69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1597 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_1597  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 274 aa  561  1.0000000000000001e-159  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0979  alpha/beta hydrolase fold  47.78 
 
 		 325 aa  252  5.000000000000001e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0862357 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0878  hypothetical protein  48.31 
 
 		 334 aa  251  6e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000343609  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1033  hypothetical protein  46.42 
 
 		 303 aa  246  4e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1043  alpha/beta hydrolase fold  47.84 
 
 		 333 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.791084  hitchhiker  0.00189554 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1047  hypothetical protein  46.76 
 
 		 333 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00162551 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1108  alpha/beta hydrolase fold  47.48 
 
 		 333 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.277541 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3221  alpha/beta hydrolase fold  45.77 
 
 		 331 aa  242  5e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1224  hypothetical protein  45.88 
 
 		 328 aa  240  2e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3222  alpha/beta hydrolase fold  45.42 
 
 		 331 aa  240  2e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2816  alpha/beta hydrolase fold  46.86 
 
 		 325 aa  240  2e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1146  alpha/beta hydrolase fold protein  45.42 
 
 		 331 aa  239  2.9999999999999997e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000108014 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3042  alpha/beta hydrolase fold  48.68 
 
 		 302 aa  239  2.9999999999999997e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3360  alpha/beta hydrolase fold  45.42 
 
 		 331 aa  236  3e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.110045 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1008  hypothetical protein  45.8 
 
 		 302 aa  232  5e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.884011  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2809  alpha/beta hydrolase fold  46.49 
 
 		 308 aa  229  3e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000352126 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3543  alpha/beta hydrolase fold  43.48 
 
 		 313 aa  215  7e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0195115 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3372  alpha/beta hydrolase fold  43.49 
 
 		 314 aa  215  8e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.670411 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2086  hypothetical protein  31.02 
 
 		 329 aa  101  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.671906  normal  0.0731474 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2091  esterase/lipase/thioesterase family protein  31.46 
 
 		 329 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.226093  hitchhiker  0.00381064 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1771  lipase, putative  29.04 
 
 		 329 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000783432  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2293  esterase/lipase/thioesterase family protein  28.21 
 
 		 330 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00953151  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1601  alpha/beta fold family hydrolase  28.68 
 
 		 342 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.925882  hitchhiker  0.00000000109421 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41650  putative esterase  29.15 
 
 		 336 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3535  esterase/lipase  29.7 
 
 		 336 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1594  alpha/beta fold family hydrolase  27.07 
 
 		 342 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0477038 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3657  hypothetical protein  26.79 
 
 		 342 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.186916  normal  0.561219 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2203  alpha/beta hydrolase fold  23.44 
 
 		 319 aa  68.6  0.0000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0832977  decreased coverage  0.00859748 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2083  lipase, putative  26.52 
 
 		 330 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.826703  normal  0.0145598 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3622  alpha/beta hydrolase fold protein  36.84 
 
 		 301 aa  64.3  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4403  alpha/beta hydrolase fold protein  24.07 
 
 		 357 aa  62.8  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.956683  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4380  alpha/beta hydrolase fold  26.44 
 
 		 357 aa  62.4  0.000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2581  putative hydrolase  36.63 
 
 		 333 aa  61.6  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0543603 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4396  alpha/beta hydrolase fold  26.12 
 
 		 368 aa  60.8  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.375375 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4247  Alpha/beta hydrolase fold-1  24.75 
 
 		 357 aa  60.8  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.724002  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1956  alpha/beta hydrolase fold  19.74 
 
 		 335 aa  57  0.0000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00524  alpha/beta hydrolase-like protein  24.7 
 
 		 288 aa  50.1  0.00004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1672  alpha/beta hydrolase fold  44.29 
 
 		 288 aa  47.4  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.324929  normal  0.537045 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2043  alpha/beta hydrolase fold  30.12 
 
 		 347 aa  47  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4327  alpha/beta hydrolase-like protein  28.25 
 
 		 305 aa  47  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2873  alpha/beta hydrolase  24.67 
 
 		 291 aa  46.2  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.723814  normal  0.157524 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1028  alpha/beta hydrolase fold  30.17 
 
 		 335 aa  45.8  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.985195 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48210  putative hydrolase  30.77 
 
 		 294 aa  45.8  0.0008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000506825  normal  0.0564296 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4709  alpha/beta hydrolase-like protein  27.54 
 
 		 295 aa  45.1  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0396894  decreased coverage  0.00396778 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2882  alpha/beta hydrolase fold protein  34.48 
 
 		 309 aa  45.4  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.355624  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3632  alpha/beta hydrolase-like protein  27.54 
 
 		 295 aa  45.1  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40820  putative hydrolase  29.93 
 
 		 291 aa  45.4  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3867  alpha/beta hydrolase-like protein  27.68 
 
 		 305 aa  45.4  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.55924 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1678  hypothetical protein  42.86 
 
 		 284 aa  44.3  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5870  alpha/beta hydrolase-like protein  32.19 
 
 		 305 aa  43.9  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.205699 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2214  alpha/beta hydrolase  30.43 
 
 		 357 aa  43.9  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2034  alpha/beta hydrolase fold  29.41 
 
 		 311 aa  43.5  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4435  alpha/beta hydrolase-like protein  31.51 
 
 		 305 aa  43.5  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3931  alpha/beta hydrolase-like  31.51 
 
 		 305 aa  43.5  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.269531  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1097  alpha/beta hydrolase fold protein  32.29 
 
 		 298 aa  43.1  0.005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4620  alpha/beta hydrolase fold  29.37 
 
 		 300 aa  43.1  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.505321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3610  Alpha/beta hydrolase  25.65 
 
 		 289 aa  43.1  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.830859 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0427  alpha/beta hydrolase fold  26.27 
 
 		 289 aa  43.1  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0088  lysophospholipase  28.18 
 
 		 330 aa  42.7  0.006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0146319 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0643  hypothetical protein  30.71 
 
 		 336 aa  42.4  0.007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.107821  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2795  hypothetical protein  25.93 
 
 		 293 aa  42.4  0.007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0611315  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1684  hypothetical protein  30.71 
 
 		 336 aa  42.4  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.490109  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2670  hypothetical protein  30.71 
 
 		 417 aa  42.7  0.007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.686285  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2916  hypothetical protein  30.71 
 
 		 336 aa  42.4  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.282253  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2369  hypothetical protein  30.71 
 
 		 336 aa  42.4  0.007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.841526  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3462  putative hydrolase  28.47 
 
 		 291 aa  42.4  0.008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.339923  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2728  hypothetical protein  30.71 
 
 		 336 aa  42.4  0.008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0371718  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1816  hypothetical protein  32.63 
 
 		 1152 aa  42.4  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.649165 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0039  alpha/beta hydrolase fold  30 
 
 		 324 aa  42  0.01  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.302219  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>