  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.441932  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02426  predicted peptidase  32.48 
 
 		 293 aa  47  0.0005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.643238  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1134  putative enzyme  32.48 
 
 		 284 aa  46.6  0.0005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2686  hypothetical protein  32.48 
 
 		 284 aa  47  0.0005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00504077  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2819  hypothetical protein  32.48 
 
 		 284 aa  47  0.0005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000321727  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1143  putative enzyme  32.48 
 
 		 284 aa  47  0.0005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3766  hypothetical protein  32.48 
 
 		 284 aa  46.6  0.0005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.147795  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02390  hypothetical protein  32.48 
 
 		 293 aa  47  0.0005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.555868  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3679  alpha/beta hydrolase fold protein  24 
 
 		 279 aa  46.2  0.0007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.2542  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2622  hypothetical protein  40.23 
 
 		 312 aa  46.2  0.0008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl474  lysophospholipase  25.6 
 
 		 309 aa  44.3  0.003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0878  hypothetical protein  29.56 
 
 		 334 aa  44.3  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000343609  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1713  alpha/beta hydrolase fold protein  29.52 
 
 		 267 aa  44.3  0.003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1011  hypothetical protein  31.87 
 
 		 329 aa  44.3  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.676735  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2922  putative lipoprotein  25.83 
 
 		 285 aa  43.9  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000434521 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3343  putative lipoprotein  36.36 
 
 		 267 aa  43.9  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.911253  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3810  alpha/beta hydrolase fold  31.16 
 
 		 326 aa  43.5  0.005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0570  alpha/beta hydrolase fold  33.62 
 
 		 315 aa  42.7  0.009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0339831  hitchhiker  0.00000518617 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119577  Protein bem46-like protein  27.94 
 
 		 289 aa  42.7  0.009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.15434  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1494  esterase/lipase/thioesterase family protein  27.57 
 
 		 296 aa  42.4  0.01  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>