74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_0878 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_0878  hypothetical protein  100 
 
 
334 aa  678    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000343609  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1597  alpha/beta hydrolase fold  48.31 
 
 
274 aa  251  8.000000000000001e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2816  alpha/beta hydrolase fold  43.1 
 
 
325 aa  231  9e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1108  alpha/beta hydrolase fold  42.47 
 
 
333 aa  223  4e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.277541 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1043  alpha/beta hydrolase fold  42.47 
 
 
333 aa  223  4e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.791084  hitchhiker  0.00189554 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1047  hypothetical protein  42.47 
 
 
333 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00162551 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1224  hypothetical protein  42.03 
 
 
328 aa  220  3e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3221  alpha/beta hydrolase fold  40.26 
 
 
331 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3222  alpha/beta hydrolase fold  40.59 
 
 
331 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1146  alpha/beta hydrolase fold protein  40.59 
 
 
331 aa  219  7e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000108014 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1033  hypothetical protein  41.87 
 
 
303 aa  218  1e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3360  alpha/beta hydrolase fold  39.93 
 
 
331 aa  216  4e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.110045 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0979  alpha/beta hydrolase fold  41.1 
 
 
325 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0862357 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1008  hypothetical protein  40.99 
 
 
302 aa  207  2e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.884011  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2809  alpha/beta hydrolase fold  41.91 
 
 
308 aa  204  1e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000352126 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3042  alpha/beta hydrolase fold  39.93 
 
 
302 aa  204  2e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3372  alpha/beta hydrolase fold  39.14 
 
 
314 aa  200  3.9999999999999996e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.670411 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3543  alpha/beta hydrolase fold  36.93 
 
 
313 aa  181  2e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0195115 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41650  putative esterase  29.83 
 
 
336 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2086  hypothetical protein  29.17 
 
 
329 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.671906  normal  0.0731474 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3535  esterase/lipase  27.93 
 
 
336 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1601  alpha/beta fold family hydrolase  29.47 
 
 
342 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.925882  hitchhiker  0.00000000109421 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1594  alpha/beta fold family hydrolase  28.28 
 
 
342 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0477038 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1771  lipase, putative  28.62 
 
 
329 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000783432  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2203  alpha/beta hydrolase fold  21.32 
 
 
319 aa  66.6  0.0000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0832977  decreased coverage  0.00859748 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3657  hypothetical protein  27.43 
 
 
342 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.186916  normal  0.561219 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2083  lipase, putative  27.61 
 
 
330 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.826703  normal  0.0145598 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2091  esterase/lipase/thioesterase family protein  26.19 
 
 
329 aa  62.8  0.000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.226093  hitchhiker  0.00381064 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2293  esterase/lipase/thioesterase family protein  26.15 
 
 
330 aa  62.8  0.000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00953151  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4380  alpha/beta hydrolase fold  25.95 
 
 
357 aa  57  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4403  alpha/beta hydrolase fold protein  25.95 
 
 
357 aa  57  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.956683  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1964  hypothetical protein  26.64 
 
 
291 aa  56.2  0.0000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0677628  normal  0.253327 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1956  alpha/beta hydrolase fold  19.34 
 
 
335 aa  53.5  0.000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1241  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class III, PhaC subunit  27.68 
 
 
363 aa  52.8  0.000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4247  Alpha/beta hydrolase fold-1  25.32 
 
 
357 aa  51.2  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.724002  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4847  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.3 
 
 
1152 aa  49.3  0.00009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000971365  normal  0.0494922 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0205  alpha/beta hydrolase  28.38 
 
 
328 aa  48.9  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0575  putative hydrolase  33.33 
 
 
298 aa  48.9  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1816  hypothetical protein  30.53 
 
 
1152 aa  49.3  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.649165 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0596  putative hydrolase  33.33 
 
 
298 aa  48.1  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.443892 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0552  proline-specific peptidase  33.33 
 
 
319 aa  47.8  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.698473 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1457  alpha/beta hydrolase  26.22 
 
 
303 aa  45.4  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2214  alpha/beta hydrolase  33.33 
 
 
357 aa  45.8  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3462  putative hydrolase  29.11 
 
 
291 aa  45.8  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.339923  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0805  alpha/beta hydrolase fold  28.37 
 
 
302 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.308415  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0316  Alpha/beta hydrolase fold  31.39 
 
 
317 aa  45.4  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.151069  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4634  hypothetical protein  26.35 
 
 
314 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4620  alpha/beta hydrolase fold  29.86 
 
 
300 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.505321  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4292  lysophospholipase L2  31.2 
 
 
340 aa  44.7  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4192  lysophospholipase L2  31.2 
 
 
340 aa  44.7  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00143921 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5266  lysophospholipase L2  31.2 
 
 
340 aa  44.7  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.308584 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1028  alpha/beta hydrolase fold  27.83 
 
 
335 aa  45.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.985195 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4183  lysophospholipase L2  31.2 
 
 
340 aa  44.7  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.251713 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4346  lysophospholipase L2  31.2 
 
 
340 aa  44.7  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4049  lysophospholipase L2  31.71 
 
 
340 aa  44.7  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03704  lysophospholipase L(2)  31.2 
 
 
340 aa  44.7  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03653  hypothetical protein  31.2 
 
 
340 aa  44.7  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5485  Alpha/beta hydrolase  24.56 
 
 
346 aa  44.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4154  Lysophospholipase  31.2 
 
 
340 aa  44.7  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0245  lysophospholipase L2  32.08 
 
 
330 aa  44.7  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.200156  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2091  alpha/beta hydrolase  32.69 
 
 
352 aa  44.3  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1918  alpha/beta hydrolase  29.56 
 
 
325 aa  44.3  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0419  alpha/beta hydrolase fold  28.17 
 
 
270 aa  43.9  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2123  Prolyl aminopeptidase  30.69 
 
 
300 aa  43.9  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2581  putative hydrolase  28.7 
 
 
333 aa  43.5  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0543603 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6377  proline-specific peptidase  37.84 
 
 
300 aa  43.1  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.843826  normal  0.494551 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2192  alpha/beta hydrolase  28.68 
 
 
346 aa  43.1  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.457111  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2175  alpha/beta hydrolase  28.68 
 
 
346 aa  43.1  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.306533  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5902  alpha/beta hydrolase  28.68 
 
 
346 aa  43.1  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.169357  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2180  peptidase S33, tricorn interacting factor 1  34.67 
 
 
299 aa  43.5  0.006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1279  Lysophospholipase-like protein  25.57 
 
 
313 aa  43.1  0.006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.725023  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12242  short chain dehydrogenase  27.97 
 
 
592 aa  43.1  0.007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0208017  normal  0.29752 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0569  alpha/beta hydrolase  29.56 
 
 
325 aa  43.1  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2926  alpha/beta hydrolase fold protein  28.57 
 
 
273 aa  42.7  0.009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.557091  normal  0.933948 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>