73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_3657 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_2083  lipase, putative  97.27 
 
 		 330 aa  641    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.826703  normal  0.0145598 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1594  alpha/beta fold family hydrolase  95.03 
 
 		 342 aa  654    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0477038 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3657  hypothetical protein  100 
 
 		 342 aa  686    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.186916  normal  0.561219 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1601  alpha/beta fold family hydrolase  88.89 
 
 		 342 aa  621  1e-177  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.925882  hitchhiker  0.00000000109421 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1771  lipase, putative  73.58 
 
 		 329 aa  483  1e-135  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000783432  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2091  esterase/lipase/thioesterase family protein  74.13 
 
 		 329 aa  476  1e-133  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.226093  hitchhiker  0.00381064 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2293  esterase/lipase/thioesterase family protein  73.27 
 
 		 330 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00953151  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2086  hypothetical protein  65.85 
 
 		 329 aa  437  1e-121  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.671906  normal  0.0731474 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3535  esterase/lipase  66.45 
 
 		 336 aa  427  1e-118  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41650  putative esterase  64.54 
 
 		 336 aa  419  1e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1008  hypothetical protein  27.37 
 
 		 302 aa  94.4  3e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.884011  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3372  alpha/beta hydrolase fold  27.99 
 
 		 314 aa  87  5e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.670411 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2809  alpha/beta hydrolase fold  28 
 
 		 308 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000352126 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0979  alpha/beta hydrolase fold  29.1 
 
 		 325 aa  84.3  0.000000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0862357 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2816  alpha/beta hydrolase fold  26.21 
 
 		 325 aa  84.3  0.000000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1033  hypothetical protein  26.69 
 
 		 303 aa  84  0.000000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1108  alpha/beta hydrolase fold  27.4 
 
 		 333 aa  83.2  0.000000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.277541 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1224  hypothetical protein  27.82 
 
 		 328 aa  82.8  0.000000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1043  alpha/beta hydrolase fold  27.4 
 
 		 333 aa  82.8  0.000000000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.791084  hitchhiker  0.00189554 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1956  alpha/beta hydrolase fold  25.58 
 
 		 335 aa  80.5  0.00000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3221  alpha/beta hydrolase fold  26.96 
 
 		 331 aa  80.1  0.00000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1047  hypothetical protein  26.86 
 
 		 333 aa  79.7  0.00000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00162551 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3360  alpha/beta hydrolase fold  26.76 
 
 		 331 aa  79  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.110045 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3543  alpha/beta hydrolase fold  26.88 
 
 		 313 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0195115 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1146  alpha/beta hydrolase fold protein  27 
 
 		 331 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000108014 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3222  alpha/beta hydrolase fold  27 
 
 		 331 aa  77.8  0.0000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2203  alpha/beta hydrolase fold  24.41 
 
 		 319 aa  75.9  0.0000000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0832977  decreased coverage  0.00859748 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3042  alpha/beta hydrolase fold  26.67 
 
 		 302 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1479  alpha/beta hydrolase fold  26.69 
 
 		 309 aa  72.8  0.000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.940058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1597  alpha/beta hydrolase fold  26.79 
 
 		 274 aa  70.9  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0878  hypothetical protein  27.43 
 
 		 334 aa  65.5  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000343609  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4396  alpha/beta hydrolase fold  27.87 
 
 		 368 aa  65.1  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.375375 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4247  Alpha/beta hydrolase fold-1  28.38 
 
 		 357 aa  64.7  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.724002  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4403  alpha/beta hydrolase fold protein  27.76 
 
 		 357 aa  64.3  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.956683  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4380  alpha/beta hydrolase fold  26.69 
 
 		 357 aa  63.9  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2936  alpha/beta hydrolase fold  29.5 
 
 		 317 aa  60.1  0.00000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0681221 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2613  alpha/beta hydrolase  26.5 
 
 		 270 aa  55.1  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.101876  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5071  alpha/beta hydrolase fold protein  29.59 
 
 		 258 aa  50.8  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.1456  normal  0.556154 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1816  hypothetical protein  34.02 
 
 		 1152 aa  50.4  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.649165 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5902  alpha/beta hydrolase  27.91 
 
 		 346 aa  50.1  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.169357  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2175  alpha/beta hydrolase  27.91 
 
 		 346 aa  50.1  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.306533  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2192  alpha/beta hydrolase  27.91 
 
 		 346 aa  49.7  0.00007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.457111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2728  hypothetical protein  26.23 
 
 		 336 aa  48.1  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0371718  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4847  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.15 
 
 		 1152 aa  47.8  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000971365  normal  0.0494922 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0316  Alpha/beta hydrolase fold  27.97 
 
 		 317 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.151069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1684  hypothetical protein  26.23 
 
 		 336 aa  47  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.490109  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2670  hypothetical protein  25.9 
 
 		 417 aa  47  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.686285  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2916  hypothetical protein  26.23 
 
 		 336 aa  47  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.282253  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2369  hypothetical protein  26.23 
 
 		 336 aa  47  0.0005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.841526  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0643  hypothetical protein  26.23 
 
 		 336 aa  47  0.0005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.107821  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1598  alpha/beta hydrolase fold protein  33.96 
 
 		 328 aa  47  0.0005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00288726 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1818  hypothetical protein  26.33 
 
 		 473 aa  46.6  0.0006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3012  alpha/beta hydrolase fold protein  26.24 
 
 		 257 aa  46.2  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0648  alpha/beta hydrolase fold protein  28.16 
 
 		 226 aa  45.8  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0281045 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1028  alpha/beta hydrolase fold  24.67 
 
 		 335 aa  45.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.985195 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2542  alpha/beta hydrolase fold protein  25.56 
 
 		 310 aa  44.7  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.106613  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0269  alpha/beta fold family hydrolase  29.57 
 
 		 265 aa  45.1  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.699859  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5337  alpha/beta hydrolase fold protein  35.85 
 
 		 264 aa  45.1  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0345321  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5113  glucose-methanol-choline oxidoreductase  33.66 
 
 		 1132 aa  45.1  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.302627  hitchhiker  0.00736765 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3907  alpha/beta hydrolase fold  33.62 
 
 		 294 aa  45.1  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1387  alpha/beta hydrolase fold  21.96 
 
 		 275 aa  45.1  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.062595  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2214  alpha/beta hydrolase  26.28 
 
 		 357 aa  45.1  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5449  alpha/beta hydrolase fold  33.07 
 
 		 272 aa  44.3  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.343862 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5485  Alpha/beta hydrolase  26.12 
 
 		 346 aa  44.3  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2091  alpha/beta hydrolase  25.6 
 
 		 352 aa  43.5  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2666  alpha/beta hydrolase fold  39.22 
 
 		 257 aa  43.5  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0592  alpha/beta hydrolase fold  28.29 
 
 		 288 aa  43.1  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0419  alpha/beta hydrolase fold  37.78 
 
 		 270 aa  43.1  0.007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1715  dienelactone hydrolase  32.65 
 
 		 307 aa  42.7  0.008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.352882  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3995  alpha/beta hydrolase fold  25.24 
 
 		 465 aa  42.7  0.009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1411  alpha/beta hydrolase  35.2 
 
 		 251 aa  42.7  0.009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.731043  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0205  alpha/beta hydrolase  26.8 
 
 		 328 aa  42.7  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7676  alpha/beta hydrolase fold protein  27.82 
 
 		 269 aa  42.7  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>